实验室概况
本实验室最早进行人类分子群体遗传及人类基因组学、多基因病相关基因研究，现在逐渐增加研究方向，除了以上两方面的研究之外，还进行生物信息学、多基因病结构功能、古代DNA多态性、人类学、微生物分子遗传学等多方面的研究。 
实验室设备
ABI Prism? 3100 Genetic Analyzer 1台：可进行测序，利用毛细管技术，通量大，灵敏度高
荧光仪 Berthold Technologies Twinkle LB 970 1台：可进行多种酶反应，或底物浓度的测定
HIMAC CR22E 1台：冷冻高速离心，容量是50mL
上海复日紫外呈像系统 1台：紫外凝胶呈像
TL-16R 台式高速冷冻离心机 2台：96孔板离心
SPEX 6750 Certiprep Freezer/Mill 1台：液氮温度下的样品粉碎
ABI Prism? 9600,2700等PCR仪七台：PCR扩增
实验室组成
教
授一人：金力
兼职教授一人：卢大儒
副教授一人：金建中
助研：谭婧泽
技术员一人：王玲娥
博士生6人，硕士生4人
（2002年）
培养研究生人数
年度 | 在培人数 | 毕业人数 | ||
博士生 | 硕士生 | 博士生 | 硕士生 | |
1999 | 2 | 4 | 0 | 0 |
2000 | 4 | 5 | 1 | 2 |
2001 | 7 | 4 | 1 | 2 |
2002 | 6 | 7 | 1 | 3 |
研究项目
我实验室几年来对东亚
人群的起源、进化和迁徙开展了较为深入的研究，在这一领域奠定了重要的国际地位，从1998年至今，每年都在国际权威刊物当发表论文。现将这些研究的主要成果按年份概述如下。
@中国人非洲起源的发现
1998年，第一篇系统的采用现代遗传标记研究中国人群的遗传关系的文章发表在PNAS上。这篇文章利用30个微卫星标记分析了28个中国人群的遗传结构，观察到南北中国人群之间的遗传差异，认为中国北方人群可能具有双重起源。多态性分析和系统聚类分析支持现代中国人群来源与非洲，并经过东南亚进入中国大陆。
@计算中国的人类定居年代
1999年，我们利用Y染色体对东亚人群的史前迁徙进行了更为精细的描述。我们采用了Y染色体上19个单核苷酸多态标记对30个东亚人群925个男性个体进行了单倍型分析。结果表明，南方人群的单倍型多样性高于北方人群，北方人群拥有的单倍型在南方人群中均有发现，而一些单倍型只在南方出现；东亚特异的单倍型H6、H7、H8共享一个突变M122-C，用Y染色体上的微卫星标记估计该突变大约发生在6万年前。结合中国缺乏5-10万年前古人类化石的考古学证据，我们认为现代人从东南亚进入东亚大陆南方的时间大约在6万年前的末世纪冰川期间，随着向北的大迁徙，逐渐在北方和西伯利亚定居。
@台湾与波利尼西亚的关系
2000年我们发表了3篇关于东亚及太平洋地区人群迁徙和遗传关系的文章。其中一篇文章从父系遗传的角度探讨了玻利尼西亚人群的起源。玻利尼西亚人群起源最流行的观点是“快车模型”，认为台湾土著是现代玻利尼西亚人群的祖先；而我们对Y染色体的研究却得到了不同的结论：台湾人群和玻利尼西亚人群是分别从东南亚独立迁徙过去的。
@汉族和藏缅语族的近缘关系
第二篇文章关于藏族的起源，东亚起源的M122-C和可能是中亚起源的YAP+在藏族人群中都具有比较高的频率，我们据次认为藏族具有双重起源，一支来自中亚，另一支来自东亚。第三篇文章探讨了汉藏语系群体之间的遗传关系，几乎所有的汉藏语系群体都具有较高频率的M122-C，提示他们有较近的共同祖先,喜马拉雅地区包括藏族在内的藏缅语族民族都具有高频率的M122下的突变M134（单倍型为H8），表明他们曾经经历了很强的瓶颈效应，通过与考古学证据相互对照，我们猜想现在汉语语族和藏缅语族的共同祖先约2-3万年前携带M122-C到达黄河中上游地区，并于大约1万年前创造了以种植粟为特征的新石器文化，汉藏语系的2个语族大约5000-6000年前分开，其中一支东迁成为现代汉族的祖先，另一支向西南迁徙，逐渐演化成藏缅语族的各个群体。
@大规模搜索非非洲起源东亚人群
Underhill等人的研究表明，在他们观察的1000多个非洲以外的个体中均带有一个共同的突变M168，而非洲人的这个位点是多态的。M168下分为3个支系M1、M130和M89，如果所有东亚人群都来自非洲，那么所有的个体均带有以上3个突变的其中之一；如果当地智人对现存人群的基因库作出贡献，则预期有一些个体不能观察到以上的3个突变。为了进一步证实东亚人群非洲起源的真实性以及检测当地智人对现存东亚人群的可能贡献，我们对分布于亚太地区的163个群体12127个个体进行了Y染色体上3个位点的单倍型分析。结果显示所有的个体均带有以上3个突变之一，这个结果表明，从父系遗传的角度看，当地智人并没有对现存的东亚人群做出贡献，这是支持东
亚人群非洲单一起源的强有力遗传学证据。这一工作的研究报告发表到2001年5月的Science周刊上。
@北方新疆等地的人群的来源
对中国北方汉族、蒙古族、维吾尔族、哈萨克族、保安族等作大规模遗传调查，发现这些族群中东亚血统都占绝对多数。都属于蒙古人种，且遗传结构向贵重呀人群有更大内部共性。
