李洪林校特聘教授，博士生导师
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电话/传真:+86-21-64250213
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地址:实验十八楼527室
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E-mail:hlli(at)ecust.edu.cn
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个人简介
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黑龙江人。2000年6月，毕业于大连理工大学化工学院，获学士学位；2005年6月，毕业于大连理工大学工程力学系，获博士学位；2005年7月-2008年5月，在中国科学院上海药物所博士后；2008年5月华东理工大学药学院任教授；2009年3月-2009年6月，美国明尼苏达大学短期访问；2012年3月，受聘华东理工大学特聘教授。他先后获得上海市“青年科技启明星计划”（2010）、教育部“新世纪优秀人才支持计划”（2011）、“天鼎－东岳”研究生奖教金特等奖（2011），国家自然基金委优秀青年基金（2012）等人才计划资助。现为上海市新药设计重点实验室（筹）副主任、生物反应器工程国家重点实验室成员、上海市化学生物学重点实验室成员、华东理工大学药学学科专业委员会主任。


他已在CancerRes.、Nucl.AcidsRes.、PlosComput.Biol.、J.Med.Chem.和J.Chem.Inf.Model.等期刊上发表论文60余篇，参与4部专著的编写，申请发明专利30项（已授权7项），PCT专利2项，获软件版权4项，应邀撰写“十二五”国家重点图书《高等药物化学》及英国剑桥大学本科生教材《ChemicalGenomics》的部分章节。为本科低年级学生开设“药物信息学导论”前沿讲座，参与药学专业概论课程讲授，主讲博士专业课《药物信息学》和硕士专业选修课《化学信息学》。他指导的国家级大学生创新项目2010年11月获得第三届“全国大学生药苑论坛”的“优秀创新成果奖”，2011年7月获得2009年度校“大学生创新性实验计划”优秀项目，同时获得第十二届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛上海市一等奖，2011年11月获得“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛二等奖。


作为课题负责人，他先后承担国家自然科学基金（3项）、国家863计划（2项）、新药创制重大专项（3项）等10余项国家及省部级项目；参加973项目、自然基金委重点项目等多项。目前实验室承担的主要科研项目包括：
(1)2013.1-2015.12，“药物设计与药物信息”，国家自然基金优秀青年基金。项目编号：81222046
(2)2012.1-2015.12，“天然产物作用靶标识别计算方法及实验验证”，国家自然基金委。项目编号：21173076
(3)2011.1-2013.12,“新世纪优秀人才支持计划”，教育部。项目编号：NCET-10-0378.
(4)2012.1-2015.12，“靶标发现和药物分子设计关键技术发展和软件产品研发”，国家高技术研究发展计划（863计划）。项目编号：2012AA020308.子课题负责人
(5)2011.1-2013.12，“规模化中药化学成分库的建立”，“重大新药创制”科技重大专项。项目编号：2011ZX09307-002-03.信息化平台负责人。





实验室介绍（详见实验室主页）
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李洪林实验室主要进行靶标识别和药物发现的计算方法及其应用的交叉学科研究。

针对药物研发的上游中存在的科学问题及难点问题，实验室主要从事药物设计、计算生物学及药物信息学等方面研究，重点开展靶标识别及药物发现相关基础研究工作。本实验室以方法的发展为主线，通过发展方法促进药物发现，以药物发现带动方法发展，验证方法的可靠性和实用性，建立靶标--药物发现一体化研究技术平台。


目前实验室研究方向主要包括：化学信息学、分子对接、打分函数、药效团方法、药物结合动力学、优化方法和高性能计算等新方法的发展，并将所发展的方法应用于实际的药物发现工作；此外，通过本实验室发展反向对接、反向药效团匹配、多向药理学等靶标预测方法，开展传统药用植物来源的天然产物靶标确证研究。


实验室成员来自不同的学科，从事理论、计算、实验相结合的交叉学科研究。实验室包括计算药物化学组、合成药物化学组及分子/结构生物学组，现已建立知识/年龄结构合理、富于创新的多学科融合的研究团队；团队包括合成药物化学（赵振江副教授）、计算机辅助药物设计（刘晓峰博士）、结构生物学（朱丽丽副教授）、药理学（陈卓博士）领域的专业人才，现有教授1名、副教授2名、讲师2名、师资博士后1名。
实验室研究内容涉及药物研发的临床前研究各阶段，即“靶标识别→靶标确证→药物设计→化学合成→生物测试→药物作用机制研究→候选药物→药理/药效学评价”。通过本实验室组内及与其他实验室合作，加强与分子/细胞/结构生物学、药理学、计算机科学等多学科交叉融合，并综合利用上述各种技术，团队各小组协作加快研究速度，发现具有体内/外活性的候选药物，进而完成化合物药理学评价及作用机制的功能确证。

