夏飞




个人资料
部门： 化学与分子工程学院
性别： 男
专业技术职务： More details about Fei Xia at researchgate
毕业院校： Xiamen University
学位： PhD
学历：
联系电话：
电子邮箱： fxia@chem.ecnu.edu.cn
办公地址：
通讯地址： Room 281, Geography Building. North Campus
邮编： **
传真：


工作经历
2007.09-2011.11，CAS-MPG计算生物研究所研究人员。
2009.05-2010.06，海德堡大学理论研究中心访问****。
2011.11-2014.02，南洋理工大学生科院研究人员。
2014.02至今，华师大学化学系副教授(海外引进人才)。




教育经历
1997.09-2001.06，厦门大学化学系学士。
2001.09-2004.06，厦门大学化学系物理化学硕士。
2004.09-2007.06，厦门大学化学系物理化学博士。






个人简介
>> 课题组成员：
2020级硕士生王伊秋，课题：蛋白释放动力学研；
2019级硕士生熊宇晴，课题：蛋白复合物模拟；
2018级硕士生高菡，课题：二氧化碳分子动力学模拟；
2016级博士生张于微，课题：模型发展，机器学习；
>> 本科生科研及成果：
2019级朱青东；
课题：CO2活化转化
2019级曾好；
课题：CO2活化转化
2018级王赟昊；
课题：理论模型发展；

2017级李峰宇，发表一作论文J. Phys. Chem. A；
目前课题：混合粗粒化模型的发展

2017级查锦寅，发表一作论文J. Phys. Chem. A；
目前课题：微管力学性质模拟，有机反应的机器学习；
2015级吴禛亮，发表一作论文28 JCC.pdf；
考研进入复旦大学计算机系；


>> 本科生申请本组科研要求:
本科一、二年级学生，对电脑和计算化学有兴趣；
普通班成绩班上排名30%内，至少熟悉一门编程语言；


2021.01，祝贺查锦寅第一作者论文发表于FBM！
2020.12，祝贺李峰宇获华师大宝钢奖学金、校长奖学金；
2020.09，祝贺高菡获得华师大优秀干部称号；
2020.09，祝贺李峰宇保研至复旦大学化学系！
2020.09，祝贺查锦寅保研至上海交大医学院！
2020.09，祝贺查锦寅第一作者论文发表于JPCA！
2020.04，祝贺查锦寅、李峰宇创新创业项目评为市创！
2020.02，祝贺本科生李峰宇第一作者论文发表于JPCA！
2019.11，祝贺高菡获得华师大优秀学生称号；
2019.11，博士生张于微赴波士顿大学短期交流；
2019.10，祝贺查锦寅、李峰宇创新创业培育项目立项！
2019.08，祝贺本科生吴禛亮一作论文发表于JCC！
2019.08，本科生李峰宇、查锦寅访问厦门大学化学系；
2019.06，祝贺张于微研究工作被PCCP选为热点文章！
2019.05，祝贺黄敏敏获得硕士学位！
2019.03，祝贺吴禛亮通过复旦大学硕士研究生复试；
2018.06，祝贺张于微获德国海德堡大学交流项目；
2018.05，祝贺骆周洁获得硕士研究生学位！


2018.04，祝贺骆周洁获“华师大优秀毕业生”称号。
2018.02，模拟研究Ras蛋白文章被一区杂志JPCL接收！
2017.11，祝贺黄敏敏获得华师大“优秀学生”称号。
2017.10，祝贺骆周洁获校级奖学金、“智慧奖学金”。
2017.05，祝贺张于微获得厦大校级“黄仲咸奖学金”！
2017.02，三组分反机理研究被Science子刊Sci. Adv.接收！

2016.10，祝贺骆周洁获“研究生国家奖学金”！
2016.06，祝贺刘源同学获得博士学位！
2016.05，成功申请举办中德双边国际交流会议。
2015.11，祝贺刘源同学第一作者文章被Chem. Sci.接收。

