基本信息

姓名：张瀚
性别：男
所属部门：自动化与智能科学系、智能工程系
行政职务：智能工程系系主任
职称：教授
学历：博士
所学专业：控制理论与控制工程
办公电话：**
电子邮件：zhanghan@nankai.edu.cn
研究方向：机器学习与数据挖掘、深度学习、生物信息大数据分析与挖掘



个人简介
智能工程系主任， 博士生导师

--2005年毕业于南开大学自动化系,获博士学位
--2009年2月-2010年12月 美国乔治亚大学University of Georgia生物信息研究所 博士后，合作导师 国际著名计算生物学家AAAS Fellow (American Association for Advancement of Science) 徐鹰（Ying Xu）教授.
--2011年6月-2011年8月 美国乔治亚大学(University of Georgia)生物信息研究所 访问****
--2015年6月-2015年9月 美国莱斯大学（Rice University）统计系与电子计算机系 访问****，合作导师 美国统计机器学习专家 NSF CAREER 奖获得者Genevera Allen副教授

在《美国国家科学院院刊》PNAS、Bioinformatics等国际一流期刊上发表多篇论文，目前与美国莱斯大学统计系与电子计算机系、乔治亚大学生物信息研究所、美国贝勒医学院、日本理化学研究所建立了密切的国际科研合作。

从事统计机器学习；深度学习；大数据挖掘方法与应用；生物信息大数据分析的关键技术与算法等方面的研究。
研究室欢迎并招收有志于机器学习、深度学习、数据科学研究的人工智能专业、控制科学与工程专业、运筹学与控制论专业硕士研究生。 有志于读博的同学可以直接邮件联系，近三年研究室国家公派留学联合培养博士生名额充足。

研究室与用友（优普）等著名商业大数据分析公司进行合作，开展商业大数据的挖掘分析领域的研究。

数据智能研究室简介：数据科学与计算智能研究室前身组建于上世纪九十年代，原计算智能与金融系统研究室，研究室曾获国家科技进步三等奖、天津自然科学二等奖等多项国家级、省部级奖励，培养大批信息行业高级人才与行业领军人才，如用友金融公司总经理、软通动力集团助理总裁、国泰君安部门总经理等。近年来专注于数据科学与人工智能的前沿问题研究，在国际一流期刊上刊登多篇研究论文，并与美国莱斯大学、普渡大学、印第安纳大学、日本理化学研究所等高水平研究机构建立紧密的学术联系。部分应用成果为天津北方网报导。
近年来研究室毕业生部分出国前往北卡大学教堂山分校计算机系生物信息系、南加州大学、佐治亚大学计算机系等美国知名院校留学，部分工作于美团网、招商银行软件开发中心、中国证券结算公司、华为、中兴、字节跳动等大型IT或互联网公司。博士毕业生前往国际著名研究机构做博士后。




科研项目、成果、获奖、专利

主持在研项目：
--面向神经疾病的高通量异构组学数据集成分析的关键方法研究，No.** 国家自然科学基金面上项目（负责人）
--智能计算平台子课题，NO.2018YFB** 国家重点研发计划项目，参与人
--国家社科基金重大项目：大数据背景下医患关系的分析与政策研究：18ZDA362（子课题负责人）


已结题项目：
--国家自然科学基金项目海外及港澳****合作研究基金-碳水化合物活性酶家族分类与深度注释的生物信息工具研究和开发:**(中方负责人)
--天津市应用基础与前沿技术研究计划项目: 基于大肠埃希菌的染色体超螺旋折叠边界研究:15JCYBJC18900（负责人）
--国家自然科学基金项目: 基于本体的计算机病毒自适应建模方法研究 项目批准号:** (负责人)
--教育部博士点基金: 复杂网络下基于语义建模的智能病毒防御技术研究,课题号4(负责人)
--天津市自然科学基金: 基于保守混沌系统的密码新理论与新方法研究,项目号:07JCYBJC14700, (负责人)


