会计学院是南京审计学院最早设置的院系之一，始建于1983 年。1993年开始招收第一届会计学专业本科生，1997年开始招收第一届财务管理专业本科生，2004年开始与南京大学联合培养会计学硕士研究生。现有在校本科生2400余名。学院下设会计学系和财务管理系，以及会计模拟基础实验室、财会案例工作室、职业生涯规划设计工作室、对外合作教学部、财务与会计研究所等教学与科研辅助机构。现有会计学、财务管理、国际会计（CGA）、会计学（中澳班）、会计学（CPA）5个专业方向，其中，会计（审计）学为江苏省重点建设学科、“会计学”专业为江苏省特色专业建设点。

　　会计学院拥有一支整体结构较合理，发展潜力大的师资队伍。现有专任及“双肩挑”教师50余人，其中教授、副教授20余人。专任教师中具有博士学位或博士在读的达60%以上。2011年，会计学院荣登中国会计视野网“2011年最具潜力院系”排行榜，在全国583家会计学院、系中，我院名列第八。

　　近年来，会计学院多名教师先后承担完成了省部级以上科研课题20余项，积极参与有关国家标准的编制，承担省有关厅局、大型企事业单位的横向课题，完成专著、编著20余部，在省级以上专业学术期刊上公开发表论文400余篇，其中在《会计研究》、《审计研究》、《中国工业经济》、《财贸经济》等权威期刊发表高质量的学术论文20余篇，获得省部级以上奖项十余项。

　　在教学中，会计学院注重加强对学生的“三基”（基本理论、基本方法、基本技巧）训练，以及在英语和计算机应用能力方面的强化训练，同时在专业课程设置上努力与注册会计师、国外会计教育课程有机对接；注重学生知识、能力、素质的协调发展，认真组织学生积极参加各项课外活动，全面提高学生综合素质，使之成为适应社会发展需要的应用型会计、财务管理专业人才。截止2011年，学院已向社会输送3700余名合格的本科毕业生，绝大部分在国家机关、金融机构及大中型企事业单位就职。历届学生就业率均稳定在 95% 以上。