2015.04，研究成环反应机理被一区杂志Chem. Sci.接收！


>> 已毕业：
2016级硕士黄敏敏；2015级硕士骆周洁；2012级博士刘源；2011级博士李阳；2011级硕士吕思莹；



>>往年本科毕设：
2016级陈成；2015级吴禛亮；2015级赵阳；2014级刘曦恺；2013级王祥玉；2011级徐伟；




社会兼职
中国化学会会员；
中国生物物理学会会员；
上海纽约大学-华师大联合计算化学中心成员:



研究方向






厦门大学化学系与生物系；
德国波鸿大学生物物理系；
美国波士顿大学化学系；
德国海德堡理论研究中心；
新加坡南洋理工数学系；
2019.10，南京复杂体系计算统计力学学研讨会口头报告。
2019.05，协办第二届青年理论化学会议-生物体系多尺度模拟。
2019.04，贵州纳米材料模拟与计算重点实验室邀请报告。
2018.12，合肥复杂体系计算统计力学学研讨会口头报告。
2018.06，第二届世界华人计算生物与模拟会议邀请报告。
2018.05，化学会31届年会量子与经典动力学分会口头报告。
2017.11，第14届全国计算机化学学术会议邀请报告。
2017.10，北京师范大学生物理论与计算交流会邀请报告。
2017.06，大连第15届全国量子化学会议口头报告。

2016.10，上海交大第4届国际分子模拟大会邀请报告。
2016.07，中国化学会30届年会分会口头报告。

2016.06，合肥中科大第4届全国生物物理化学会议口头报告。
2016.05，生物体系的多尺度模拟-中德双边国际研讨会(会议主办人)。


2016.05，上海第17届结构生物学合作网络会议口头报告。

2015.11，广州第13届全国计算机化学学术会议邀请报告。

2015.10，上海药物所蛋白质功能结构计算模拟研讨会邀请报告。
2015.04，上海地区高校理论化学研讨会口头报告。
2014.09，苏州冷泉港亚洲GTPase国际会议口头报告。
2014.06，太原第12届全国量子化学会议口头报告。



开授课程
1.本科生专业必修课程《物质结构》；
2.研究生专业选修课程《量子化学与分子动力学在化学中运用》；




科研项目
>2021.01，国家自然科学基金面上项目（No.**，项目主持人，批准）。
> 2018.01，国家自然科学基金面上项目（No.**，项目主持人，在研）。
> 2016.03，国家自然科学基金中德专项基金（GZ.1292，项目主持人，结题）。
> 2015.01，国家自然科学基金重点项目（No.**，项目参于人，结题）。
> 2015.01，国家自然科学基金面上项目（No.**，项目主持人，结题）。
> 2014.06，上海市自然科学研究基金（No.14ZR**，项目主持人，结题）。
> 2011.06，优秀青年人才领域前沿项目（No. 2011KIP310，项目主持人，结题）。




学术成果

【1】Development of Ultra-Coarse-Grained Models：
Wu, Z. L.; Zhang, Y. W.; Zhang, J. Z. H.; Xia, K. L.*;Xia, F.*J. Comput.Chem.2020,41, 14.
Zhang, Y. W.; Xia, K. L.*; Cao, Z. X.; Gr?ter, F.;Xia, F.*Phys.Chem.Chem.Phys.2019,21, 9720.
Zhang, Y. W.; Cao, Z. X.;Xia, F.*Chem. Phys. Lett.2017,681, 1.
Zhang, Y. W.; Cao, Z. X.; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Chem. Inf. Model.2017, 57, 214.
Li, M.; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Chem. Theory Comput.2016, 12, 2091.
Li, M.; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Comput.Chem.2016,37, 795.
Xia, F.;Tong, D.; Lu,L.* et al.J. Comput.Chem.2014,35, 1111.
Xia, F.; Tong, D.;Lu,L.*J. Chem. Theory Comput.2013,9, 3704.
Xia, F.;Lu,L.*J. Chem. Theory Comput.2012,8, 4797.
【2】Ras Protein Simulation and Drug Design:
Li, Y.; Zhang,Y. W.; Carsten, K.; Xia, F.*; Gerwert, K.* et al.J. Phys. Chem. Lett.2018, 9, 1312.
Xia, F.;Rudack,T.;Cui, Q.;K?tting,C.;Gerwert,K.*J. Am. Chem. Soc.2012,134, 20041.
Rudack,T.;Xia, F.;K?tting,C.;Schlitter,J.;Gerwert,K.*Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.2012,109, 15295.
Xia, F.;Thirumalai,D.*;Gr?ter,F.*Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.2011,108,6963.