参与在研项目: 天津市自然科学基金,智能手机病毒传播原理及防治方法研究,项目号：08JCYBJC12800。
已完成项目: 天津市自然科学基金，混沌化理论用于多媒体信息加密的研究（项目批准号:）;


研究室开发重要软件、数据库、服务器最新地址：
GDASC：https://bioinfo.nankai.edu.cn/
DASC: https://github.com/zhanglabNKU/DASC

dbCAN2: http://bcb.unl.edu/dbCAN2/

dbCAN-seq: http://bcb.unl.edu/dbCAN_seq/index.php

eCAMI: https://github.com/zhanglabNKU/eCAMI

pHMM-tree: http://bcb.unl.edu/pHMM-Tree/source/index.php

APIN: https://github.com/zhanglabNKU/APIN

撰写论文、专著、教材等
主要论文：
About Bioinformatics:
1.Xiao Wang, Haidong Yi, Jia Wang, Zhandong Liu, Yanbin Yin, Han Zhang*. GDASC: A GPU parallel based web server for detecting hidden batch factors.Bioinformatics,doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa427. 2020 SCI一区
2.Jing Xu, Han Zhang*, Jinfang Zheng, Philippe Dovoedo, Yanbin Yin Author Notes. eCAMI: simultaneous classification and motif identification for enzyme annotation.Bioinformatics, Volume 36, Issue 7, 1 April 2020, Pages 2068–2075,SCI一区
3.Haidong, Y. , Le, H. , Bowen, Y. , Javi, G. , Han, Z. , & Yanbin, Y. *.Acrfinder: genome mining anti-crispr operons in prokaryotes and their viruses. Nucleic Acids Research. https://doi.org/10.1093/nar/gkaa**.SCI一区，2018影响因子11.561
4. Xin Su, Jing Xu, Yanbin Yin, Xiongwen Quan, Han Zhang*.Antimicrobial Peptide Identification Using Multi-scale Convolutional Network. BMC Bioinformatics,(2019) 20:730,doi.org/10.1186/s12859-019-3327-ySCI二区
5. Wei Li , Yanbin Yin , Xiongwen Quan, Han Zhang*. Gene Expression Value Prediction Based on XGBoost Algorithm. Frontiers in Genetics, 2019,12，SCI二区
6.Han Zhang, Xueting Huo, Xia Guo, Xin Su, Xiongwen Quan, and Chen Jin, A Disease-related Gene Mining Method Based On Weakly Supervised Learning Model，2018 BIBM, regular paper，CCF B类会议.（推荐至BMC Bioinformatics, 2019, 20，SCI二区）
7. Han Zhang, Tanner Yohe, Le Huang, Sarah Entwistle, Peizhi Wu,Zhenglu Yang, Peter Busk, Ying Xu, Yanbin Yin. dbCAN2: a meta server for automated carbohydrate-active enzyme annotation. Nucleic Acids Research(2018 Web Server-Issue), https://doi.org/10.1093/nar/gky418.SCI一区，2018影响因子11.561(新网址http://bcb.unl.edu/dbCAN2/ ) 2019 ESI 0.1% 热点论文，高被引论文
8.Haidong Yi, ayush.raman, Han Zhang*, Genevera Allen,Zhandong Liu*. Detecting hidden batch factors through data adaptive adjustment for biological effects. Bioinformatics ,2017, (通讯作者),doi: 10.1093/bioinformatics/btx635 ,SCI一区，2017影响因子7.307
9.Xue Jiang; Han Zhang; Feng Duan; Xiongwen Quan.Identify Huntington's disease associated genes based on restricted Boltzmann machine with RNA-seq data. BMC Bioinformatics, December 2017, 18:447.
10.Huang, Le; Zhang, Han*; Wu, Peizhi; Entwistle, Sarah ; Li, Xueqiong; Yohe, Tanner ; Yi, Haidong; Yang, Zhenglu; Yin, Yanbin*. dbCAN-seq: a database of carbohydrate-active enzyme (CAZyme) sequence and annotation. Nucleic Acids Research,doi:10.1093/nar/gkx894 , (通讯作者)SCI一区，2018影响因子11.561 （新网址 http://bcb.unl.edu/dbCAN_seq/index.php）
11.Luyang Huo,Han Zhang*,Xueting Huo,Xueqiong Li,Yanbin Yin*. pHMM-tree: Phylogeny of Profile Hidden Markov Models .Bioinformatics ,2017, (通讯作者).doi: 10.1093/bioinformatics/btw779,SCI一区，2017影响因子7.307
12.Yanbin Yin*, Zhang H.*, Olman, V., Xu, Y. (2010) Genomic arrangement of bacterial operons is constrained by biological pathways encoded in the genome. Proc Natl Acad Sci USA 107(14): 6310-6315 PubMed (*equal contribution),《美国国家科学院院刊》,PNAS,并列第一作者, PubMed, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/**,SCI一区,2010年影响因子9.771，检索号035
13.Zhang, H.*, Yanbin Yin*, Olman, V. and Xu, Y. (2012) Genomic arrangement of regulons in bacterial genomes. PLoS ONE, 10.1371/journal.pone.** .
14.Xizeng Mao, Han Zhang, Yanbin Yin, and Ying Xu. The percentage of bacterial genes on leading versus lagging strands is influenced by multiple balancing forces. Nucleic Acids Research, 2012, 1–9 doi:10.1093/nar/gks605，June 26, 2012, SCI一区，2011影响因子8.026
15.Qin Ma, Yanbin Yin, Mark A. Schell, Han Zhang, Guojun Li,and Ying Xu*,Computational analyses of transcriptomic data reveal the dynamic organization of the Escherichia coli chromosome under different conditions,Nucleic Acids Research ,2013, 1–10 doi:10.1093/nar/gkt261,SCI一区，2011影响因子8.026


