谢强
性 别:男
职 称:研究员
所属部门:动物生物学和发育生物学系
招生专业:动物学
研究方向:通过生物大分子高级结构、转录组和并行计算等生物信息学方法,改善或加速高级阶元分子系统发育重建
::教师简介::
谢强,2004年毕业于南开大学动物学专业,获理学博士学位。在过去10年中已经完成的高级阶元分子系统发育研究案例,涉及界以上、界、门、纲、目、科等各个级别。目前的研究致力于,以生物大分子(rRNA和蛋白质)高级结构多样性、基因组直同源基因注释、微并行计算等生物信息学方法,改善或加速高级阶元分子系统发育重建,并在可靠的系统发育研究基础上进行分歧时间推断等相关研究,期望藉此推动昆虫系统学与生物信息学、基因组学、结构生物学、古生物学、计算机科学之间形成更为紧密的联系。已经在Bioinformatics, BMC Evol. Biol., BMC Genomics, Cladistics, J Mol. Evol., Mol. Phylogenet. Evol., Mol. Biol. Evol., PLoS ONE, Syst. Entomol., Zookeys等重要期刊发表或被接受SCI论文17篇(截至2015年6月30日累计他引180次以上),H-index=10;其中第一作者、同等贡献第一作者及通讯作者10篇(累计他引97次,单篇最高27次)。代表性出版物:2015. Wang Y-H, Cui Y, Rédei D, Baňa? P, Xie Q*, ?tys P*, Damgaard J, Chen P-P*, Yi W-B, Wang Y, Dang K, Li C-R, Bu W-J. Phylogenetic divergences of the true bugs (Insecta: Hemiptera: Heteroptera), with emphasis on the aquatic lineages: the last piece of the aquatic insect jigsaw originated in the Late Permian/Early Triassic. Cladistics doi: 10.1111/cla.12137 (IF=6.217)2015. Pang S, Stones RJ, Ren M-M*, Liu X-G, Wang G, Xia H-J, Wu H-Y, Liu Y, Xie Q. GPU MrBayes V3.1: MrBayes on graphics processing units for protein sequence data. Mol. Biol. Evol. doi: 10.1093/molbev/msv129. (IF=9.105)2014. Wang Y-H, Xie Q*. The Molecular Symplesiomorphies Shared by the Stem Groups of Metazoan Evolution: Can Sites as Few as 1% Have Significant Impact on Recognizing the Phylogenetic Position of Myzostomida? J Mol. Evol. 79: 63-74. (IF=1.68,他引1次)2014. Li T, Hua J-M, Wright AM, Cui Y, Xie Q, Bu W-J, Hillis DM. Long-branch attraction and the phylogeny of true water bugs (Hemiptera: Nepomorpha) as estimated from mitochondrial genomes. BMC Evol. Biol. 14: 99. (IF=3.368, 他引3次)2013. Wang Y-H?, Engel MS?, Rafael JA?, Dang K, Wu H-Y, Wang Y, Xie Q*, Bu W-J*. A Unique Box in 28S rRNA is Shared by the Enigmatic Insect Order Zoraptera and Dictyoptera. PLOS ONE 8: e53679. (?equal contribution; IF=3.53, 他引17次)2013. Cui Y?, Xie Q?, Hua J-M?, Dang K, Zhou J-F, Liu X-G, Wang G, Yu X, Bu W-J. Phylogenomics of Hemiptera (Insecta: Paraneoptera) based on mitochondrial genomes. Syst. Entomol. 38: 233-245. (?equal contribution; IF=2.55, 他引11次)2013. Yu S-S, Wang Y-H, Rédei D, Xie Q*, Bu W-J*. Secondary structure models of 18S and 28S rRNAs of the true bugs based on complete rDNA sequences of Eurydema maracandica Oshanin, 1871 (Heteroptera, Pentatomidae). Zookeys 319:363-377.(IF=0.92, 他引4次)2012. 谢强, 卜文俊, 于昕, 郑乐怡. 现代动物分类学导论(ISBN 978-7-03-033806-8). 北京: 科学出版社.2012. Xie Q*, Wang Y-H, Lin J-Z, Qin Y, Wang Y, Bu W-J*. Potential Key Bases of Ribosomal RNA to Kingdom-specific Spectra of Antibiotic Susceptibility and the Possible Archaeal Origin of Eukaryotes. PLOS ONE 7: e29468. (IF=3.73, 他引4次)2011. Zhou J-F, Liu X-G*, Stones DS, Xie Q, Wang G. MrBayes on a Graphics Processing Unit. Bioinformatics 27: 1255-1261. (IF=5.468, 他引11次)2011. Xie Q*, Lin J-Z, Qin Y, Zhou J-F, Bu W-J*. Structural diversity of eukaryotic 18S rRNA and its impact on alignment and phylogenetic reconstruction. Protein Cell 2: 161-170. (IF=3.22, 他引5次)2010. 