药学院是我校重点教学单位，是吉林省中药学、药学类高等专门人才培养基地。1959年设中药学专业，1978年开始招本科生，现有5个本科专业，1个博士学位授权点，4个硕士学位授权点；教授12人，副教授24人，博士、硕士研究生导师17人，其中中药学学科为吉林省政府重点支持的重点学科，有国家科技部重点实验室1个，国家中医药管理局三级实验室4个、二级实验室7个，吉林省卫生厅重点学科3个，吉林省优秀课程7门，校优秀课程13门。
　　
　　药学院拥有实验教学大楼7200平方米，仪器设备总值1300余万元，其中进口的大型精密仪器设备100多台件。标本中心收藏药用动物标本1100多种，万余号，居全国同类标本室之首。药学院承担科研课题110项，教学研究课题18项，4项在国家获奖。
　　
　　药学院近年来与北京、上海、广州、大连等省内外十余家医药企事业单位建立长期的教学实习基地关系。近5年一次就业率均为100％，而且供不应求，每年有近40％的毕业生考入相关院校攻读硕士，近50％的硕士研究生考入北京大学等高校攻读博士。药学院为有志从事药学事业的学子们提供了一方沃土。
　　
　　博士学位授权点：中药学
　　
　　硕士学位授权点：中药学、生药学、药理学、药物分析学
　　
　　本科专业设置：中药学、药学、制药工程、公共事业管理（药事管理方向）、市场营销（药品营销方向）