复旦大学影像医学系以影像医学·核医学二级学科为主体, 并在原上海医科大学影像医学中心的基础上发展而成。其影像医学·核医学1997成为教育部“211工程”重点建设项目。影像医学系主要由中山、华山两个医院的放射科、核医学科、超声诊断科所组成。系主任现为冯晓源教授，博士生导师，华山医院放射科主任，华山医院副院长；系副主任现为曾蒙苏教授，博士生导师，中山医院放射科副主任。

　　 复旦大学影像医学·核医学是教育部重点学科，其主要研究方向为：神经系统疾病和功能的诊断、小肝癌的诊断和治疗。先后承担各类课题，包括国家自然基金、卫生部和IAEA等共12项，发表论文300余篇，获得省部级科技进步一等奖2项，省部级科技进步二等奖3项，省部级科技进步三等奖5项。现有博士点、硕士点各一个，博士导师8名（林祥通、周康荣、沈天真、冯晓源、王建华、陈绍亮，耿道颖，曾蒙苏）。

　　 在学校和所在医院的大力支持下，影像医学硬件设备得到及时更新和升级。现拥有功能性3.0T MRI、多排CT、PET-CT等代表目前国际先进水平的影像设备。为进一步科研和临床工作跟踪国际水平创造了良好的条件，亦为医学科学研究提供了新的实验手段。

　　 在承担众多科研任务的同时，影像医学系同样承担繁重的教学和医疗工作。目前我系每年承担复旦大学研究生、本科生以及专生本12-16班级的大课和示教的教学任务。另外中山和华山医院放射科、核医学科、超声三科检查的年工作量均分别占全市三级医院影像检查总工作量的10％以上。上海市卫生局先后成立核医学、放射学和超声医学质量控制中心均挂靠在我系，对全市质量进行监控，制订质量标准，对全市本学科的质量保证作出贡献。