南京审计学院信息科学学院成立于2005年3月，由信息管理系、计算机科学与技术系、电子商务系、计算机公共教学部等教学机构组成，设有始建于2000年、2002年和2001年的信息管理与信息系统专业、计算机科学与技术专业和电子商务专业，还包括IT审计教学与研发中心、注册信息系统审计师（CISA，Certified Information System Auditor）考试培训中心、江苏省实验教学示范中心、职业生涯设计室等科研与教学辅助机构。

　　信息科学学院拥有一支综合素质好、业务水平高、爱岗敬业、实践经验丰富、具有开拓创新精神的教学科研队伍。学院共有教师61人，其中教授 8人、副教授 21人、讲师32人；博士 18人， 博士在读16人。高级职称比例占47.5%，博士和博士在读占55.7%。

　　信息管理系现有专任教师16人。信息管理与信息系统专业2006年被批准为江苏省高等学校特色专业建设点，2009年通过验收，成为江苏省高等学校特色专业。同年，信息管理实验中心被列为江苏省实验教学示范中心建设点。2006年，《管理信息系统》课程被评为江苏省一类精品课程。2010年，《信息系统审计》课程被评为江苏省精品课程。

　　计算机科学与技术系现有专任教师19人。2009年，计算机科学与技术学科被评为南京审计学院重点学科。在相互依存、协调发展的学科体系下，做为学校唯一的工科专业，计算机科学与技术专业培养学生在掌握计算机科学与技术的基本理论、基本知识和基本方法的同时，还初步具备运用计算机技术进行计算机审计的能力。培养方案中，设置了经济、管理等相关课程，在国内率先开设了“计算机审计”、“信息系统审计”等课程，凸显了计算机技术在审计中的应用特色。

　　电子商务系现有专任教师8人。2001年3月，教育部批准我校作为全国首批13所设立目录外电子商务专业的高校之一。2010年6月，聘任国家教育部电子商务专业指导委员会委员李琪教授为我院特聘教授，指导电子商务专业的建设。

　　公共教学部专任教师18人，主要承担全校计算机公共课程的教学任务。现已建成各类专业实验室10个、中心机房1个，总资产超过1000万元，保证了各专业实践教学的需要。

　　信息科学学院成为一个以信息技术为主线，计算机科学与技术、管理信息系统、电子商务、网络经济、IT审计等教学与研究方向相互支撑、相互交叉融合的二级学院，为我校经、管、法、文、理、工等六个学科之间的相互支撑、相互渗透、协调发展创造了条件。我院毕业生专业知识扎实，实践能力和创新能力强，受到社会和用人单位的广泛赞誉。

　　近年来，信息科学学院结合我校“大审计”平台的办学特色，积极开展信息系统审计培训，CISA认证培训500余人，先后举办审计署信息系统审计高级研讨班、培训班多期，培训了大量审计署机关、署驻各地方特派办、派出局、地方审计机构的审计业务人员，有较高的社会声誉和影响力。