陈建群 教授 校长助理





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个人简介
研究方向
科研成果





个人简介
陈建群，南京大学生命科学学院教授，博士生导师。南京大学理学学士、硕士，法国国家应用科学学院博士。
主要通过分子生物学和生物信息学技术，研究进化生物学、基因组学、表观遗传学及其医学应用，主持国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金重大研究计划项目、国家自然科学基金面上项目、国家科技重大专项等研究，发表科研论文80多篇，其中包括Nature、PNAS、Molecular Biology and Evolution、Plant Physiology、Trends in Plant Science、eLife等杂志；获国家发明专利授权6项。


学术兼职
教育部高等学校生物科学类专业教学指导委员会副主任委员，江苏省植物学会副理事长。


研究方向


基于演化生物学、生物信息学和分子生物学，探索表观遗传的调控机制及医学应用；并围绕不同生物之间的相互关系，特别是动植物与微生物之间的关系，研究基因的结构、功能及演化。
1. 不同生物之间相互关系的演化及基因功能研究
1) 植物抗病基因的演化机制及功能
2) 动植物与微生物共生的演化机制及功能
3) 基因组分析及功能演化研究
2.遗传学和表观遗传学的机制及医学应用
1) 核酸修饰的发生、调控、功能
2) 基于核酸序列及修饰的癌症早筛、早诊及伴随诊断
3) 基于大数据算法的疾病预后、疗效、疗法评估
3. 新型合成生物学／分子生物学工具的开发及应用
1) 新型工具酶的开发和改造
2) 致病微生物及耐药性快速鉴定技术平台的开发和应用
3) 基因编辑／表观修饰编辑工具的开发和应用
4) 新型核酸修饰检测和定位技术的开发和应用


获奖情况
教育部高等学校科学研究优秀成果奖自然科学奖 一等奖（2018年）
“全国百篇优秀博士学位论文”指导教师（2010年）
高等教育国家级教学成果奖 特等奖（2014年）
二等奖（2005年）
江苏省教学成果奖 特等奖2项（2013，2011年）
一等奖3项（2013，2004年）



科研成果
代表性论文(* 通讯作者)

1.Wenna Guo，Liucun Zhu,Rui Zhu, Qihan Chen, Qiang Wang*,Jian-Qun Chen*(2019) A four-DNA methylation biomarker is a superior predictor of survival of patients with cutaneous melanoma. eLife2019;8:e44310DOI:10.7554/eLife.44310
2.Zhu-Qing Shao, Jia-Yu Xue, Qiang Wang, Bin Wang, Jian-Qun Chen* (2019)Revisiting the origin of plant NBS-LRR genes. Trends in Plant Science24(1):9-12.
3.Zhuqing Shao, Jiayu Xue, Ping Wu, Yanmei Zhang, Wu Y, Yueyu Hang, Bin Wang*, Jian-Qun Chen* (2016) Large-scale analyses of angiosperm nucleotide-binding site-leucine-rich repeat (NBS-LRR) genes reveal three anciently diverged classes with distinct evolutionary patterns. Plant Physiology170: 2095–2109.
4.Sihai Yang, Long Wang, Ju Huang, Xiaohui Zhang, Yang Yuan, Jian-Qun Chen,Laurence D Hurst, Dacheng Tian (2015) Parent-progeny sequencing indicates higher mutation rates in heterozygotes.Nature523(7561): 463-467.
5.Zhu-Qing Shao, Yan-Mei Zhang, Yue-Yu Hang, Jia-Yu Xue, Guang-Can Zhou, Ping Wu, Xiao-Yi Wu, Xun-Zong Wu, Qiang Wang, Bin Wang*, Jian-Qun Chen*(2014) Long-Term Evolution of Nucleotide-Binding Site-Leucine-Rich Repeat Genes: Understanding Gained from and beyond the Legume Family. Plant Physiology166: 217-234.
6.AmborellaGenome Project (2013) The AmborellaGenome and the evolution of flowering plants. Science342(6165): **.
7.Sihai Yang, Yang Yuan, Long Wang, Jing Li, Wen Wang, Haoxuan Liu, Jian-Qun Chen*, Laurence D. Hurst*, Dacheng Tian*(2012) Great majority of recombination events in Arabidopsis are gene conversion events. Proc Natl Acad Sci U S A109(51): 20992–20997.
8.Jian-Qun Chen, Ying Wu, Hai-Wang Yang, Joy Bergelson, Martin Kreitman, Da-Cheng Tian*(2009) Variation in the ratio of nucleotide substitution and indel rates across genomes in mammals and bacteria. Molecular Biology and Evolution26(7): 1523-1531.
9.Dacheng Tian, Qiang Wang, Pengfei Zhang, Hitoshi Araki, Sihai Yang, Martin Kreitman, Thomas Nagylaki, Richard Hudson, Joy Bergelson, Jian-Qun Chen* (2008) Single-nucleotide mutation rate increases close to insertions/deletions in eukaryotes.Nature455: 105-108.
10.Dacheng Tian, Milton Brion Traw, Jian-Qun Chen, Martin Kreitman, Joy Bergelson (2003) Fitness costs of R-gene-mediated resistance in Arabidopsis thaliana. Nature423: 74-77.