车辆工程系是全国应用型本科院校协作组组长单位南京工程学院的二级教学院系，是江苏省汽车工程学会常务理事单位、江苏省轨道车辆现代化装备工程研究中心挂靠单位之一、南京工程学院-深圳安车科技汽车检测室挂牌单位。具有车辆工程、车辆工程(汽车技术)、车辆工程(城市轨道车辆)、车辆工程(车辆电子电气)四个本科专业(方向)，以新能源汽车及传统汽车制造、城市轨道车辆制造检修、车辆电子控制为教学内涵，现有全日制本科学生900人(不含民办本科)，毕业生一次就业率大于98%。

　　车辆工程系设有综合办公室、学生工作办公室、汽车教研室、轨道车辆教研室、车辆电子教研室和车辆工程实验中心。现有教职工31人，其中：行政管理人员6人，专任教师25人。在专任教师中：①兼有讲师和硕士以上学位教师21人，占全系专任教师总数的84%；②职称结构为正高1人、副高11人、中级13人，高、中级职称比例48%：52%；③学历结构为博士5人、硕士16人、学士4人，博士、硕士、学士比例20%：64%：16%。

　　车辆工程系的科技工作主要围绕新能源汽车电子控制和轨道车辆装备，在新能源汽车动力混合器、电池管理系统、燃料电池发动机试验台，以及轨道车辆门系统振动、冲击、模态分析领域开展产学研合作，同时对于传统汽车的运用作深入研究，获得纵向课题资助。

　　本系车辆工程实验中心历年来陆续受到“中央与地方共建高校特色优势学科实验室项目”、“中央财政支持地方高校发展专项资金项目”和“中央与地方共建高校基础实验室建设项目“的资助，设有汽车实验室、车辆电子实验室、轨道车辆实验室和系计算机房，具有新能源汽车、常规汽车、城市轨道车辆、汽车电子等四类教学科研设备，价值860万元、占地面积2135m2，拥有万元以上仪器设备103台(件)、10万元以上仪器设备11台。