【通讯文章】：
[XX]
[38] Zhang, Y. W.; Cao, Z. X.; XX; Xia. F.*2021, in prep.
[37] Zeng, J.;Xia, F.*; Cui, Q.; XX*.2021, in prep.
[36] Gao, H.; Xia, F.*; XX*2021, in prep.
[35] Zeng, J.; Chen, J.; Xia, F.*; Cui, Q.; Deng, X. M.*; XX*2021,in prep.
The specific substates of Ras.

[34] Zha, J. Y.; Zhang, Y. W.; Xia, K. L.;Gr?ter, F.*;Xia, F.*2021,in submission. (Invited).
Coarse-grained simulation of mechanical properties of single microtubules with micrometer length.
[33] Zhang, Y, W.; Cao, Z. X.;Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Chem. Theory Comput.2020, 16, 6678.
Double-wellultra-coarse-grained model to describe protein conformational transitions.
[32] Zha, J. Y.; Wang, R.; Chen, J.; Gao, G. H.*;Xia, F.*J. Phys.Chem. A2020, 124, 7991.
Reaction Mechanistic study of CO2 and styrene oxide catalyzed by ionic liquids.
[31] Sheng, Z. Z.; Huang, M. M.; Xue, T.*; Xia, F.*; Wu, H. H.*RSC Adv.2020, 10, 34910.
Alcohol amine-catalyzed CO2 conversion for the synthesis of quinazoline-2,4-(1H,3H)-dione in water.
[30] Liu, L.; Gao, H.; Yang, S.; Chen, X.; Lu, Y.; Liu, Y.*;Xia, F.*J. Catal.2020, 385,183.
Ir-catalyzed tandem hydroformylation-transfer hydrogenation of olefins with (trans-/cis-)formic acid as hydrogen source.
[29] Li, F. Y.; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Phys.Chem. A2020,124,2029.
How CuCl and CuCl2 insert into C-N bonds of diazo compounds: an electronic structure and mechanistic study.
[28] Wu, Z. L.; Zhang, Y. W.; Zhang, J. Z. H.; Xia, K. L.*;Xia, F.*J. Comput.Chem.2020, 41, 14.
Determining optimal coarse-grained representation for biomolecules using internal cluster validation indexes.
[27] Chen, J.; Gao, H.; Ding, T.; Ji, L.; Zhang, J. Z. H.; Gao, G. H.*;Xia, F.*Front. Chem.2019, 7, 615.
Mechanistic studies of CO2 cycloaddition reaction catalyzed by amine-functonalized ionic liquids.

