邓子新 讲席教授

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邮箱：zxdeng@sjtu.edu.cn
实验室网址：http://mml.sjtu.edu.cn/
长期从事微生物代谢的分子生物学研究，主攻放线菌遗传学及抗生素生物合成的化学生物学。研究领域涉及DNA复制调控、限制和修饰系统，微生物代谢途径，代谢工程及次级代谢产物的生物化学，非天然抗生素药物创新的基因工程等。在DNA骨架上发现了硫修饰，并系统地研究了DNA硫修饰发生的生物化学机





学术经历
中国科学院院士（Member，CAS），第三世界科学院院士（Fellow，TWAS），美国微生物科学院院士（Fellow，AAM）。现担任微生物代谢国家重点实验室主任，中国微生物学会理事长, 中国农业生物技术学会副理事长，国际工业微生物遗传学组织专家委员会（GIM-IC）主席。现任美国《ACS Chemical Biology》副主编，《CELL Chemical Biology》, 《Applied & Environmental Microbiology》等数十个国内外刊物编委。
1982年获华中农业大学学士学位，毕业后留校任助教，1987年获英国University of East Anglia博士学位，在英国John Innes 研究中心做博士后一年；1988，1991，1992年先后在华中农业大学始任讲师、副教授、教授；1993年遴选为博导；2000年始任上海交通大学教授。


中国科学院院士（Member，CAS），第三世界科学院院士（Fellow，TWAS），美国微生物科学院院士（Fellow，AAM）。现担任微生物代谢国家重点实验室主任，中国微生物学会理事长, 中国农业生物技术学会副理事长，国际工业微生物遗传学组织专家委员会（GIM-IC）主席。现任美国《ACS Chemical Biology》副主编，《CELL Chemical Biology》, 《Applied & Environmental Microbiology》等数十个国内外刊物编委。
1982年获华中农业大学学士学位，毕业后留校任助教，1987年获英国University of East Anglia博士学位，在英国John Innes 研究中心做博士后一年；1988，1991，1992年先后在华中农业大学始任讲师、副教授、教授；1993年遴选为博导；2000年始任上海交通大学教授。





研究方向

DNA硫修饰生物学



微生物次级代谢产物的生物合成






DNA硫修饰生物学


微生物次级代谢产物的生物合成






研究方向


DNA硫修饰生物学 DNA硫修饰生物学




微生物次级代谢产物的生物合成 微生物次级代谢产物的生物合成











代表论著
? Zhang Y, Zou Y, Brock NL, Huang T, Lan Y, Wang X, Deng Z, Tang Y, Lin S. Characterization of 2-Oxindole Forming Heme Enzyme MarE, Expanding the Functional Diversity of the Tryptophan Dioxygenase Superfamily. J Am Chem Soc. 2017 Aug 30;139(34):11887-11894. doi: 10.1021/jacs.7b05517. Epub 2017 Aug 15.

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? Gao G, Liu X, Xu M, Wang Y, Zhang F, Xu L, Lv J, Long Q, Kang Q, Ou HY, Wang Y, Rohr J, Deng Z, Jiang M, Lin S, Tao M. Formation of an Angular Aromatic Polyketide from a Linear Anthrene Precursor via Oxidative Rearrangement. Cell Chem Biol. 2017 Jul 20;24(7):881-891.e4. doi: 10.1016/j.chembiol.2017.06.008. Epub 2017 Jul 14.

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? Yang Y, Xu G, Liang J, He Y, Xiong L, Li H, Bartlett D, Deng Z, Wang Z, Xiao X. DNA Backbone Sulfur-Modification Expands Microbial Growth Range under Multiple Stresses by its anti-oxidation function. Sci Rep. 2017 Jun 14;7(1):3516. doi: 10.1038/s41598-017-02445-1.

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? Zheng X, Cheng Q, Yao F, Wang X, Kong L, Cao B, Xu M, Lin S, Deng Z, Chooi YH, You D. Biosynthesis of the pyrrolidine protein synthesis inhibitor anisomycin involves novel gene ensemble and cryptic biosynthetic steps. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Apr 18;114(16):4135-4140. doi: 10.1073/pnas.. Epub 2017 Apr 3.

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? Xu Z, Wang Y, Chater KF, Ou HY, Xu HH, Deng Z, Tao M. Large-Scale Transposition Mutagenesis of Streptomyces coelicolor Identifies Hundreds of Genes Influencing Antibiotic Biosynthesis. Appl Environ Microbiol. 2017 Mar 2;83(6). pii: e02889-16. doi: 10.1128/AEM.02889-16. Print 2017 Mar 15.

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? Wang Y, Tao Z, Zheng H, Zhang F, Long Q, Deng Z, Tao M. Iteratively improving natamycin production in Streptomyces gilvosporeus by a large operon-reporter based strategy. Metab Eng. 2016 Nov;38:418-426. doi: 10.1016/j.ymben.2016.10.005. Epub 2016 Oct 13.

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? Li N, Wang H, Li L, Cheng H, Liu D, Cheng H, Deng Z. Integrated Approach To Producing High-Purity Trehalose from Maltose by the Yeast Yarrowia lipolytica Displaying Trehalose Synthase (TreS) on the Cell Surface. J Agric Food Chem. 2016 Aug 10;64(31):6179-87. doi: 10.1021/acs.jafc.6b02175. Epub 2016 Jul 29.

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? Xu M, Wang Y, Zhao Z, Gao G, Huang SX, Kang Q, He X, Lin S, Pang X, Deng Z, Tao M. Functional Genome Mining for Metabolites Encoded by Large Gene Clusters through Heterologous Expression of a Whole-Genome Bacterial Artificial Chromosome Library in Streptomyces spp. Appl Environ Microbiol. 2016 Sep 16;82(19):5795-805. doi: 10.1128/AEM.01383-16. Print 2016 Oct 1.

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? Huang T, Li L, Brock N, Deng Z, Lin S. Functional Characterization of PyrG, An Unusual NRPS Module from Pyridomycin Biosynthetic Pathway. Chembiochem. 2016 May 20. doi: 10.1002/cbic.. [Epub ahead of print]

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? Wang H, Li L, Zhang L, An J, Cheng H, Deng Z. Xylitol production from waste xylose mother liquor containing miscellaneous sugars and inhibitors: one-pot biotransformation by Candida tropicalis and recombinant Bacillus subtilis. Microb Cell Fact. 2016 May 16;15:82. doi: 10.1186/s12934-016-0480-0.

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获奖情况
获得国家自然科学二等奖（2008）、上海市（2004）和农业部科技进步一等奖（1994）、教育部自然科学一等奖(2015)、二等奖(2007)、“瑞典国王Baudiouin奖”(1997)等。蝉联2005、2006年中国高校十大科技进展和环球科学2007全球十大科学新闻。1990年以来，相继被授予国家级有突出贡献的专家(1991)、霍英东基金会青年教师奖(1991)、首届“中国青年科学家奖”提名奖(1993)、首届国家****科学基金奖(1994)、“中国青年科技奖”(1994)、上海市十大科技创新英才(2005)、上海市科技领军人物(2006)、上海市劳动模范(2007)、全国五一劳动奖章(2008)、全国先进工作者(2010)、何梁何利奖（2012）、谈家桢生命科学成就奖（2017）等。