@苗瑶族群的遗传结构和瑶族通史的协助编辑
我们协助广西瑶学会，参与国家民委重大计划瑶族通史的编辑，多全国瑶族进行大规模采样和分析。虽然一些文献比较系统的讨论了东亚人群的遗传关系及群体结构, 但对苗瑶系统人群的研究还远不够深入。本研究利用PCR-RFLP技术，对来自于23个苗瑶系人群的684个样品进行了13个Y-SNP的基因分型。在东亚及亚太地区存在17种Y染色体单倍型，我们在苗瑶人群中观察到9种。其中带有M122突变的三种单倍型（H6-H8）的频率为45%， 带有M95突变的2种单倍型（H11-12）的频率为21.5%。前者在汉藏系统人群中的频率最高（47.1%）， 而后者则广泛分布于侗台系统民族（平均频率35.7%）。这一频率分布格局显示苗瑶系统人群的父系遗传结构具有双重特质。单倍型频率的主成分分析支持以上的观察：苗瑶系统人群在主成分分布图上连接了汉藏和侗台人群，并有部分群体与其交错分布。该结果提示苗瑶系统人群在父系遗传结构上与汉藏和侗台两个系统均有比较密切的联系，这和历史记载相一致。
分子数据的方差分析（AMOVA）表明，苗瑶与藏缅系统人群之间的差异最小（1.2%），汉族次之（2.3%），而与侗台（4.5%）和阿尔泰（5.3%）则差异较大（p值均小于0.01）。当单独考察苗族和瑶族，苗族与藏缅的差异不显著（1023次非参数列阵检验，p=0.13），可能与三苗集团与炎黄集团的接触有关。在苗瑶族群内部，布努与苗族群体的差异相当小（-0.9%，p=0.58），而与瑶族群体的差异则相对较大（2.7%，p=0.07），我们的遗传学观察与语言学的分类是一致的。
带有M7突变的H7单倍型在大部分苗瑶人群中均有分布（平均频率6%），而在其它人群中则极其罕见，显示出强烈的群体特异性。我们进一步对H7的个体进行了5个Y染色体上短重复序列（Y-STR）的分型。利用Y-STR单倍型构建的网络表明苗瑶系统的H7位于中心，而客家人和土家族等人群的H7则位于旁支。提示苗瑶人群的H7更为古老，是发散中心。用5个Y-STR重复数的方差估计M7发生的年代至少在10300-11800年之前，这一估计可为苗瑶系统祖先群体的分化时间提供参照。
@百越族群的遗传结构研究
对国内60多个百越族群收集了样本，分析遗传结构，发现H9,H10,H11,H12都是百越族群的特征型。在我们研究过的百越族群中根据特征单倍型对比，发现基本可以分为5组。第1组，黎族、壮族、布依族，有较稳定的H11、H12，H9频率则依次降低，代表从广东到贵州的迁徙。第2组，东北泰（老族）－傣组，有稳定的H12，其他种类依次减少，代表向西南部的迁徙。第3组，印度阿霍姆，仅有H10，可能坎梯等族也在此组。第4组，侗－仫组，有稳定的H10，H9逐次加强，H11渐少，代表从广东到江西和浙江的迁徙。第5组，水－毛组，有稳定的H11，水族的H9在毛南族丢失了。这些信息在民族学、语言学等领域肯定会有深刻的意义。
金力教授主持课题
国内:
1. 原发性高血压的综合遗传学研究
973项目, 编号39825509
2. 云南省隔离群体遗传资源调查与研究
编号:CNC2000M1
3. 中国人基因组SNP单倍型图谱构建及其开发应用
973项目
国外:
1: Early Natural of Arteriosclerosis: The Bogalusa Heart Study
NIH/NHLBI, 2 R01 HL38844-11A1, 07/11/97 – 06/30/02
2: Construction and Application of a U.S. Admixture Map
NIH/NHGRI, 1R01 HG02154-01, 09/24/99 – 05/31/02
3: Identifying Genes for Hodgkin’s Disease Using Candidate DNA Microsatellites
NIH R03 CA85135-01, 07/16/99 – 06/30/02
4: Case Control Study of Hodgkin’s Disease in Children
NIGMS 2R01CA47473-08, 09/01/99 – 06/30/04
5: Effects of Population Mixtures on Genetic Variation
NIH/NHLBI, 2 R01 GM41399-08A1, 07/01/98 – 06/30/03
6: Family Studies of the Genetics of Ankylosing Spondylitis
NIAMS R01 AR46208-01, 07/01/99 – 06/30/04
7: Evaluation of Single Nucleotide Polymorphism (SNP’s) for Human Identification NIJ, 98 LB VX-0010, 09/01/98 – 08/31/00
