删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)

条纹斑竹鲨5个地理群体的简单重复序列中间区域分析

本站小编 Free考研考试/2022-02-12

潘 滢1, 郑利兵1, 王 军1
厦门大学 海洋与地球学院

摘要:
简单重复序列中间区域(inter-simple sequence repeat, ISSR)是一种微卫星类分子标记。为明确条纹斑竹鲨(Chiloscyllium plagiosum)中国群体的遗传多样性和遗传关系, 作者利用ISSR技术对福建厦门(XM)、福建平潭(PT)、广东湛江(ZJ)、海南海口(HK)和台湾(TW)5个土著地理群体的条纹斑竹鲨进行了遗传多样性和遗传关系分析。从56对ISSR引物中筛选出13对多态性引物, 扩增共获得81个重复性的位点, 其中多态性位点57个, 多态位点百分率为70.37%。5个群体的多态位点百分率、Nei’s基因多样性和Shannon’s信息指数分别为38.27%~58.02%, 0.1353~0.2155和0.2032~0.3193。UPGMA聚类分析表明PT 群体首先和XM群体聚类, 再与TW群体聚类, 最后与ZJ群体和HK群体形成的分支聚类, 即形成了与地理距离远近相关的基因交流模式。
关键词:条纹斑竹鲨(Chiloscyllium plagiosum)ISSR遗传多样性地理群体
DOI:10.11759/hykx20170925003
分类号:
基金项目:国家自然科学基金项目(40876080)

Genetic structure analysis of five populations of Chiloscyllium plagiosum using inter-simple sequence repeat molecular markers
PAN Ying,ZHENG Li-bing,WANG Jun
Abstract:
Inter-simple sequence repeat (ISSR) is a molecular marker of microsatellite. In this study, the genetic diversity and the genetic relationship of five native populations of the whitespotted bamboo shark Chiloscyllium plagiosum sampled from Xiamen (XM) and Pingtan (PT) in Fujian, Zhanjiang (ZJ) in Guangdong, Haikou (HK) in Hainan, and Taiwan (TW) were analyzed using the ISSR technique. A total of 13 polymorphic primers were selected from 56 ISSR primers. Using PCR amplification, 81 loci with great reproducibility, including 57 polymorphic loci, were acquired, indicating 70.37% of polymorphic loci. The percentage of polymorphic loci, the Shannon diversity indices, and the Nei’s gene diversity values of the five populations were 38.27%–58.02%, 0.1353–0.2155, and 0.2032–0.3193, respectively. The UPGMA tree constructed using the MEGA5.0 software showed that PT and XM populations clustered together initially and then clustered with TW population and finally joined to the branch clustered by ZJ and HK populations, which resulted in the gene exchange pattern correlating to the geographical distance.
Key words:Chiloscyllium plagiosuminter-simple sequence repeat (ISSR)genetic diversitygeographical populations





PDF全文下载地址:

点我下载PDF
相关话题/遗传 地理 基因 厦门大学 海洋

  • 领限时大额优惠券,享本站正版考研考试资料!
    大额优惠券
    优惠券领取后72小时内有效,10万种最新考研考试考证类电子打印资料任你选。涵盖全国500余所院校考研专业课、200多种职业资格考试、1100多种经典教材,产品类型包含电子书、题库、全套资料以及视频,无论您是考研复习、考证刷题,还是考前冲刺等,不同类型的产品可满足您学习上的不同需求。 ...
    本站小编 Free壹佰分学习网 2022-09-19
  • 刺参GPR54-like受体基因克隆及特征分析
    于秋寒1,平洪领1,2,闫允君1,史会来2,吕振明1,杨静文11.浙江海洋大学海洋科学与技术学院,国家海洋设施养殖工程与技术研究中心;2.浙江省海洋水产研究所摘要:采用cDNA末端快速扩增技术(rapidamplificationofcDNAends,RACE)克隆了刺参GPR54-like(Apo ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 海洋真菌Rhodotorulamucilageinosa
    刘慧1,杨振男1,刘岚1,2,陈碧双1,21.中山大学海洋科学学院;2.中山大学南海资源开发与保护协同创新中心摘要:研究了海洋真菌介导邻-、间-、对-溴苯乙酮的不对称还原反应。具体考察了RhodotorulamucilageinosaGIM2.157对邻-、间-、对-溴苯乙酮的催化活性和对映选择性, ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 中国海洋微塑料污染的研究现状与展望
    王西西1,曲长凤1,2,王文宇1,安美玲1,缪锦来1,21.国家海洋局第一海洋研究所;2.海洋国家实验室海洋药物与生物制品功能实验室摘要:塑料垃圾通过各种途径进入海洋,海洋塑料污染已成为全球性环境问题。本文系统总结了国内外塑料污染的研究历程与现状,发现直接或者间接来源的微塑料在环境中广泛积累,呈全球 ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 海洋动物microRNAs研究进展与展望
    刘小卓1,张晓明1,2,董波1,21.中国海洋大学海洋生命学院;2.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室摘要:MicroRNAs(miRNAs)是一类小分子非编码RNA,通过特异性结合靶基因,对靶基因转录后表达进行调控。miRNAs参与众多生物学过程并发挥关键调控角色。作者介绍 ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 量子无线通信技术在海洋环境监测中的应用
    李浩1,任宇辉1,刘凤娇21.西北大学信息学院;2.福建省现代分离分析科学与技术重点实验室,闽南师范大学摘要:以量子技术为基础,利用光子基本粒子的量子纠缠原理,由量子态携带在线实时海洋环境监测数据信息,构建基于量子无线通信的海洋环境监测系统。该系统在无线通信中可确保数据的安全性、系统性、及时性和准确 ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 斑节对虾GPx3a基因的分子克隆及表达分析
    刘伟1,2,赵超1,范嗣刚1,王鹏飞1,闫路路1,邱丽华11.中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室;2.上海海洋大学水产与生命学院摘要:谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathioneperoxidase,GPx)是生物体内重要的抗氧化酶,能防止过氧化氢对生物体的氧化应激 ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 基于LoRa的海洋多功能信标组网及特性研究
    綦声波1,张峰1,姚鹏1中国海洋大学工程学院摘要:针对目前海洋观测网络通信距离、功耗、复杂度、抗干扰能力、成本之间的矛盾,提出了一种基于LoRa(longrange)的海洋多功能信标组网观测系统。通过运用新型的LoRa调制技术,采用星型链路网络对多功能信标进行组网设计,并结合北斗通信,构建了一套覆盖 ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 第十二届全国高校地理学联合野外实习闭幕-鲁东大学新闻网
    8月4日,由全国地理学联合野外实习教学联盟主办、我校资源与环境工程学院与山东高校地理G5联盟承办的第十二届全国高校地理学联合野外实习在曲阜闭幕。我校校长王庆教授出席会议并讲话。北京大学城市与环境学院王红亚教授,教育部教学指导委员会委员、北京联合大学应用文理学院院长张宝秀教授分别致辞。来自39所高校的 ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • 第12届全国高校地理学联合野外实习开幕式在鲁东大学举行-鲁东大学新闻网
    7月29日,由全国地理学联合野外实习教学联盟主办,山东高校地理G5联盟成员单位联合承办的主题为“海岱儒风行·百年新征程”第12届全国高校地理学联合野外实习开幕式在我校学术中心举行。教育部高等学校地理学教学指导委员会副主任、全国地理学联合野外实习教学联盟理事长、华东师范大学郑祥民教授作动员报告。教育部 ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12
  • Huffman与LZW算法在海洋观测浮标通信数据压缩中的应用研究
    胡斌1,李忠强1,刘婷婷1,王瀚宇1国家海洋局北海海洋技术保障中心摘要:在现有两种比较主流无损压缩算法基础上(Huffman算法和LZW算法),根据海洋观测浮标采集的观测数据特点,比较两种压缩算法的优缺点,并通过布放在西太平洋海域的一套观测浮标数据进行数据验证。结果表明,使用Huffman算法和LZ ...
    本站小编 Free考研考试 2022-02-12