原新疆工学院是新疆唯一一所多科性高等工科院校，前身是1953年中苏共同创办的中苏有色金属公司矿山技术学校，1958年7月建成新疆矿冶学院，隶属冶金工业部，1966年更名为新疆工学院。
原新疆大学具有光荣的革命传统。1935年11月，著名的共产党人俞秀松出任新疆学院院长，为学院制定了“以民族为形式，以马列主义为内容”的教育方针，提出了理论联系实际的教育思想。1938—1941年间，林重远、林基路、茅盾、张仲实、萨空了、赵丹、郭春则等一批教育家、艺术家和进步人士，曾先后来学院任教，从而使学院成为新疆传播革命真理的阵地和培养各族进步青年的摇篮。解放后，党和政府十分重视办好新疆学院，周恩来总理对办好新疆学院曾作了重要指示，朱德、董必武等领导来新疆时都亲临学校视察工作，王震同志在任新疆分局书记期间曾多次率领驻疆人民解放军为学校修建校舍，包尔汗、赛福鼎等同志先后任新疆学院院长和新疆大学校长，他们为学校的建设和发展做出了不可磨灭的重要贡献。
1995年江泽民总书记、李鹏总理、李岚清副总理分别为新疆大学亲笔提词。1994年和2000年李岚清副总理先后两次视察学校，多次强调新疆要集中力量办好新疆大学，新疆大学要面向21世纪，建设一流的为新疆经济和社会发展作出重大贡献的大学。解放50年来，学校为国家培养了45000余名各民族专门人才，成为新疆社会主义建设事业人才培养的重要基地。原新疆工学院经过五十年几代人艰苦努力，在党和国家的大力支持下，各项事业得到长足发展，最初建校时的一个“地质勘探”专业，发展成为拥有多专业、多学科的工科院校，成为培养新疆工业建设高级工程技术人才的“摇篮”。解放50年来，学校共培养各类工科高级专门人才20000余名。
2000年12月30日，在李岚清副总理直接关怀下，国家教育部批准了原新疆大学与原新疆工学院合并，新的新疆大学以崭新的面貌昂首迈进了新的世纪。
新疆大学现设有经济与管理学、法学院、外国语学院、数学与系统科学学院、化学与化工学院、生命科学与技术学院、资源与环境科学学院、信息科学与工程学院、机械工程学院、电气工程学院、建筑工程学院、高等职业技术学院、继续教育学院（成人教育学院）等14个学院，有物理学系和纺织工程等2个直属教学系，有社科部、体育部等3个教学部，有现代教育技术中心、理化测试中心、工程训练中心等3个中心，以及经济、干旱生态、数理、人口、应用化学、中亚文学和阿尔泰学、建筑设计等8个研究所，新疆大学的学科门类涵盖文、理、工、法、经、管、史、艺术等61个本科专业，有博士点3个，硕士点46个，以形成了较为完整的多层次教育体系。学校现有4个自治区级重点学科，6个国家“211工程”建设重点学科，1个国家级人文社会科学基地，1个博士后流动站。
在21世纪，新疆大学将立足于新疆的经济建设和社会发展，积极适应国家西部大开发的产业结构调整和经济发展及社会进步对人才的需求；建设具有鲜明的地区特色、民族特色和自身优势，有教育质量、科学研究、管理水平和办学效益等方面达到地方综合性大学先进水平的；在中亚地区有重要影响的；学科门类较为齐全的高层次人才培养、科学研究、科技成果转化的重要基地。
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