[26] Li, Z.; Wei, Q.; Song, L.; Han, W.; Wu, X.; Zhao, Y.;Xia, F.*; Liu, S.* Org. Lett.2019, 21, 6413.
A catalyst-free highly regioselective radical transformation of N-sulfonyl-1,2,3-triazoles in air.
[25] Zhang, Y. W.; Xia, K. L.*; Cao, Z. X.; Gr?ter, F.; Xia, F.*Phys. Chem. Chem. Phys.2019, 21, 9720.
A new method for constrution of CG models of large biomolecules from lowresolution data of cryo-EM.
[24] Chen, J.; Huang, M. M.;Xia, F.*Chem. Phys. Lett.2018, 713, 21.
Conformer-related pathways in cycloadditon of vinylaziridines and alkynes catalyzed by rhodium complex.
[23]Li, Y.; Wang, X.; Ren, L.; Cao, X.; Ji, C.;Xia, F.*;Zhang,J. Z. H.*J. Chem. Inf. Model.2018, 58, 1587.
Electrostatic polarization effect on cooperative aggregation of full length human islet amyloid.
[22] Yang, D.; Liu, H.; Wang, D.; Luo, Z. J.; Lu, Y.; Xia, F.*; Liu, Ye.*Green Chem.2018, 20, 2588.
Co-catalysis of bi-functional ligand based Pd-catalysis for tandem bis-alkoxycarbonylation of terminal alkynes.
[21] Wang, P.; Liu, L.; Luo, Z. J.; Zhou, Q.; Lu, Y.;Xia, F.*; Liu, Ye.*J. Catal. 2018, 361, 230.
Combination of transition metal Rh-catalysis and tautomeric catalysis through a bi-functional ligand...
[20] Li, Y.; Zhang,Y. W.;Cui, Q.; Carsten, K.; Xia, F.*; Gerwert, K.* et al.J. Phys. Chem. Lett.2018, 9, 1312.
Specific sbustates of Ras to interact with GAPs and effectors: revealed by theoretical simulations and FTIR experiments.
[19]Ji, L. Z.; Luo, Z. J.; Zhang, Y.; Wang, R.; Ji, Y.; Xia, F.*; Gao, G. H.* Mol. Catal.2018, 446, 124.
Imidaolium ionic liquids/organic bases: effiicent intermolecular synergistic catalysts for the cycloaddition of CO2...
[18]Huang, M. M.; Luo, Z. J.; Zhu, T.; Chen, J.*; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*RSC Adv.2017, 7, 51521.
A theoretical study of substituent effect on reactions of amines, carbon dioxide and ethylene oxide and ethlene oxide ...
[17]Luo, Z. J.; Gao, Y.; Zhu, T.*; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Phys. Chem. A2017, 121, 6523.
Origins of protons in C-H bond insertion prodcuts of phenols: proton-self-sufficietn function via water molecules.
[16]Zhang, Y. W.; Cao, Z. X.;Xia, F.*Chem. Phys. Lett.2017,681, 1.(cover)
Construction of ultra-coarse-grained model of protein with a Gō-like potential.
[15] Liu, S.;Jiang, J.; Chen, J.; Wei, Q.; Yao, W.; Xia, F.*; Hu, W. H.* Chem. Sci.2017, 8, 4312.
A DFT computation-inspired Rh(I)-catalyzed reaction via suppression of a-H shift in a-alkyldiazoacetates.
[14] Zhou, J.; Lv, S.; Zhang, D.;Xia, F.*; Hu, W. H.*J. Org. Chem.2017, 82, 2599.
Deactivating influcence of 3-olycosyl substituent on anomeric reactivity of thiomannoside...
[13] Zhang, Y. W.; Cao, Z. X.; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Chem. Inf. Model.2017, 57, 214.
Performance comparions of systematic methods for rigrous definition of coarse-grained sites of biomolecules.
[12] Liu, S.; Yao, W.; Liu, Y.; Wei, Q.; Chen, J.; Wu, X.; Xia, F.*; Hu, W. H.* Sci. Adv.2017, 3, e**.
A Rh(II)-catalyzed multicomponent reaction by trapping an amino enol intermediate...
[11] Luo, Z. J.; Wang, B.; Liu, Y.; Gao, G.*; Xia, F.*Phys. Chem. Chem. Phys.2016,18, 27951.
Reaction mechanisms of carbon dioxide, ethylene oxide adn amines catalyzed by ionic liquids BmimBr and BmimOAc
[10]Liu, Y.; Luo, Z. J.; Zhang, J. Z. H.; Xia, F.*J. Phys. Chem. A2016,120, 6485.
DFT calculations on the mechanism of transtion metal catalyzed reaction of diazo compounds wtih phenols.
[9]Li, M.; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Chem. Theory Comput.2016,12, 2091.
Constructing optimalcoarse-grained sites of huge biomolecules by fluctuation maximization.
[8] Liu, Y.; Yu, Z.; Zhang, J. Z. H.; Liu, L.*;Xia, F.*J. Phys. Chem. A 2016,120, 1925.
Theoretical investigation of mechanisms of C(sp2)-H and C(sp3)-H bond insertion by gold carbenes.