8: Genetic History in East Asia.
NSF. 08/01 – 08/04
9: Scleroderma Family Registry and DNA Repository
NIH-NIAMS-00-003, 07/01 – 06/06
科研经费：
1.国家自然科学基金委重大项目（参与）
中华民族基因组结构与功能研究
2.国家重点基础研究发展规划项目（973）（参与）
疾病基因组学理论和技术体系的建立
3.国家高技术研究发展计划（863）（主持）
中国人基因组SNP单倍型图谱构建及其开发应用
4.国家重点基础研究发展规划项目（973）（主持）
5.国家高技术研究发展计划重大专项（863）（参与）
6.上海市科学技术委员会
原发性高血压相关基因的结构与功能的研究
获奖情况
金力教授先后获得NIH医学遗传学博士后培训计划奖学金、德克萨斯-休斯顿大学公共健康院杰出研究奖，并多次获得Texas大学优秀学者奖,以及李氏基金杰出青年科学家、国家教委杰出青年研究者、国家教委科技进步二等奖以及上海市政府白玉兰奖等。
全部论文
1. Ke Y, Su B, Song X, Lu D, Chen L, Li H, Qi C, Marzuki S, Deka R, Oefner P, Underbill PA, Xiao C, Shriver MS, Lell J, Wallace D, Wells RS, Seielstad M, Zhu D, Huang W, Chakraborty R, Chen Z, Jin L. 2001. African origin of modem humans in East Asia: A tale of 12,000 Y chromosomes. Science 292:1151-1153.
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3. Ke YH, Su B, Li HY, Chen LF, Qi CJ, Guo XJ, Huang W, Jin JZ, Lu DR, Jin L. 2001. Y-chromosome evidence for no independent origin of modem human in China. Chinese Science Bulletin 46: 935-937.
4. Ke YH, Su B, Xiao JH, Chen H, Huang W, Chen Z, Chu JY, Tan JZ, Jin L., Lu DR. 2001. Y-chromosome haplotype distribution in Han Chinese populations and modem human origin in East Asians. Science In China Series C-Life Sciences 44: 225-232.
5. Wu H, Wang H, Li H, Akey J, Xiao FY, Ke YH, Xu HY, Xiao J, Lu DR, Parra E, Shriver M, Xiong MM, Barton SA, Hewett-Emmett D, Liu WD, Jin L. 2001. Skin Reflectance in the Han Chinese and Tibetan Populations. Human Biology 73: 461-466
6. Xiao J, Hu F, Xu H, Jiang Y, Luo J, Zhang W, Qiu X, Xue J, Tan CC, Jin L. 2000. Provincial distribution of three HIV-1 resistant polymorphisms (CCR5-Delta32, CCR2-64I, and SDFl-3"A). Science in China Series C-Life Sciences 43:16-20.
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15. Su B, Xiao J, Underbill P, Deka R, Zhang W, Akey J, Huang W, Shen D, Lu D, Luo J, Chu J, Tan J, Shen P, Davis R, Cavalli-Sforza LL, Chakraborty R, Xiong M, Du R, Oefner P, Chen Z, Jin L. 1999. Y chromosome evidence for a northward migration of modem humans in East Asia during the last Ice Age. American Journal of Human Genetics 65: 1718-1724.
