孙平平
东北师范大学
-->
职　　称：讲师
研究方向：生物信息学
办公电话：
办公地点：东北师范大学信息科学与技术学院219
电子邮件：sunpp567@nenu.edu.cn



个人简历
东北师范大学信息科学与技术学院讲师、硕士生导师。2005年本科毕业于东北师范大学计算机学院，2008年获得东北师范大学计算机学院计算机软件与理论专业硕士学位，2011年获得东北师范大学化学学院物理化学专业博士学位。2017年细胞生物学专业博士后出站。自2005年开始一直从事智能计算及生物信息学等领域的研究。主要研究背景为蛋白质相互作用预测、蛋白交互网络及生物药物辅助设计。承担本科生《编译原理》、《信息技术》课程的教学工作。承担并参与完成国家、省部和市级科研项目十余项。在国际、国内重要学术期刊发表论文30余篇。自2012年起，共指导培养硕士研究生12名。

社会兼职




获奖情况


获奖情况：2013-12-16 吉林省科学技术奖自然科学奖二等奖2013年 吉林省自然科学学术成果奖一等奖


教学信息


教学信息：本科生：编译原理、生物信息学、信息技术1、信息技术2（网络应用基础）研究生：生物信息学


科研信息 （数据来源：科学技术处、社会科学处）


项目：
1. 基于多信息融合的构象性B细胞表位预测模型和算法研究，2018年
论文：
1. Prediction of Protein-Protein Interaction Based on Weighted Feature Fusion，LETT ORG CHEM，2019年
2. A Sequential Segment Based Alpha-Helical Transmembrane Protein Alignment Method，INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL SCIENCES，2018年
3. Protein Function Prediction Using Function Associations in Protein-protein Interaction Network，IEEE ACCESS，2018年
4. Prediction of conformational B-cell epitope binding with individual antibodies using phage display peptides，INTERNATIONAL JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL MEDICINE，2016年
5. A novel conformational B-cell epitope prediction method based on mimotope and patch analysis，J THEOR BIOL，2016年
6. The Relationship Between B-Cell Epitope and Mimotope Sequences，PROTEIN PEPTIDE LETT，2016年
7. Conformational B-cell epitope prediction method based on antigen preprocessing and mimotopes analysis，BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL，2015年
8. Prediction of protein solvent accessibility using PSO-SVR with multiple sequence-derived features and weighted sliding window scheme，BIODATA MINING，2015年
9. PECM: Prediction of extracellular matrix proteins using the concept of Chou’s pseudo amino acid composition，J THEOR BIOL，2014年
10. PSNO: Predicting Cysteine S-Nitrosylation Sites by Incorporating Various Sequence-Derived Features into the General Form of Chou’s PseAAC，INT J MOL SCI，2014年
11. Conformational B-Cell Epitopes Prediction from Sequences Using Cost-Sensitive Ensemble Classifiers and Spatial Clustering，BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL，2014年
12. A Topology Structure Based Outer Membrane Proteins Segment Alignment Method，MATH PROBL ENG，2013年
13. Identification of Protein Pupylation Sites Using Bi-Profile Bayes Feature Extraction and Ensemble Learning，MATH PROBL ENG，2013年
14. Position-Specific Analysis and Prediction of Protein Pupylation Sites Based on Multiple Features，BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL，2013年
15. Bioinformatics Resources and Tools for Conformational B-Cell Epitope Prediction，COMPUTATIONAL AND MATHEMATICAL METHODS IN MEDICINE，2013年
16. Prediction of antigen epitopes on protein surfaces based on support vector machine，Advanced Materials Research，2012年
17. 基因非编码区与转录调控元件的识别研究，生物信息学，2008年
18. 改进的K-mean聚类算法在基因系统发育谱分析中的应用，生物信息学，2008年
19. Application of Improved K-mean Clustering in predicting protein-protein interactions，BioMedical Engineering and Informatic（BMEI2008)，2008年
20. Research of Improved Phylogenetic Profiling Method，Bioinformatics and Biomedical Engineering(ICBBE2008)，2008年
21. Predicting protein-protein interactions based on BP neural network，2007 BIBM IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine，2007年
22. 识别转录因子结合位点的新方法，吉林大学学报（理学版）特刊，2006年