[7] Wang, B.; Luo, Z. J.; Elageed, E.; Wu, S.;Xia, F.*; Gao, G.* et al.ChemCatChem2016, 8, 830.
DBU and DBU-derived ionic liquid synergistic catalysis for conversion of CO2/CS2 to 3-aryl-2-oxazolidinones.
[6] Liu, Y; Yu, Z.;Zhang, J. Z. H.;Liu, L.*;Xia, F.*; Zhang, J. L.*Chem. Sci.2016,7,1988.
Origins of unique gold-catalyzed chemo- and site-selective C-H functionalization of phenols with diazo compounds.
[5]Li, M.; Zhang, J. Z. H.;Xia, F.*J. Comput.Chem.2016,37, 795.
A new algorithm for construction of coarse-grained sites of large biomolecules.
[4] Wang, Y.; Zhang, P.; Liu, Y.; Xia, F.*; Zhang, J. L.* Chem. Sci.2015, 6, 5564.
Enantioselective gold-catalyzed intermolecular [2+2] versus [4+2]-cycloadditions of 3-strylindoles with N-allenamides.
[3] Xu, L.; Huang, D.;Xia, F.*; Li, X.; Fan, F.*; Li, C.; Wu, P.* et al.Chem. Commun.2015,51, 9010.
Construction of unique six-coordinated titanium species with an organic amime ligand in titanosilicate...
[2] Li, M.; Zhang, J. Z. H.; Xia, F.*Chem. Phys. Lett.2015, 618, 102.
Heterogenous elastic network model improves description of slow motions of proteins in solution.
[1] Li, M.; Zhang, J. Z. H.*; Xia, F.*J. Mol. Model.2014, 20, 2530.
Combined effect of confinement and affinity of crowded environment on conformation switching of adenylate kinase.
【2014年前】
[20]Xia, F.; Tong, D.; Yang, L.; Wang, D.; Hong, H. C.; Koehl, P.; Lu, L.* ??J. Comput. Chem.2014, 35, 1111.??
Identifying essential pairwise interactions in elastic network model using the alpha shape theory.
[19]Xia, F.; Tong, D.; Lu,L.* J. Chem. Theory Comput.2013, 9, 3704.
Robust heterogeneous elastic network model precisely reproduces the experimental B-factors of biomolecules.
[18]Xia, F.; Lu,L.* J. Chem. Theory Comput.2012, 8, 4797.
Multiscalecoarse-grainingvianormalmodeanalysis.
[17]Rudack,T.;Xia, F.; K?tting, C.; Schlitter,J.; Gerwert,K.* Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.2012, 109, 15295.
Ras and GTPase-activating protein (GAP) drive GTP into a precatalytic state as revealed by combining FTIR and biomolecular simulations.
[16]Xia, F.; Rudack,T.;Cui, Q.; K?tting, C.;Gerwert,K.* J. Am. Chem. Soc.2012, 134, 20041.
Detailedstructure of the H₂PO₄^--guanosinediphosphate intermediate in Ras-GAP decoded from FTIR experiments by biomolecular simulations.
[15]Rudack,T.;Xia, F.; K?tting, C.;Schlitter,J.;Gerwert,K.*Biophys.J.2012,103, 293.
Theroleof MgforgeometryandchargeinGTPhydrolysisrevealedbyQM/MMsimulations.
