王贝贝
职称：副教授
邮箱：bbwang@uestc.edu.cn
所在系别：生物技术系
研究领域：生物大分析体系的多尺度计算模拟



教育背景
2003年09月—2007年06月，中国石油大学（北京），化学工程与工艺学院，应用化学专业，本科2007年09月—2012年06月，复旦大学，化学系，物理化学专业，博士
工作履历
2017年11月—至今，电子科技大学，生命科学与技术学院，副教授2015年06月—2017年11月，卡尔加里大学，生物科学学院，博士后2012年07月—2015年05月，密歇根州立大学，生物化学与分子生物学系，博士后
科学研究
研究概况
课题组使用多种计算模拟方法研究从分子尺度到细胞尺度的生物学现象，从而在微观现象和宏观现象之间架起桥梁。我们创建脂质分子，DNA，RNA和蛋白质的最新计算模型，以研究其结构-动力学-功能之间的关系。已获得两项国家自然基金的支持。目前课题组主要关注领域如下：1）建立细胞被膜复杂结构的计算模型；2）模拟膜蛋白系统的电喷雾电离（ESI）过程的行为演化过程；3）DNA复制和RNA转录过程的结构-动力学-功能关系。
代表性成果
(9) Beibei Wang, Rachel E. Sexton, Michael Feig*. Kinetics of nucleotide entry into RNA polymerase active site provides mechanism for efficiency and fidelity. BBA Gene Regulatory Mechanisms 2017 1860, 482-490. (8) Beibei Wang, Joshua Francis, Monika Sharma, Sean M. Law, Alexander?V. Predeus, Michael Feig*. Long-Range Signaling in MutS and MSH Homologs via Switching of Dynamic Communication Pathways. PLoS Comput. Biol. 2016 12(10): e**. (7) Beibei Wang, Jingwei Weng, Wenning Wang*. Substrate binding accelerates the conformational transition and substrate extrusion in multidrug efflux transporter AcrB. Front. Microbiol. 2015, 6, 302. (6) Beibei Wang, Kristopher Opron, Zachary F. Burton, Robert I. Cukier, Michael Feig*. Five checkpoints maintaining the fidelity of transcription by RNA polymerases in structural and energetic details. Nucleic Acid Res. 2015, 43, 1133-1146.(5) Beibei Wang, Jingwei Weng, Wenning Wang*. Multiple conformational states and gate opening of outer membrane protein TolC revealed by MD simulations. Proteins, 2014, 82, 2169-2179.(4) Beibei Wang, Michael Feig, Robert I. Cukier, Zachary F. Burton*. Computational simulation strategies for analysis of multi-subunit RNA polymerases. Chem. Rev. 2013, 113, 8546-8566. (3) Beibei Wang, Alexander?V. Predeus, Zachary?F. Burton, Michael Feig*. Energetic and Structural Details of the Trigger-Loop Closing Transition in?RNA Polymerase II. Biophys. J. 2013, 105, 767-775. (2) Beibei Wang, Jingwei Weng, Kangnian Fan, Wenning Wang*. Inter-domain flexibility and pH-induced conformational changes of AcrA revealed by molecular dynamics simulations. J. Phys. Chem. B, 2012, 116, 3411-3420.(1) Beibei Wang, Jingwei Weng, Kangnian Fan, Wenning Wang*. Elastic network model-based normal mode analysis reveals the conformational couplings in the tripartite AcrAB-TolC multidrug efflux complex. Proteins, 2011, 79, 2936-2945.
教育教学
本科生课程
《DNA编码文库》、《统计分析软件》等
研究生课程
《研究生论文写作》等
招生专业
硕士：071000生物学（02生物物理学）
个人/团队主页

职称 副教授 邮箱 bbwang@uestc.edu.cn
所在系别 生物技术系 研究领域 生物大分析体系的多尺度计算模拟
科学研究 招生专业 硕士：071000生物学（02生物物理学）
联系方式 办公地址
团队联系方式 教育教学 2003年09月—2007年06月，中国石油大学（北京），化学工程与工艺学院，应用化学专业，本科
2007年09月—2012年06月，复旦大学，化学系，物理化学专业，博士
工作履历 2017年11月—至今，电子科技大学，生命科学与技术学院，副教授
2015年06月—2017年11月，卡尔加里大学，生物科学学院，博士后
2012年07月—2015年05月，密歇根州立大学，生物化学与分子生物学系，博士后 研究概况 课题组使用多种计算模拟方法研究从分子尺度到细胞尺度的生物学现象，从而在微观现象和宏观现象之间架起桥梁。我们创建脂质分子，DNA，RNA和蛋白质的最新计算模型，以研究其结构-动力学-功能之间的关系。已获得两项国家自然基金的支持。目前课题组主要关注领域如下：1）建立细胞被膜复杂结构的计算模型；2）模拟膜蛋白系统的电喷雾电离（ESI）过程的行为演化过程；3）DNA复制和RNA转录过程的结构-动力学-功能关系。
代表性成果 (9) Beibei Wang, Rachel E. Sexton, Michael Feig*. Kinetics of nucleotide entry into RNA polymerase active site provides mechanism for efficiency and fidelity. BBA Gene Regulatory Mechanisms 2017 1860, 482-490.
(8) Beibei Wang, Joshua Francis, Monika Sharma, Sean M. Law, Alexander?V. Predeus, Michael Feig*. Long-Range Signaling in MutS and MSH Homologs via Switching of Dynamic Communication Pathways. PLoS Comput. Biol. 2016 12(10): e**.
(7) Beibei Wang, Jingwei Weng, Wenning Wang*. Substrate binding accelerates the conformational transition and substrate extrusion in multidrug efflux transporter AcrB. Front. Microbiol. 2015, 6, 302.
(6) Beibei Wang, Kristopher Opron, Zachary F. Burton, Robert I. Cukier, Michael Feig*. Five checkpoints maintaining the fidelity of transcription by RNA polymerases in structural and energetic details. Nucleic Acid Res. 2015, 43, 1133-1146.
(5) Beibei Wang, Jingwei Weng, Wenning Wang*. Multiple conformational states and gate opening of outer membrane protein TolC revealed by MD simulations. Proteins, 2014, 82, 2169-2179.
(4) Beibei Wang, Michael Feig, Robert I. Cukier, Zachary F. Burton*. Computational simulation strategies for analysis of multi-subunit RNA polymerases. Chem. Rev. 2013, 113, 8546-8566.
(3) Beibei Wang, Alexander?V. Predeus, Zachary?F. Burton, Michael Feig*. Energetic and Structural Details of the Trigger-Loop Closing Transition in?RNA Polymerase II. Biophys. J. 2013, 105, 767-775.
(2) Beibei Wang, Jingwei Weng, Kangnian Fan, Wenning Wang*. Inter-domain flexibility and pH-induced conformational changes of AcrA revealed by molecular dynamics simulations. J. Phys. Chem. B, 2012, 116, 3411-3420.
(1) Beibei Wang, Jingwei Weng, Kangnian Fan, Wenning Wang*. Elastic network model-based normal mode analysis reveals the conformational couplings in the tripartite AcrAB-TolC multidrug efflux complex. Proteins, 2011, 79, 2936-2945. 教育教学
本科生课程 《DNA编码文库》、《统计分析软件》等 研究生课程 《研究生论文写作》等

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