应用化学系的前身是动力系电厂化学教研室。1985年6月1日从动力系分离出来建立了应用化学系。1975年开始招收电厂化学专业专科班；1978年恢复全国高等院校统考后开始招收第一届电厂化学专业本科班；电厂化学专业后更名为应用化学，工业分析，1999年又改为应用化学。1987年开始招收第一届化学仪表专业专科班；1999年开始招收第一届检测技术及仪器（化学仪表）专业本科班。

　　应用化学系一九八五年成立时已由一个电厂化学教研室发展成三个教研室，即，水处理教研室，化学仪表教研室和基础教研室。当时的成员有：基础教研室：岳慧灵，王颖全，夏惠兰，孔祥林，曾哓兰，丁愉如，李长久，袁士平，李蕴清，杨哓光，王淑英，王中秋，赵桂云，徐凛然；水处理教研室：李启中，姚继贤，李俊文，吴用利，罗丙清，刘凡清，张万友，陈跃，王德英，周建君，陈桂荣；化学仪表教研室：承慰才，王中甲，滕飞，李永生，杨贵安，何乃庆，高经武，张卫红，潘宏泽，杨震。

　　1978-1985年期间的电厂化学教研室领导成员：主任李启中，副主任姚继贤。1985-1989年应用化学系的领导成员：主任李启中，副主任姚继贤、承慰才，总支书记韩书林，副书记夏惠兰。1989-1998年应用化学系的领导成员：主任李俊文，副主任袁斌，总支书记张久春，1998-1999年应用化学系的领导成员：副主任袁斌（主持工作），杨哓光，总支书记郭显富，2000-2003年应用化学系的领导成员：主任李永生，副主任杨哓光，总支书记郭显富，2003至今，应用化学系的领导班子：党总支书记郭显富，第一副主任孙墨杰，第二副主任刘景明，党总支副书记王琦。

　　我系现有应用化学、测控技术与仪器、环境工程、生物工程以及轻化工程五个专业，一个应用化学研究所，有基础化学、水净化、化学仪表及仪器、环境、生物、轻化工程6个研究室、47个实验室。1997年被国务院学位委员会批准具有应用化学硕士学位授予权；2001年应用化学学科被吉林省定为重点建设学科。目前正在筹建多个学科研究中心，其建成后综合水平将争取达到国内领先水平；现有在校本科生780名，22个班级，研究生29名，明年在校本科生人数将达到1090人；已毕业的本科生935名，专科生242名，研究生51名，函授生980名；现有教工49人，教授和副教授20人，高工10人，硕士8人，博士5人，博士后2人（其中1人为海外留学归来），还有4人正在攻读博士学位；全系发表科研论文被国际权威SCI收录12篇，占全院首位。