蛋白质是生命体重要组成成分和生命活动的重要执行者,在蛋白质中存在多种非共价相互作用协同工作进而稳定蛋白质结构及实现蛋白质的功能。其中,范德华作用是一种不可忽视的作用力。通常范德华作用可以根据蛋白质中结构参数如侧链基团之间的距离来推断,但是在科学实验中实现定量测量十分困难。 J-耦合常数的检测为研究范德华力提供了新的信息,理论计算方面已有相关报道,但直接的实验检测还未能实现。青岛能源所蛋白质设计研究组研究出一种新的核磁共振方法,通过检测蛋白质甲基基团碳原子与其它脂肪族侧链碳原子之间的跨范德华力的J-耦合常数,首次实现了对蛋白质中范德华作用的定量解析。相关研究成果已发表于Journal of the American Chemical Society杂志上(JACS 2018,140: 3194.)。
该研究以IgG结合蛋白质GB3为研究对象,通过对亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸的甲基进行[13C, 1H]选择性标记(对其它氨基酸进行[13C, 2H]标记),设计HMQC实验脉冲序列,利用其较长的径向弛豫时间来实现磁化矢量从甲基碳原子到脂肪族侧链碳原子上的传递(图1),从而实现跨范德华力的JCC-耦合常数测量(数值在~0.1-0.6 Hz之间)。进一步的量子力学计算表明,跨范德华力的JCC-耦合常数与范德华力的交换互斥力组分正相关(另一重要范德华力组分是色散作用力)。
该工作首次实现了蛋白质跨范德华力的JCC-耦合常数测量,并对其来源机制进行了解析,为证明蛋白质中范德华作用存在提供了直接的实验证据,也为理解分析蛋白质中的非共价作用提供了新思路。
以上研究由青岛能源所蛋白质设计研究组姚礼山研究员主持完成,获得国家自然科学基金的支持,部分实验在中国科学院合肥物质研究院稳态强磁场实验装置中完成。(文/图 李敬文 安辽原)
图1. 蛋白质内部跨范德华力的JCC-耦合常数测量
附录:
Jingwen Li,# Yefei Wang,# Liaoyuan An, Jingfei Chen, and Lishan Yao. Direct Observation of CH/CH van der Waals Interactions in Proteins by NMR, JACS, 2018, 140: 3194-3197.
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
青岛能源所研究人员首次实现了蛋白质中范德华作用的定量解析_青岛生物能源与过程研究所
青岛生物能源与过程研究所 免费考研网/2018-05-01
相关话题/实验 测量 设计 能源 结构
青岛能源所提出结晶纤维素降解新模式_青岛生物能源与过程研究所
纤维素的降解主要依靠细菌和真菌等微生物分泌纤维素酶完成。一般来说,纤维素酶按照其催化功能可分为3大类:外切-β?1,4-葡聚糖酶(exo-β?1,4-glucanases/cellobiohydrolases),内切-β?1,4-葡聚糖酶(endo-β?1,4-glucanases)和β-葡萄糖苷酶 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01青岛能源所在石墨炔基高效储钠电极材料研发取得新进展_青岛生物能源与过程研究所
石墨炔材料是一种唯一能通过低温、常压下合成,同时含有sp和sp2两种杂化形式碳的二维平面全碳材料,是中国科学家在国际上引领的新的研究领域,具有中国知识产权。目前石墨炔已实现了样品的快速宏量制备,及百平方厘米大面积、高质量薄膜的可控制备(图1)。石墨炔具有大共轭体系、优异的导电性能、及优良的化学稳定性 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01双功能小分子的魔术:青岛能源所开发理性设计P450过加氧酶的新策略_青岛生物能源与过程研究所
细胞色素P450单加氧酶(CytochromeP450monooxygenase)是一类在自然界中广泛存在、以亚铁血红素为反应活性中心、以分子氧(O2)为氧化剂的多功能氧化还原酶超家族。P450酶在温和条件下高选择性地催化惰性C-H键羟化、烯烃环氧化、杂原子氧化等多种类型反应,在生物化工、有机合成等 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01石墨炔应用新视角-双重掺杂电子传输层有效提升钙钛矿太阳能电池性能_青岛生物能源与过程研究所