16. Su B, Jin L, Xiao J, Hu F, Zhang W, Lu D, Luo J, Chu J, Du R, Geng Z, Qiu X, Xue J, Tan CC, O"Brien SJ, Chakraborty R. 1999. Distribution of Two HIV-1 Resistant Polymorphisms (SDFl-3"A and CCR2-64I) in East Asia and World Populations and Its Implication in AIDS Epidemiology. American Journal of Human Genetics 65: 1047-1053.
17. Su B, Chakraborty R, JinL, Xiao J, Lu D. 1998. An HIV-resistant allele is exceptionally frequent in New Guinean highlanders. Journal of American Medical Association (JAMA) 280:1830
18. He X, Chu S, Jin L, Xiong M, Wang G, Zhuang Q, Liu X, Zhao Y, Huang Wei, Zhu D. 2001. a-adducine gene and essential hypertension in Chinese, Clin Exp Hypertens (In Press).
19. Zhao JY, Wang H, Xiong MM, Huang W, Zuo J, Chen Z, Qiang BQ, Sun Q, Li YX, Liu QY, Du WN, Chen JL, Ding W, Yuan WT, Zhao Y, Xu HY, Jin L, Fang FD. 2000. The localization of type 2 diabetes susceptibility gene loci in Northern Chinese Han families. Chinese Science Bulletin 45:1792-1795
20. Zhu DL, Wang HY, Xiong MM, He X, Chu SL, Jin L, Wang GL, Yuan WT, Zhan Y, Zhao GS, Boerwinkle E, Huang W. 2001. Linkage of hypertension to chromosome 2ql4-23 in Chinese families. J Hypertension 19:55-61.
21. Hacia JG, Fan J-B, Ryder 0, Jin L, Edgemon K, Ghandour G, Mayer RA, Sun B, Hsie L, Robbins CM, Brody LC, Wang D, Lander ES, Lipshutz R, Fodor SPA, Collins FS. 1999. Determination of ancestral alleles for human single-nucleotide polymorphisms using high-density oligonulceotide arrays. Nature Genetics 22:164-167.
22. Chakraborty R, Jin L. 1992. Heterozygote deficiency, population substructure and their implications in DNA fingerprinting. Human Genetics 88:267-272.
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以复旦为第一单位署名
He X, Chu S, Jin L, Xiong M, Wang G, Zhuang Q, Liu X, Zhao Y, Huang Wei, Zhu D. 2001. a-adducine gene and essential hypertension in Chinese, Clin Exp Hypertens (In Press).
Zhao JY, Wang H, Xiong MM, Huang W, Zuo J, Chen Z, Qiang BQ, Sun Q, Li YX, Liu QY, Du WN, Chen JL, Ding W, Yuan WT, Zhao Y, Xu HY, Jin L, Fang FD. 2000. The localization of type 2 diabetes susceptibility gene loci in Northern Chinese Han families. Chinese Science Bulletin 45:1792-1795
Zhu DL, Wang HY, Xiong MM, He X, Chu SL, Jin L, Wang GL, Yuan WT, Zhan Y, Zhao GS, Boerwinkle E, Huang W. 2001. Linkage of hypertension to chromosome 2ql4-23 in Chinese families. J Hypertension 19:55-61.
Hacia JG, Fan J-B, Ryder 0, Jin L, Edgemon K, Ghandour G, Mayer RA, Sun B, Hsie L, Robbins CM, Brody LC, Wang D, Lander ES, Lipshutz R, Fodor SPA, Collins FS. 1999. Determination of ancestral alleles for human single-nucleotide polymorphisms using high-density oligonulceotide arrays. Nature Genetics 22:164-167.
以复旦为合作单位署名
Jin L, Su B. 2001. The Y chromosome and the replacement hypothesis - Response. Science 293: 567A-567B.
Akey JM, Wang H, Xiong M, Wu H, Liu W, Shriver MD, Jin L. 2001. Interaction between the melanocortin-1 receptor and OCA2 contributes to inter-individual variation in skin pigmentation phenotypes in a Tibetan population. Human Genetics 108:516-520.
Jin L, Su B. 2000. Natives or immigrants : origin and migrations of modem humans in East Asia. Nature Review Genetics. 1:126-133.
