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简　　历

简历：
博士，现任中国科学院昆明动物研究所生物多样性基因组中心副主任。长期从事高通量基因组分析技术的开发和应用。
学习和工作经历：
2021.01—至今 中国科学院昆明动物研究所生物多样性基因组中心，副主任
2019.01—2020.12中国科学院昆明动物研究所公共技术服务中心，高级工程师
2009.07—2018.12中国科学院昆明动物研究所公共技术服务中心，工程师
2003.09—2009.07 云南大学生命科学学院进化生物学专业硕博连读研究生
1999.09—2003.09云南大学生命科学学院生物科学专业本科学生
研究方向

一、单细胞测序技术的开发。单细胞测序技术是目前最前沿的生物技术之一，目前已建立了一系列单细胞相关前沿技术的开发，包括10X Genomics单细胞技术平台、单细胞ATAC-seq和SPLiT-seq技术。可灵活实现数千至十万个单细胞的基因组、转录组、表观组和免疫组等方面的分析
二、生物多样性检测技术。将DNA条形码技术和二代、三代高通量测序技术进行整合，着力开发生物多样性和传染病监测新技术。同时，针对特殊生物样本（包括复杂的环境样本、高度腐败组织、非脊椎动物内含物、博物馆馆藏及各类历史样本等）的DNA提取技术进行开发、优化。

承担科研项目

1.云南省科技计划项目，跨境生物安全监测与预警体系建设，2021-2023，课题负责人。
2.中国科学院战略性先导科技专项（A类），泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设，2018/03-2023/02, 参与。
3.第二次青藏高原综合科学考察研究，高原动物多样性保护和可持续利用,2019/11-2022/10,参与。
4.中国科学院东南亚生物多样性研究中心区域性国际合作基金项目，基于角蟾科生命之树研究东南亚物种多样性格局的形成，2017/10-2019/10,已结题，参与。
5.农业部转基因生物新品种培育重大专项，动物重要基因克隆与功能验证-基于人工选择作用分析克隆鉴定重要功能基因，2011/07-2015/12，已结题，参与。
6.国家自然科学基金重大项目，动物DNA条形码标准基因及高通量条形码新方法的研究，2011/01-2014/12,已结题，参与。

