近日，东北地理所大豆功能基因组学学科组通过异速生长数学模型的方法对拟南芥叶片和花瓣器官的形态变异进行了定量描述，并在具有复杂染色体构成的多亲本高级世代互交系（MAGIC line）中解析了拟南芥器官形态变异的遗传基础。
本研究利用由19个亲本相互杂交后形成的稳定遗传的527份拟南芥多亲本高级世代互交系为材料，通过对后代群体的染色体重构，获得了527个株系的染色体片段组成和等位信息。通过构建叶片和花瓣器官形态的点模型，并以此构建形态的异速生长点模型数据库，随后借助主成分分析（PCA）对多维模型数据进行降维分析，获得定量化的不同主效形态二维特征信息。然后，将量化的形态特征与群体等位变异信息结合，通过连锁分析和GWAS分析方法进行遗传解析，获得调控器官形态的28个遗传位点和调控叶片、花瓣器官形态共变异的20个遗传位点。最终，可以重构出19个亲本和527份材料形态差异的定量化的遗传进化路径，为器官形态的重新设计提供重要信息。
图1. 拟南芥叶片和花瓣的数学模拟和遗传解析
A.描述叶片和花瓣形态的点模型；B.拟南芥MAGIC群体中叶片和花瓣形态模型的PCA分析；C.MAGIC群体器官形态的异速生长空间；D.不同叶片形态的最优设计路线，不同颜色的箭头表示不同PC的QTL位点。
中国科学院东北地理与农业生态研究所博士后李新和助理研究员张耀华为论文并列第一作者，杨素欣研究员为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金的资助。（文章链接：https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-020-02758-w）