About computer science and Computation intelligence
1.付垒朋, 张瀚*, 霍路阳.基于多类特征的智能恶意脚本检测算法[J] 《模式识别与人工智能》, 2015,28卷,12期(通讯作者) .
2.张涛, 张瀚*, 付垒朋.基于模糊模式与决策树融合的脚本病毒检测算法[J] 《电子与信息学报》, 2014,V36(1): 108-113(通讯作者) ,EI.
3.Jicai HUANG, Han ZHANG; Bifurcations of periodic orbits in Three-well Duffing system with a phase shift. Journal of Systems Science and Complexity(2011) 24: 519–531,(EI检索源期刊，SCI三区，2010年影响因子0.564)
4.Qing-Hua Zhang, Han Zhang, and Zhao-Hui Li, One-way Hash Function Construction Based on Conservative Chaotic Systems, Journal of Information Assurance and Security ,5 (2010) 171-178
5.Han Zhang, Jicai Huang, Zhaohui Li ,New method of digital image scrambling based on binary tree generated by chaotic sequences,MIPPR 2007 , Processing of SPIE, Vol.6790, 67905D, 2007(EI: )
6.张瀚，王秀峰，李朝晖,刘大海，一种基于时空混沌的Hash函数构造，《物理学报》, Vol.54（9）:4006－4011，2005.9 (EI :,SCI: 960DD).
7.张瀚，王秀峰，李朝晖,刘大海，一种基于混沌系统及Henon映射的快速图像加密算法,《计算机研究与发展》, Vol.42（12）：2137－2142，2005.12. (EI:)
8.Zhang Han, Wang Xiu Feng, Li Zhao Hui, et al.A new image encryption algorithm based on chaos system.Proceedings. 2003 IEEE International Conference on Robotics, Intelligent Systems and Signal Processing (IEEE Cat. No.03EX707) 778-782 vol.2 2003
9.Li Zhao-hui,Wang Xiu-feng,Zhang Han, A Research on Gray Level Mixing Function in Two-Dimensional Chaotic Map Image Encryption, Proceedings of Second International Conference on Image and Graphics , Wei Sui, P93_102, 16-18 August 2002, Hefei, P.R.China. ( EI : )
10.Chao Zuo, Cong Xiong, Han Zhang, Chang Fang, Graph coloring based channel assignment framework for rural wireless mesh networks,Journal of Electronics (China) September 2013 .