专家类别


社会任职


获奖及荣誉


代表论著

1.何雨琦，李桂梅，周鑫，李晓璐，高跃东，丁昭莉*， 采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库, 基因组学与应用生物学，2019，第38卷，第7 期，第2990-2995页
2.何雨琦，李桂梅，周鑫，丁昭莉*，2017，用于Illumina 测序平台不同试剂盒制备RNA-seq文库的方法比较，基因组学与应用生物学，第36 卷，第11 期，第4607-4615 页
3.Xunhe Huang#, Guimei Li#, Xing Chen, Yajiang Wu, Weina Li, FushengZhong, Wenzhi Wang, Zhaoli Ding*, Identification of a novel mtDNA lineage B3 in chicken(Gallus gallusdomesticus), Zoological Research, 2017, 38(4): 208-210
4.Xing Chen#, Gang Ni#, Kai He#, Zhao-Li Ding#, Gui-Mei Li, Adeniyi C. Adeola, Robert W. Murphy, Wen-Zhi Wang*, and Ya-Ping Zhang*，Capture Hybridization of Long-Range DNA Fragments for High-Throughput Sequencing, Methods in Molecular Biology，2018，1754:29-44
5.Jiang Liu#, Zhaoli Ding#, Guimei Li#, Li Tang, Yu Xu, HuayouLuo, Jinhua Yi, Youwang Lu, Rui Mao, Qiong Nan, Li Ren, Tong Zhang and Kunhua Wang, Identification and validation of colorectal neoplasia-specific methylation biomarkers based on CTCF-binding sites, Oncotarget, 2017, 8(69): 114183-114194
6.Z-L Ding#, M Oskarsson#, A Ardalan, H Angleby, L-G Dahlgren, C Tepeli, E Kirkness, P Savolainen *and Y-P Zhang*. Origins of domestic dog in Southern East Asia is supported by analysis of Y-chromosome DNA. Heredity ，2012，108:507-514
7.Chunyan Yang#，Kristine Bohmann，Xiaoyang Wang，Wang Cai，Nathan Wales，Zhaoli Ding，Shyam Gopalakrishnan， Douglas W. Yu*，Biodiversity Soup II: A bulk-sample metabarcoding pipeline emphasizing error reduction，Methods in Ecology and Evolution, 2021,00:1-13
8.Hong-Yi Zheng#, Min Xu#, Cui-Xian Yang#, Ren-Rong Tian, Mi Zhang, Jian-Jian Li, Xi-Cheng Wang, Zhao-Li Ding, Gui-Mei Li, Xiao-Lu Li, Yu-Qi He, Xing-Qi Dong*, Yong-Gang Yao* and Yong-Tang Zheng*，Longitudinal transcriptome analyses show robust T cell immunity during recovery from COVID-19，Signal Transduction and Targeted Therapy，2020，Dec 24;5(1):294
9.Nalini Yasoda Hirimuthugoda#, Adeniyi C. Adeola#, Patthamesthrige Wimal Anthony Perera, Xing Chen, Weligalle Wedarallage Dewar Asoka Gunawardena, Humpita Gamaralalage Thilini Nisanka Gunawardana, Tingting Yin, Mingshan Wang, Guimei Li, Zhaoli Ding,Wenzhi Wang, Haibing Xie, Minsheng Peng* and Yaping Zhang*, Sri Lankan pig ancestry revealed by mitochondrial DNA, Y-chromosome, and MC1R, Animal Genetics, 2017, 48, 622–627
10.Shaojun Liu#*, Jing Luo# , Jing Chai# , Li Ren#, Yi Zhou#, Feng Huang# , Xiaochuan Liu#, Yubao Chen , Chun Zhang , Min Tao , Bin Lu, Wei Zhou , Guoliang Lin , Chao Mai, Shuo Yuan, Jun Wang , Tao Li, Qinbo Qin, HaoFeng, KaikunLuo , Jun Xiao, HuanZhong, Rurong Zhao , Wei Duan , Zhenyan Song, Yanqin Wang, Jing Wang, Li Zhong , Lu Wang, Zhaoli Ding, Zhenglin Du, Xuemei Lu, Yun Gao, Robert W. Murphy, Yun Liu , Axel Meyer*, Ya-Ping Zhang*, Genomic incompatibilities in the diploid and tetraploid offspring of the goldfish × common carp cross, PNAS, 2016, 113(5), 1327-1332
11.Zhengkui Zhou#, Yu Jiang#, Zheng Wang#, Zhiheng Gou#, Jun Lyu#, Weiyu Li#, Yanjun Yu, LipingShu, Yingjun Zhao, Yanming Ma , Chao Fang , YantingShen , Tengfei Liu, Congcong Li, Qing Li, Mian Wu , Min Wang , Yunshuai Wu, Yang Dong , Wenting Wan, Xiao Wang, Zhaoli Ding, YuedongGao, Hui Xiang, Baoge Zhu, Suk-Ha Lee, Wen Wang*, Zhixi Tian*, resequencing 302 wild and cultivated accessions identifies genes related to domestication and improvement in soybean, Nature Biotechnology, 2015, 33, 408-414
12.Liang Yan#, Xiao Wang#, Hui Liu , Yang Tian , JinminLian, Ruijuan Yang , ShumeiHao, Xuanjun Wang , Shengchao Yang, Qiye Li, Shuai Qi , Ling Kui , Moses Okpekum, Xiao Ma, Jiajin Zhang , Zhaoli Ding, Guojie Zhang , Wen Wang, Yang Dong*, Jun Sheng*, The Genome of Dendrobiumofficinale Illuminates the Biology of the Important Traditional Chinese Orchid Herb, Molecular Plant, 2015, 8, 922-934
13.Douglas W. Yu#*, YinqiuJi#, Brent C. Emerson, Xiaoyang Wang , Chengxi Ye, Chunyan Yang, Zhaoli Ding, Biodiversity soup: metabarcoding of arthropods for rapid biodiversity assessment and biomonitoring, Methods in Ecology and Evolution, 2012, 3, 613-623
研究团队