报告题目：实用合成生物学元器件（PracticalSyntheticPartsandDevices ）

报告人：林章凛教授

报告人单位：清华大学化工系

报告时间：2013年7月3日，上午10:00-11:00

报告地点：行政楼214报告厅

主持人：吕雪峰研究员

报告摘要：

报告将涉及近年来我实验室利用蛋白质（基因）分子改造和定向进化发展的三个应用于生物催化和生物炼制的合成生物学元器件。这些包括（1）基于噬菌体裂解基因的大肠杆菌光/热诱导的自裂解元器件，及其在酶进化中的应用案例。（2）基于短肽诱导的活性蛋白聚集体的发现、高效表达纯化元器件（cSAT）的构建，及在多肽药物制备上的应用。（3）基于全局调控蛋白工程的微生物细胞工业条件耐受性改造器件和相关组学研究，并讨论进一步研究思路。同时，报告将简要讨论国际合成生物学最新动态和我国合成生物学规划若干问题。

报告人简历：

林章凛，清华“百人计划”教授，国家973首席科学家（合成生物学领域），工业酶国家工程实验室副主任、工业生物催化教育部重点实验室副主任，教育部2011“先进生物与化学制造协同创新中心”清华大学负责人，第18届ECI“生化工程和分子工程”（BME XVIII, 2013）国际大会分会主席，农工党清华大学支部主委。

教育背景：

化学工程和经济管理双学士（清华大学，1990）

生物化工硕士（马里兰大学，1993），分子生物学博士（马里兰大学&CARB-NIST，1996）博士后（加州理工学院Frances Arnold实验室，1996 - 1999）

实验室研究方向与成果：

（1）酶和微生物细胞工厂的合成生物学元器件设计与应用。2013年获批国家973项目“抗逆元器件构建和机理研究”（首席科学家）。其它项目包括多项国家973、863、国家科技支撑项目、NSFC等多年持续和稳定的资助。

（2）生物制药。包括他汀类化学药物和多肽类生物药物。与跨国公司如帝斯曼、拜耳等有密切的合作。并曾获得江苏省的创业资助。

论文集中发表在Nature、PNAS、Biotechnology Advances、Biotechnology and Bioengineering、Microbial Cell Factories、PLoS ONE等主流刊物。获得重要专利授权6项。

研究工作在国内外产生了良好的影响力，这包括：最近有关蛋白和多肽制备技术相关两篇文章被重要杂志《Microbial Cell Factories》评为“highly accessed”文章；有关微生物基因组“人工重新编程”工作获得良好认可，应邀为重要杂志《Biotechnology Advances》撰写综述；多次应邀在重要国际会议如国际生物技术大会（IBS）、英国Faraday Discussions、美国ECI会议等做报告，为“中日韩酶工程会议”2008/2010/2012年program 主席和大会报告。其它包括：高通量筛选技术相关质粒的国际性商业化；《Protein Engineering Design & Selection》杂志2008年11月封面文章；国际权威“Methods in Molecular Biology”丛书应邀章节等。

多年参与国家有关部门的工业生物技术和产业规划，为我国《合成生物学路线图》规划执笔人之一。与欧阳平凯院士一起组织了具有较大国内影响力的“工业生物技术译著系列”。关注国家产业科技创新，合著有《科技创新与强国之路》，并于近年开始致力于生物制药商业化工作。

代表性论文：

1. Lin, Z., Y. Zhang, J. Wang. Engineering of Transcriptional Regulators Enhances Microbial Stress Tolerance. Biotechnology Advances, 2013. DOI/10.1016/j.biotechadv.2013.02.010 (invited review).

2. Ba, L., P. Li, H. Zhang, Y. Duan, Z. Lin. Semi-Rational Engineering of Cytochrome P450sca-2 in A Hybrid System for Enhanced Catalytic Activity: Insights into the Important Role of Electron. Biotechnology and Bioengineering, 2013. in press.

3. Lin, Z., B. Zhou, W. Wu, L. Xing, Q. Zhao. Self-assembling amphipathic alpha-helical peptides induce formation of active protein aggregates in vivo. Faraday Discussions, 2013, in press (invited contribution)

4. Wang, J., Y. Zhang, Y. Chen, M. Lin and Z. Lin. Global Regulator Engineering Significantly Improved Escherichia coli Tolerances toward Inhibitors of Lignocellulosic Hydrolysates. Biotechnology and Bioengineering, 2012. 109: 3133-3142.

5. Chen, T., J. Wang, L. Zeng, R. Li, J. Li, Y. Chen and Z. Lin. Significant Rewiring of the Transcriptome and Proteome of an Escherichia coli Strain Harboring a Tailored Exogenous Global Regulator IrrE. PLoS ONE, 2012. 7: e37126.

6. Xu, W.H., L. Han and Z.L. Lin. Screening of Random Peptide Library of Hemagglutinin from Pandemic 2009 A(H1N1) Influenza Virus Reveals Unexpected Antigenically Important Regions. PLoS ONE, 2011. 6: e18016.

7. Xing, L., W. Wu, B.H. Zhou and Z.L. Lin, Streamlined Protein Expression and Purification Using Cleavable Self-Aggregating Tags. Microbial Cell Factories, 2011. 10: 42 ("highly accessed").

8. Wu, W., L. Xing, B.H. Zhou and Z.L. Lin. Active Protein Aggregates Induced by Terminally Attached Self-Assembling Peptide ELK16 in Escherichia coli. Microbial Cell Factories, 2011. 10: 9 ("highly accessed").

9. Lin, Z.L. and J. Zheng. Occurrence, Characteristics, and Applications of Fructosyl Amine Oxidases (Amadoriases). Applied Microbiology and Biotechnology, 2010. 86: 1613-1619 (invited review).

10. Chen, Y., S. Li, T.J. Chen, H. Hua and Z.L. Lin. Random Dissection to Select for Protein Split Sites and Its Application in Protein Fragment Complementation. Protein Science, 2009. 18: 399-409.

11. Chen, T.J., J.Q. Zhang, L. Liang, R. Yang and Z.L. Lin. An in vivo, Label-Free Quick Assay for Xylose Transport in Escherichia coli. Analytical Biochemistry, 2009. 390: 63-67.

12. Cai, Z., W.H. Xu, R. Xue and Z.L. Lin. Facile, Reagentless and in situ Release of Escherichia coli Intracellular Enzymes by Heat-Inducible Autolytic Vector for High-Throughput Screening. Protein Engineering Design & Selection, 2008. 21: 681-687 (cover illustration)

13. Joo, H., Z.L. Lin and F.H. Arnold. Laboratory Evolution of Peroxide-Mediated Cytochrome P450 Hydroxylation. Nature, 1999. 399: 670-673.

14. Lin, Z.L. and E. Eisenstein. Nucleotide Binding-Promoted Conformational Changes Release a Nonnative Polypeptide from the Escherichia coli Chaperonin GroEL. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1996. 93: 1977-1981.