中南大学生命科学学院导师教师师资介绍简介-陈超

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本站小编 Free考研考试/2021-08-20

研究员博士生导师硕士生导师
入职时间：2014-01-14
所在单位：生命科学学院
职务：副院长
学历：博士研究生毕业
办公地点：长沙市开福区湘雅路110号
性别：男
联系方式：Email: chenchaor@gmail.com Fax: (86731) **
学位：博士学位
在职信息：在职
主要任职：生命科学学院副院长
毕业院校：复旦大学
学科：生物学

曾获荣誉：
中南大学升华猎英计划；湖南省青年骨干教师计划；中南大学第二批创新驱动计划；美国人类遗传学会Charles J. Epstein 奖，世界精神遗传学会Hugh Gurling奖，北美华人遗传学会杰出报告奖

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个人简介陈超，博士，研究员，博士生导师，国家优青，中南大学升华****，生命科学学院副院长。主要研究方向为人脑组织的基因表达调控和精神类疾病的致病机制。以解读精神类疾病的遗传机制为目标，利用生物信息，机器学习的分析方法，以及细胞模型类脑模型的实验手段，从DNA甲基化、基因表达等不同层面，系统而深入地研究精神疾病相关的遗传变异的精准基因定位和分子功能。在Science, Science Translational Medicine（2篇），Molecular Psychiatry（7篇），Bioinformatics 等杂志发表论文30余篇，其中以第一或通讯作者（含并列）发表Science Translational Medicine（2篇），Molecular Psychiatry（4篇）等论文。主持国家自然科学基金委优秀青年科学基金1项，面上基金项目2项，青年科学基金1项和中南大学创新驱动项目2项。以主要成员身份参与科技部重点专项“重大慢性非传染性疾病防控研究” 1项。
以主要成员身份参与了PsychENCODE，BSNIP等国际重大科学计划，多次受邀在国际人类遗传协会年会，美国人类遗传协会年会，世界精神遗传协会年会和美国神经精神药理学会年会等高水平国际学术会议做学术报告。同时指导学生参加高水平国际会议并作报告，先后获得包括美国人类遗传学会Charles J. Epstein 奖（2017，2018），世界精神遗传学会Hugh Gurling奖（2016，2018），北美华人遗传学会杰出报告奖（2017，2018）等国际知名会议的重要奖项。
主要的研究方向是1）人脑遗传表达调控异常和神经精神疾病的关系，主要是人脑中DNA甲基化，非编码RNA等多组学的调控与精神分裂症，双相情感障碍，老年痴呆症等的关系；2）对大规模多组学数据的算法研究，利用人工智能、机器学习的方法分析健康大数据。包括复杂多基因疾病进行多层次数据的网络整合，利用基因表达数据挖掘疾病特征标志物的研究等；3）结合类脑模型，开展与人脑发育和精神神经遗传病相关的表型组学研究。

教育经历 [1] 2001.9-2005.6
云南大学理学学士学位 | 大学本科毕业
[2] 2005.9-2011.6
复旦大学理学博士学位 | 博士研究生毕业
[3] 2008.10-2010.10
美国芝加哥大学 | 生物信息学博士研究生结业
[4] 2011.7-2013.11
美国伊利诺伊大学芝加哥分校 | 精神病系博士后

工作经历 [1] 2019.9-至今
中南大学 | 生命科学学院 | 研究员

[2] 2014.2-2019.8
中南大学 | 生命科学学院 | 副研究员

[3] 2008.10-2010.10
芝加哥大学 | 精神病学和行为神经科学系 | 研究助理

[4] 2006.9-2007.7
复旦大学 | 生命科学学院遗传 | 教学助理

社会兼职 [1]2019.5-至今
中国遗传学会青年委员会委员
[2]2019.4-至今
湖南省遗传学会常务理事
[3]Molecular Psychiatry，Biological Psychiatry 等杂志特邀审稿人

研究方向 [1]精神神经类疾病的遗传学与表观遗传学

[2]人脑组织调控，类脑开发和多组学研究

[3]计算生物学与医学信息学

其他联系方式 [1]传真：

团队成员 团队名称：医学遗传学研究中心
神经精神遗传与表观遗传实验室

博士：
王斐然，闵诗诗，王乐，唐海燕，张文雕，梁秋曼

硕士：
余佩，周佳琪，王旋，唐龙飞，韩聪，张楠

具体包括人脑中不同脑区，不同细胞，以及不同发育阶段的基因表达机制，以及表观遗传，如甲基化，miRNA，LncRNA等在其中的作用。人脑对人类来说仍然是神秘的，人脑的调控机制我们了解有限。
主要利用生物信息学和遗传学的手段，从最基本的生物调控机制入手，揭示人类大脑的基因表达调控机制.

