将深度学习或神经网络运用于研究自然语言或其它学科时，首先需要对涉及的一些概念（词或物理实体）进行恰当的、充分地表征。过去，人们大多采用静态热点表征（One-Hot Encoding）或向量表征(Vector Representation)，此两种表征方式虽可描述概念的特征，却不能反映环境对其属性之影响，亦不能体现概念的功能。
“我常在想，大脑是不是真的用一个静态的向量来表达概念与物理实体呢？我觉得不一定，比如我们说自行车时，这个概念本身它应该自带‘构造’，另外它跟环境有关系。在不同光线下其形象应该是有差别的。因此，我们想把概念的表示从向量提升成算符，做个升级。”李剑锋表示。
据此想法，团队创造性地提出用算子表示概念的思想。具体而言，即用一个个子神经网络来表示一个个物理实体：网络的输入相当于物理实体所处的环境，网络的输出表示在此环境下物理实体展现的物理属性。
物理实体所处的环境再由其它实体的物理属性联合决定，通过这种自洽迭代形成物理属性与环境的强关联，从而极大地提高神经网络预测的准确性。该方法目前被运用于HP蛋白质模型的预测与反向设计中，取得良好的效果。研究团队发现，新方法特别适合解决涉及简并度的问题。