Su B, Xiao C, Deka R, Seielstad MT, Kangwanpong D, Xiao J, Lu D, Underbill P, Cavalli-Sforza LL, Chakraborty R, Jin L 2000. Y chromosome haplotypes reveal prehistorical migrations to the Himalayas. Human Genetics. 107:582-590.
Su B, Sun G, Xiao J, Hu F, Lu D, Chakraborty R, Deka R, Jin L. 2000. Distribution of three HIV-1 resistant polymorphisms (SDFl-3"A, CCR2-64I, and CCR5-A32) in global populations. Eur J Hum Genet 8:975-979.
Su B, Jin L, Underbill P, Martinson J, Saha N, McGarvey ST, Shriver MD, Chu J, Oefner P, Chakraborty R, Deka R. 2000. Polynesian origins: new insights from the Y-chromosome. Proceedings of National Academy of Sciences, USA. 97:8225-8228.
Su B, Xiao J, Underbill P, Deka R, Zhang W, Akey J, Huang W, Shen D, Lu D, Luo J, Chu J, Tan J, Shen P, Davis R, Cavalli-Sforza LL, Chakraborty R, Xiong M, Du R, Oefner P, Chen Z, Jin L. 1999. Y chromosome evidence for a northward migration of modem humans in East Asia during the last Ice Age. American Journal of Human Genetics 65: 1718-1724.
Su B, Jin L, Xiao J, Hu F, Zhang W, Lu D, Luo J, Chu J, Du R, Geng Z, Qiu X, Xue J, Tan CC, O"Brien SJ, Chakraborty R. 1999. Distribution of Two HIV-1 Resistant Polymorphisms (SDFl-3"A and CCR2-64I) in East Asia and World Populations and Its Implication in AIDS Epidemiology. American Journal of Human Genetics 65: 1047-1053.
Su B, Chakraborty R, JinL, Xiao J, Lu D. 1998. An HIV-resistant allele is exceptionally frequent in New Guinean highlanders. Journal of American Medical Association (JAMA) 280:1830
金力：课题组负责人
金力，男，38岁，复旦大学生命科学院遗传所，教授、博士生导师。国家教育部特聘****。现兼任美国辛辛那提大学环境健康系基因组信息中心教授，上海摩根—谈国际生命科学研究中心教授，国家人类基因组南方研究中心学术委员会副主任等职务。
金力教授1985年9月复旦大学生物系遗传专业本科毕业，1987年7月复旦大学遗传所遗传学专业硕士毕业，1994年5月获德克萨斯-休斯顿大学生物医学科学/遗传学博士学位，1994年6月至1996年12月在美国斯坦福大学医学院遗传学专业从事博士后研究。之后，他曾担任德克萨斯-休斯顿大学生物医学科学研究生院人类分子遗传专业副教授、德克萨斯-休斯顿大学公共健康院人类遗传学中心副教授，北美华人医学遗传学会常任理事,美国人类遗传学会会员。与此同时，他还是上海自然博物馆顾问教授，复旦大学-上海自然博物馆人类群体遗传学及分子人类学联合实验室主任，中国人类基因组多样性研究委员会秘书。
金力教授研究领域广泛,无论在美国和国内的研究中均显示出了出色的科研业务能力和组织能力。过去几年里，他作为课题负责人先后主持多个美国NIH资助的研究项目，以及国家自然科学基金重大项目、国家杰出青年科学基金、上海市科学技术发展重点项目等。致力于人类及医学遗传学（人类多基因疾病基因的作图和识别；遗传流行病学研究；高通量基因型和变异研究技术），群体遗传学（人类群体遗传学；人类群体进化；分子进化）和基因组学（物理作图和微阵列表达谱；人类基因组SNP单倍型图谱的构建；灵长类比较基因组学研究；遗传网络重建；生物信息学）等领域的研究工作。相关研究工作在国际核心学术刊物如美国科学院院报（PNAS）、科学（Science）、美国人类遗传学杂志（Am. J. Hum Genet），自然遗传学（Nature Genetics）等发表了论文及评论超过108篇，英文摘要80余篇。并组织或参与组织多次国际会议。
金力教授先后获得NIH医学遗传学博士后培训计划奖学金、德克萨斯-休斯顿大学公共健康院杰出研究奖，并多次获得Texas大学优秀学者奖,以及李氏基金杰出青年科学家、国家教委杰出青年研究者、国家教委科技进步二等奖以及上海市政府白玉兰奖等。
卢大儒：（信息待填）
金建中：（信息待填）