作为继富勒烯、碳纳米管、石墨烯之后,一种新的全碳纳米结构材料,石墨炔具有丰富的碳化学键、大的共轭体系及宽面间距、优良的化学稳定性,被誉为最稳定的一种人工合成二炔碳的同素异形体。石墨炔独特的结构特性,使其与无机纳米粒子、有机聚合物、染料分子等发生相互作用或者键合,表现出独特电子转移增强特性,在信息技术 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01青岛能源所研究人员实现100%光学纯D-乳酸的生物合成_青岛生物能源与过程研究所
D-乳酸作为一种基本有机化工原料,是合成多种手性物质的前体,光学纯度大于98%的D-乳酸在医药、农药、化工等方面具有广泛的应用。以高光学纯D-乳酸为原料聚合而成的聚乳酸材料能够替代普通化工产品聚合而成的塑料、纤维制品,可以应用在高端消费领域:如医用骨内固定物、香烟过滤头、纺织用高级纤维等,此外还是3 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01青岛能源所实现纤维小体原位关键酶的纯化及解析_青岛生物能源与过程研究所
纤维小体是细菌分泌的高效降解木质纤维素的多酶复合体,其高效降解机制及产纤维小体细菌的遗传改造是木质纤维素降解利用研究中的重要方向之一。热纤梭菌的Cel48S是其纤维小体的主要外切葡聚糖酶,是其纤维小体中含量最高的组分,在纤维素降解过程中起着关键作用。但是,Cel48S的内在性质使得对Cel48S的纯 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01青岛储能院在高安全性阻燃隔膜和阻燃电解质领域取得系列进展_青岛生物能源与过程研究所
随着社会的发展和进步,人们日常生活对高能量密度锂离子电池的依赖程度越来越高。但近年来,涉及到锂离子电池燃烧和爆炸的安全事件频发,提高锂离子电池安全性成为科研的重点和热点。在锂电池安全性上,具有可燃性的聚烯烃类隔膜(也易热收缩造成电池短路)和液态有机电解质是商品锂离子电池中最大的安全隐患。因此,开发新 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01青岛能源所在纳米复合光热膜促进水蒸发方面取得新进展_青岛生物能源与过程研究所
近年来,受自然界水循环过程的启发,利用太阳光驱动水蒸发获得清洁淡水受到了人们的广泛关注,该技术有望作为一种应急手段应用在海难、野外求生或欠发达地区个人生存等情况下。在自然蒸发条件下,太阳光的利用率较低,实际蒸发较慢。研究人员尝试将具有良好光吸收和光热转化能力的光热膜材料应用到太阳光驱动蒸发体系中,以 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01蓝细菌光合细胞工厂开发的新视角---工业过程导向的代谢工程(iPOME)_青岛生物能源与过程研究所
当今社会发展正面临着严重的资源短缺和环境污染问题,在此背景下,发展光合生物制造技术,以太阳能和二氧化碳为原料实现生物燃料和生物基化学品的清洁生产成为推动可持续发展的重要选择之一。蓝细菌是一种极具潜力的光合微生物底盘细胞,具有结构简单、生长快速、遗传操作便捷等优势,适宜于光驱固碳细胞工厂的开发。 青 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01青岛储能院在低成本高比能镁/硫电池领域取得阶段性进展_青岛生物能源与过程研究所
随着科技的日益进步,人们对于电池的能量密度和安全性能提出了越来越高的要求,科研人员们正致力于开发更具商业化潜力的下一代电池技术。在诸多新型电池体系中,镁二次电池得到越来越多研究人员的关注。因为镁金属负极具有不生长枝晶、高体积比容量、丰富的地球储量和低成本等诸多优点,所以其在低成本高性能电池领域拥有巨 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2018-05-01