指导研究生发表论文：
1. Xue Jiang, Han Zhang*, Xiongwen Quan and Yanbin Yin .A Heterogeneous Networks Fusion Algorithm Based on Local Topological Information for Neurodegenerative Disease.Current Bioinformatics,Vol. 12, No. 5, 2017.SCI.
2. Xue Jiang, Han Zhang* and Xiongwen Quan, Meta-analysis for Feature Selection Based on Gene Co-expression Network, BioMed Research International,2016. SCI.
3. Xue Jiang, Han Zhang, Xiongwen Quan, Disease-related Gene Module Detection Based on A Multi-label Propagation Clustering Algorithm, PLos One,EMID:f06b974a370dae60,2017.SCI.
4. Lingyue Xie, Han Zhang*, Feng Duan. A feature extraction method based on dictionary learning for EEG, 11th International Conference on Natural Computation, ICNC 2015, Zhangjiajie, 2015.8.15-2015.8.17.
5. Xin Su, Bo Zhao, Yi Gong, Han Zhang*. The prediction method for folding boundaries of Escherichia coli chromosome based on multi-source information. Chinese Control Conference (CCC), 2017.
6. Yi Gong, Xin Su, Yu Liang, Han Zhang*. A Biclustering-based Prediction Framework for Folding Boundaries of Escherichia coli Chromosome.The Chinese Automation Congress, cac 2017.
7.张庆华.张瀚基于保守混沌系统的图像加密算法 [期刊论文] -计算机工程与设计2009(10);
8.Wang Xiao-yu Zhang Han Li Zhao-hui, An Improved Baptista Encryption Algorithm Based on Conservative System,978-0-7695-3736-8/09,2009 IEEE,DOI 10.1109/ICNC. 2009.589, 2009 Fifth International Conference on Natural Computation, Volume 5, 442-446, (EI: 816)
9.Tao Wang, Han Zhang,Zhaohui Li andQing-hua Zhang.The Images Encryption Algorithm Based on the Multi-Chaotic Systems, 2009 International Conference on Multimedia Information Networking and Security（MINES 2009）, 978-0-7695-3843-3/09, 2009 IEEE,DOI 10.1109/MINES.2009.233,145-148, (EI :966)
10.Kun Yuan, Han Zhang and Zhaohui Li. An Improvement AES algorithm based on chaos, 2009 International Conference on Multimedia Information Networking and Security（MINES 2009）,978-0-7695-3843-3/09, 2009 IEEE,DOI10.1109/MINES.2009.233 ,326 -329, (EI: 026)
11. Kun Yuan, Wenjie Jia, Han Zhang*, Tao Wang, “Study about the computer virus dissemination model based on complex network”, Seventh International Conference on Natural Computation (ICNC), 2011, Shanghai, China, 1570 -1573.EI: 201**,
12. Leipeng Fu, Tao Zhang, Han Zhang , Zhaohui Li, “A fuzzy classification method based on feature selection algorithm in malicious script code detection”, International Conference on System Science, Engineering Design and Manufacturing Informatization (ICSEM), 2011 , Guiyang, China, 218-221. EI: 201**


授权专利：一种基于本体的计算机病毒分析系统及其特征提取方法 证书号**
C++实验、概率论与数理统计、计算理论、电力电子技术、现代控制理论基础、建模与辨识



社会兼职
中国自动化学会青年工作委员会常务委员
天津运筹学会理事
CCF生物信息组专委
中国人工智能学会生物信息与人工生命专业委员会专委
Journal Reviewer：Bioinformatics、《控制理论与应用》《电子学报》,《通信学报》,《模式识别与人工智能》,《系统工程学报》,《西安交通大学学报》 International Conference Reviewer for BIBM2009，BIBM2010 等·