实验室具体研究领域包括：
1)药物设计、计算生物学和化学信息学的新方法发展；
2)针对肿瘤、炎症及疟疾等疾病靶标开展实际的药物发现；
3)结合计算及实验方法开展先导化合物优化及临床前研究；
4)药物靶标预测方法及网络/多向药理学方法和平台的建立；
5)计算及生物学手段开展天然产物的靶标识别及实验验证；
6)通过计算生物学和结构生物学等手段开展药物-靶标作用机理研究。



实验室代表性论文(更多见实验室主页)
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1.YanyanDiao,WeiqiangLu,HuangtaoJin,JunshengZhu,LeHan,MinghaoXu,RuiGao,XuShen,ZhenjiangZhao,XiaofengLiu,YufangXu,JinHuang,andHonglinLi*.DiscoveryofDiverseHumanDihydroorotateDehydrogenaseInhibitorsasImmunosuppressiveAgentsbyStructure-BasedVirtualScreening.J.Med.Chem.,2012,55,8341?8349.
2.MengzhuXue,XianwenCao,YeZhong,DongKuang,XiaofengLiu,ZhenjiangZhao,HonglinLi*.Insulin-likeGrowthFactor-1Receptor(IGF-1R)KinaseInhibitorsinCancerTherapy:AdvancesandPerspectives.Curr.Pharm.Des.,2012,18,2901-2913.
3.XiaofengLiu,HualiangJiang,HonglinLi*.SHAFTS:AHybridApproachfor3DMolecularSimilarityCalculation.1.MethodandAssessmentofVirtualScreening.J.Chem.Inf.Model.,2011,51(9),2372–2385.
4.WeiqiangLu,XiaofengLiu,XianwenCao,MengzhuXue,KangdongLiu*,ZhenjiangZhao,XuShen,HualiangJiang,YufangXu,JinHuang*,andHonglinLi*.SHAFTS:AHybridApproachfor3DMolecularSimilarityCalculation.2.ProspectiveCaseStudyintheDiscoveryofDiversep90RibosomalS6ProteinKinase2InhibitorstoSuppressCellMigration.J.Med.Chem.,2011,54,3564–3574.
5.JingDeng,EnguangFeng,ShengMa,YanZhang,XiaofengLiu,HonglinLi*,HuangHuang,JinZhu,WeiliangZhu,XuShen,LiyanMiao*,HongLiu,HualiangJiang,andJianLi*.DesignandSynthesisofSmallMoleculeRhoAInhibitors:ANewPromisingTherapyforCardiovascularDiseases?J.Med.Chem.,2011,54(13),4508-4522.
6.LiLiu,XiaofengLiu,JiayuGong,HualiangJiang,andHonglinLi*.AcceleratingAll-AtomNormalModeAnalysiswithGraphicsProcessingUnit.J.Chem.TheoryComput.,2011,7(6),1595-1603.
7.JiangjiangQin,LiyanWang,JiaxianZhu,HuiziJin,JianjunFu,XiaofengLiu,HonglinLiandWeidongZhangNeojaponiconeA,abioactivesesquiterpenelactonedimerwithanunprecedentedcarbonskeletonfromInulajaponica.Chem.Commun.,2011,47,1222-1224.
8.XiaofengLiu,SishengOuyang,BiaoYu,YaboLiu,KaiHuang,JiayuGong,SiyuanZheng,ZhihuaLi,HonglinLi*,HualiangJiang.PharmMapperserver:awebserverforpotentialdrugtargetidentificationusingpharmacophoremappingapproach.Nucl.AcidsRes.2010,38:W609–W614.
9.XiaofengLiu,HuaXie*,ChengLuo,LinjiangTong,YiWang,TingPeng,JianDing,HualiangJiangandHonglinLi*.DiscoveryandSARofThiazolidine-2,4-dioneAnaloguesasInsulin-likeGrowthFactor-1Receptor(IGF-1R)InhibitorsviaHierarchicalVirtualScreening.J.Med.Chem.2010,53(6):2661–2665.
10.HonglinLi,JinHuang,LiliChen,JinZhu,XuShen,JianLi,RolfHilgenfeld,HualiangJiang.IdentificationofNovelFalcipain-2InhibitorsasPotentialAntimalarialAgentsthroughStructure-BasedVirtualScreening,J.Med.Chem.2009,52,4936–4940.
11.ZhentingGao,HonglinLi*,HaileiZhang,XiaofengLiu,LingKang,XiaominLuo,WeiliangZhu,KaixianChen,XichengWang*&HualiangJiang*.PDTD:aweb-accessibleproteindatabasefordrugtargetidentification.BMCBioinformatics2008,9:104.
12.HonglinLi,Zhenting.Gao,Ling,Kang,HaileiZhang,KunYang,XiaominLuo,KaixianChen,JianhuaShen,XichengWang*&HualiangJiang*.TarFisDock:awebserverforidentifyingdrugtargetswithdockingapproach.Nucl.AcidsRes.2006,34:W219-W224.