（近5年，时间由近至远）：
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　　3. 杨允菲*.浅析研究生的知识积累.学位与研究生教育，2005，（4）：39-41.
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　　5. 王俊炜，李海燕，杨允菲*.温带地区4种园林灌木叶片的生长规律. 东北师大学报（自然科学版），2005，37（1）：95~98.
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　　8. 丁雪梅，李海燕，杨允菲*，宋向华.温度对两种野生禾草种子发芽的影响. 草原与草坪，2004, (1):25-29.
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　　10. 邢福，杨允菲*. 松嫩平原野艾蒿无性系种群根茎的年龄结构分析. 草业学报，2004,13（1）：21-25.
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　　12. 刘佩勇，张庆灵，杨允菲*.松嫩平原朝鲜碱茅无性系种群构件生物量结构及相关模型分析. 应用生态学报，2004, 15(4):543-548. Chinese Journal of Applied Ecology
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　　20. 田迅，卜兆君，杨允菲*， 郎惠卿. 松嫩平原湿地植被对生境干－湿交替的响应.湿地科学，2004，2（2）：122-127
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　　24. 杨允菲*.生态学理论的重新梳理与整合——评常杰、葛滢的《生态学》.生态学报，2004，24（2）：245.
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　　31. 李海燕，杨允菲*.松嫩草甸水淹恢复演替过程中羊草和寸草苔无性系种群的相互动态. 草业学报，2004,13（6）：21-25.
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　　42. 周婵，张卓，杨允菲*. 实验羊草种群幼苗对不同梯度盐碱胁迫的生理响应. 东北师大学报自然科学版，2003，35（4）：62~67.
　　43. 田迅，杨允菲*. 西辽河平原不同利用条件下羊草无性系种群结构的研究（简报），应用生态学报，2003，14（3）：465-466.
　　44. 田迅，杨允菲*.不同扰动条件下的羊草种群生物量年龄结构. 草业学报，2003,12（5）：50-54.
　　45. 张剑，田迅，杨允菲*. 林间草地硬质早熟禾无性系分株构件的定量分析.中国草地，2003，25（2）：9-12,17.
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　　61. 杨允菲*.高等学校素质教育的几点思考，高等理科教育，2001，（2）：55-57.
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　　65. 张春华，杨允菲*.松嫩平原光稃茅香种群生殖分蘖株数量特征分析《草业学报》2001，10(3):1-7.
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　　67. 杨允菲*，李建东.松嫩平原寸草苔无性系种群分株的结构，草业学报，2001，10（1）：35-41.
　　68. 杨允菲*,郑慧莹,李建东,放牧干扰对根茎冰草无性系种群年龄结构的影响,植物生态学报, 2001,25(1):71－75。
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　　70. 杨允菲*,祝廷成.不同扰动条件下拂子茅无性系种群的营养繁殖特征。见钟章成：植物种群生态适应机理研究。科学出版社，北京：2000,318－324。
　　71. 杨允菲*,郑慧莹. 松嫩平原假苇拂子茅无性系种群的年龄结构,草业学报, 2000,9(3):8－13。
　　72. 李红，杨允菲*，乔喜波.松嫩平原野大麦无性系分蘖株的年龄结构，应用生态学报，2000,11(3):403－407.
　　73. 杨允菲*,杨利民,张宝田,李建东.东北草原羊草种群结实特性与气候年变化的关系，植物学报, 2000,42(3):294－299.