段莉莉 教授 院部/部门:物理与电子科学学院 电子邮箱: pig5678@163.com, duanll@sdnu.edu.cn 办公地点: 山东师范大学长清湖校区F540
个人简历
段莉莉,女,博士,教授,原子与分子物理专业博士生导师,山东省优青获得者。2006-2010年在南京大学理论与计算化学研究所从事访问****研究。2010-2012年山东师范大学物电学院,讲师。2012-2017年山东师范大学物电学院,副教授,硕士生导师。2018年-至今,山东师范大学物电学院教授,博士生导师。主要从事生物分子的量化计算和分子动力学模拟研究。在《J. Am. Chem. Soc.》、《Phys. Chem. Chem. Phys.》、《J. Chem. Phys.》、《Appl. Phys. Lett.》、《J. Phys. Chem. B》等国际知名期刊发表SCI论文40余篇,成果得到了国内外同行的广泛关注。其中以第一作者发表的两篇JACS属于本领域顶级TOP期刊 (一区论文,IF: 14.695)。h-index为15。目前主持2项国家自然科学基金面上项目,主持完成了山东省人才基金项目:省属优青、山东省重点研发计划项目、国家自然科学基金青年基金、国家自然科学基金理论物理专款基金、山东省优秀中青年奖励基金、博士后特别资助等10余项课题。
招生方向
硕士研究生招生专业:物理学、原子与分子物理
博士研究生招生专业:物理学、原子与分子物理
研究方向
1.蛋白质与药物相互作用机制及结合自由能计算 2. 生物分子结构和功能的计算模拟 3.蛋白质折叠机理的量子理论计算研究 4.计算机辅助药物设计
科研项目
1. 国家自然科学基金面上项目:(**、2018.01-2021.12)、在研、主持
2. 国家自然科学基金面上项目:(**、2016.01-2019.12)、主持、完成
3. 人才基金-省属优青: (ZR2016JL003、2016.11-2019.11)、主持、完成
4. 山东省重点研发计划项目:主持、完成
5. 国家自然科学基金青年基金:主持、完成
6. 国家自然科学基金理论物理专项:主持、完成
7. 中国博士后特别资助项目:主持、完成
8. 山东省优秀中青年科学家奖励基金:主持、完成
论文成果
发表SCI论文40余篇,引用次数900多次,H指数为15。
代表性论文如下:
?1. Duan L. L.; Liu X.; John Z. H. Zhang, “Interaction Entropy: A New Paradigm for Highly Efficient and Reliable Computation of Protein?Ligand Binding Free Energy”, J. Am. Chem. Soc. 138: 5722-5728. (2016).
?2. Duan L. L.; Mei Y.; Zhang D. W.; Zhang Q.G.; John Z. H. Zhang, “Folding of a Helix at Room Temperature Is Critically Aided by Electrostatic Polarization of Intraprotein Hydrogen Bonds”,J. Am. Chem. Soc. 132(32):11159-11164. (2010).
?3.Duan L. L.*; Feng G. Q.; Wang X. W.; Wang L. Z.; Zhang Q. G., “Effect of Electrostatic Polarization and Bridging Water on CDK2-ligand Binding Affinities Calculated with the Highly Efficient Interaction Entropy Method”, Phys. Chem. Chem. Phys. 19(15):10140-10152. (2017).
?4.Li Y. C.; Cong Y. L.; Feng G. Q.; Zhong S S.; John Z. H. Zhang;Sun H.Y.; Duan L. L,*“The Impact of Interior Dielectric Constant and Entropic Change on HIV-1 Complex Binding Free Energy Prediction”, Struct. Dyn. 5:064101-1-22 (2018).
?5. Zhong S.S.; Huang K.F.; Luo S.; Dong S. H.; Duan L. L.*, “Improving the Performance of the MM/PBSA and MM/GBSA Methods in Recognizing the Native Structure of the Bcl-2 Family using the Interaction Entropy Method”, Phys. Chem. Chem. Phys. 22:4240-4251(2020).
荣誉奖励
1.2011年获山东省优秀博士论文。
2.2013年度获得山东省高等学校优秀科研成果奖一等奖(第一完成人)。
3.2015年度获得山东省高等学校优秀科研成果奖二等奖(第一完成人)。
4.2016年度获得山东省高等学校科学技术奖一等奖(独立完成人)。
5.2020年度获得山东省高等学校科学技术奖一等奖(第一完成人)。
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山东师范大学物理与电子科学学院导师教师师资介绍简介-段莉莉
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