[14]Xia, F.; Rudack,T.;K?tting, C.;Schlitter,J.;Gerwert,K.* Phys. Chem. Chem. Phys.2011, 13,21451.
The specific vibrational modes of GTP in solution and Ras protein: a detailed theoretical analysis revealed by QM/MM simulation.
[13]Xia, F.; Bronowska,A.K.;Chen,S.M.;Gr?ter,F.*J. Phys. Chem. B2011, 115, 10126.
Base-catalyzed peptidehydrolysisisinsensitivetomechanicalstress.
[12]Xia, F.; Thirumalai,D.*;Gr?ter, F.* Proc. Natl.Acad.Sci.U.S.A.2011,108,6963.
Minimum energycompactstructuresinforce-quench polyubiquitinfoldingaredomainswapped.
[11]Stacklies, W.;Xia, F.; Gr?ter,F.*Plos Comp.Biol.2009,5, e**.
Dynamic allosteryinthemethioninerepressorrevealedbyforcedistributionanalysis.
[10]Xia, F.; Xie, H. J.; Cao, Z. X.* Int. J Quantum Chem.2008, 108, 57.
Densityfunctionalstudyofprotonationofdeoxynucleosides:electrophilic active sites and proton affinities.
[9]Xie, H. J.; Wu, R. B.; Xia, F.; Cao, Z. X.* J. Comput. Chem.2008, 29, 2025.
Effects of electron attachment on C_5'-O_5'and C_1'-N₁bond cleavages of pyrimidine nucleotides: atheoretical study.
[8]Xia, F.;Cao, Z. X.* Organometallics2007, 26, 6076.
Reaction mechanisms for C-O bond coupling from Pt₄CH₂⁺and O₂: arelativistic density functional study.
[7]Chen, J.; Xia, F.;Cao, Z. X.* J. Mol. Struct.: THEOCHEM2007, 808, 9.
Dehydrogenation reactivitiesof bimetallic species RhMCH₂⁺ (M=Pt, Rh) with different spin multiplicities toward NH₃in the gas phase: adensity functional theory study.
[6]Xie, H. J.; Xia, F.; Cao, Z. X.* J. Phys. Chem. A2007, 111, 4384.
Density functional study toward understanding dehydrogenation of the adenine- thymine base pair and its anion.
[5]Xia, F.; Cao, Z. X.* J. Phys. Chem. A2006, 110, 10078.
Relativistic DFT studies of dehydrogenation of methane by Pt cationic clusters: cooperative effect of bimetallic clusters.
[4]Xia, F.; Chen,J.;Cao,Z.X.* Chem. Phys.Lett.2006,418, 386.
Relativisticdensity-functionalstudyonthedehydrogenationreactivityofPtMCH₂⁺toward NH₃.
[3]Xia, F.; Chen,J.;Zeng,K.;Cao,Z. X.*Organometallics2005,24, 1845.
DensityfunctionalcharacterizationofreactionsofbimetalliccarbenesPtMCH₂⁺withNH₃inthegasphase.
[2]Xia, F.; Lin,Y.Z.;Xu,Z.X.;Lin,J.D.;Lu,X.;Liao,D.W.Chin. J. Chem.Phys.2004,17, 139.
ElectronicstatesandspectroscopicpropertiesofRuH₂andRuN₂.
[1]Xia, F.; Lin, Y.Z.;Xu,Z.X.;Lin,J.D.;Lu,X.;Liao,D.W.Acta Phys.-Chim.Sini.2003,19, 1119.
ThetheoreticalcomputationonRu₂N₂clusterwithC_2vsymmetry.




荣誉及奖励