本学科由著名眼科教育家、一级教授郭秉宽创始于1952年，是我国最重要的三大眼科教学基地之一。从这里走出了十余位全国眼科学术带头人，如嵇训传、陈淑初、王文吉、胡诞宁等教授。本科为上海市眼科质量控制中心挂靠单位，1997-2000年卫生部临床重点科室，2001年国家重点学科。目前拥有眼科医生58名、研究生53名，其中博士生导师5名，正副教授35名。全科综合实力强劲，在玻璃体视网膜疾病、青光眼、眼表疾病和眼库、白内障、视光学、眼肿瘤和眼病理等诱导领域处于国内领先地位。系主任楮仁远教授是中华眼科学会常委， 中华医学会上海分会眼科学会主任委员，卫生部近视眼重点实验室主任，是中国近视眼遗传，接触镜矫正及激光手术的首先实践和推行者之一。本学科还有知名教授孙兴怀，徐格致，卢奕等，均为中外闻名的眼科专家。
　　目前本专业培养研究生已获博士学位29名，在读博士生22名。承担国家级继续教育项目：玻璃体视网膜手术，近视眼的临床防治和激光手术，青光眼的诊治进展。
　　本专业完成863及卫生部重点临床项目各1项，获国家专利2项。96----2000年国内外发表论文202篇，Medline统计国内收录量中排名第二。“复杂性视网膜玻璃体手术中全氟萘烷的应用研究”获中国高校科技进步二等奖；“国产板层角膜成形系统实验和临床研究”获上海市科技进步三等奖；2001年，“人工晶状体记忆支架环” 获国家专利局授权专利；“人类视网膜变性中感光细胞的凋亡”获上海市科技进步三等奖；“一种眼科用微型角膜切割器”获上海市实用新型专利三等奖。此外，本科在角膜移植、青光眼、视网膜脱离、玻璃体手术、人工晶体植入术、肿瘤病理、中西医结合等方面，都做出了一定的成绩。