谢强, 卜文俊. 进化生物学(ISBN 978-7-04-028550-5). 北京: 高等教育出版社.2009. Xie Q, Tian X-X, Qin Y, and Bu W-J*. Phylogenetic Comparison of Local Length Plasticity of the Small Subunit of Nuclear rDNAs among All Hexapoda Orders and the Impact of Hyper Length Variation on Alignment. Mol. Phylogenet. Evol. 50: 310-316. (IF=3.556, 他引12次)2008. Hua J-M, Li M, Dong P-Z, Cui Y, Xie Q, and Bu W-J*. Comparative and phylogenomic studies on the mitochondrial genomes of Pentatomomorpha (Insecta: Hemiptera: Heteroptera). BMC Genomics 9: 610. (IF=3.926, 他引49次)2008. Xie Q, Tian Y, Zheng L-Y, and Bu W-J*. 18S rRNA Hyper-elongation and the Phylogeny of Euhemiptera (Insecta: Hemiptera). Mol. Phylogenet. Evol. 47: 463-471. (IF=3.871, 他引27次)2005. Xie Q, Bu W-J*, and Zheng L-Y. The Bayesian phylogenetic analysis of the 18S rRNA sequences from the main lineages of Trichophora (Insecta: Heteroptera:Pentatomomorpha). Mol. Phylogenet. Evol. 34: 448-451. (IF=3.413, 他引16次)任职经历和学术经历2015.01-教育部学位中心论文评审专家2015.01-国家科技专家库在库专家2013.12-南开大学生命科学学院,研究员2013年入选南开大学首批百名青年学术带头人培养计划2012年获得国家自然科学基金委员会首批优秀青年科学基金资助2006.12-2013.12南开大学生命科学学院,副教授2004.7-2006.12南开大学生命科学学院,讲师学术团体国际蝽类昆虫学会(International Heteropterists’ Society)终身会员中国昆虫学会第9届理事会理事、青年工作委员会委员《Zoological Systematics》、《环境昆虫学报》等期刊编委学术报告2014 第5届国际蝽类昆虫学家会议(美国-华盛顿特区),指导的研究生做题为Phylogeny of Hemiptera based on complete nuclear ribosomal DNAs, with emphasis on Heteroptera (Arthropoda: Insecta)的20分钟会议报告,和题为 Different Impacts of the Length Variable Regions of rDNAs on the Phylogenetic Inferences within Hemiptera at Different Category Levels的海报宣讲。2013 中国科学院动物进化与系统学重点实验室学术年会特邀报告“比对、同源、衍征,与高级阶元分子系统发育”。2013 第17届马赛进化生物学年会(法国-马赛),作题为“Multiple Types of Apomorphy Discovered in rDNA-rRNA”的海报宣讲。2012 第6届欧洲半翅目学会会议(保加利亚-布拉格耶夫格勒),作题为“Structural Diversity of the 28S rRNAs of Hemiptera”的海报宣讲。2010 第4届国际蝽类昆虫学家会议(中国-天津),指导的研究生作题为"Research on the secondary structure of LSU nrRNA (28S) of Hemiptera (Hexapoda: Insecta)"的20分钟会议报告。2006 第3届国际蝽类昆虫学家会议(荷兰-瓦赫宁恩),题为”18S rRNA Hyper-elongation and the Phylogeny of Euhemiptera”的20分钟会议报告。获得荣誉2012 欧洲半翅目学会约瑟夫奖(Award in Honor of Michail Josifov),3人之一2009 第四届中国昆虫学会青年科技奖2006 首届国际蝽类昆虫学会安德森奖(Nils M?ller Anderson Award),5人之一获得国家科研投入2013.01~2015.12主持国家自然科学基金优秀青年科学基金项目**,“动物系统学”2010.01~2012.12主持国家自然科学基金面上项目**,“广义半翅目昆虫的线粒体基因组系统发育研究”2007.01~2007.12主持国家自然科学基金青年科学基金项目**,“副新翅类昆虫目级阶元的18S rRNA及线粒体基因组系统发育分析”2010.07~2014.06参加国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目**,“东喜马拉雅与台湾生物区系隔离分化的式样与形成机制——以代表动物为例”课程教学为本科生和研究生讲授《进化生物学》(欢迎通过科学网博客http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=**&do=blog&quickforward=1&id=862118下载教学幻灯片完整版PDF)。
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::主要科研项目::
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南开大学生命科学学院研究生导师简介-谢强
南开大学 免费考研网/2016-02-04
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