2.精神和神经疾病的遗传机制

团队成员一直致力于发掘精神分裂症，双相情感躁郁症，等高遗传度常见疾病的遗传因素，最近的研究也涉及老年痴呆等神经类疾病。针对神经精神疾病脑源性的理论，我们直接从死亡个体脑组织的基因表达数据入手，构建基因共表达网络，通过检测患者脑中是否存在特定基因网络/模块表达水平的变化，寻找与疾病有关的生物标记，从多基因相互作用的角度挖掘精神分裂症的致病机制。最终我们发现两组基因网络—Notch2基因为中心的神经发育网络和金属硫蛋白家族基因MT1X为中心的免疫反应网络，在精神分裂症患者中高表达，表明其精神分裂症的发病机理中的重要作用。通过进一步结合基因组关联分析，我们发现以Notch2基因为中心的网络富集与精神分裂症显著关联的遗传信号，提示该基因网络受到遗传因素的影响，位于精神分裂症相关调控机制的上游。该工作发表在Nature子刊Molecular Psychiatry杂志。
在此基础上，我们进一步挖掘转录因子和小分子RNA在人脑表达调控网络中的作用。通过整合全基因组水平的小分子RNA表达数据，mRNA表达数据，以及转录因子的信息，我们发现miRNA-320e参与调控与精神疾病相关的表达模块，进一步的实验表明这种调控是通过影响POU2F1, PAX6和EPAS1等转录因子的表达而实现的。

3.人类行为主要是节律相关的行为的研究

探索节律调控的基因表达和遗传机制，以及节律紊乱在精神疾病中可能的作用。精神类疾病的临床研究发现精神类疾病的患者往往存在睡眠障碍，焦虑，情绪失调等表型。节律调控的紊乱在其中可能起到了重要的作用。此外节律基因作为转录因子具有调节其他的靶基因使其表达呈现节律的特性。经典的节律基因是实验验证的与节律变化相关的18个基因，经典节律基因通过结合目标基因的启动子区域的E-box，D-box等顺式调控元件来调控对目标基因的表达8。广义的节律基因是指基因表达水平在24小时内呈现周期性的变化的基因。基于这些事实，我们拟利用共表达的方法获得节律基因调控相关的基因网络，挖掘该网络中潜在的新的节律调控基因，以及被调控基因的启动子区域的特征。同时将这些基因和相关调控区域与全基因组关联获得的位点联系，是否这些位点显著富集于节律基因相关的调控区域。

4.生物信息分析相关软件的开发

实验室在精神疾病的遗传分析，基因表达数据的分析等方面进行了一系列有针对性的流程开发，算法优化，以及数据库建设。

5.探究运动锻炼对基因的表达及基因的表观遗传学的影响

通过广泛深入地搜索、挖掘与分析不同的运动计划的运动前后基因表达数据以及运动员群体的基因表达数据，利用生物信息学方法探究运动对基因表达的影响

研究员博士生导师硕士生导师
入职时间：2014-01-14
所在单位：生命科学学院
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学历：博士研究生毕业
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性别：男
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学位：博士学位
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主要任职：生命科学学院副院长
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学科：生物学

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招生当前位置: Chen Chao >> 招生
实验室具体的研究方向有:
1. 人脑的表达调控和表观遗传学研究。具体包括人脑中不同脑区，不同细胞，以及不同发育阶段的基因表达机制，以及表观遗传，如甲基化，miRNA，LncRNA等在其中的作用。
2. 精神和神经疾病的遗传机制。一直致力于发掘精神分裂症，双相情感躁郁症，等高遗传度常见疾病的遗传因素，最近的研究也涉及老年痴呆等神经类疾病。
3. 人类行为主要是节律相关的行为的研究。探索节律调控的基因表达和遗传机制，以及节律紊乱在精神疾病中可能的作用。
4. 生物信息分析相关软件的开发。实验室在精神疾病的遗传分析，基因表达数据的分析等方面进行了一系列有针对性的流程开发，算法优化，以及数据库建设。

导师需求：

招收从硕士到博士后各个层次的学生。博士以下在中南大学培养。博后有美国纽约大学上州医学分校和中南大学两种选择。

1.我们期待的学生能够对科学充满好奇心，踏实刻苦，同时充满利用自身所学，推动人类在相应学科的认识的强烈欲望。有批判性思维、逻辑思维和创造性思维，有较好的沟通表达能力、写作能力和组织领导、执行能力。积极主动，能提出问题并解决问题。较高的英文读写能力也是必须的。
2.感兴趣精神、行为科学的尤佳。
3.我们对学生本科学校和专业不做特定要求。目前实验室有生物学、医学、计算机和数学专业背景的学生在实验室就读。实验室同时具备湿性实验和干性实验的实验条件，能够根据学生的特点和意愿，侧重安排需要分子生物学实验的课题或者侧重信息学分析的课题。但我们要求所有学生都有对数据的敏感性，能独立使用至少一种计算机语言处理大规模的数据。有较强统计基础为佳。

我们可以提供：
1.为本科生自由创新项目、毕业设计提供平台与指导。
2.为中学生提供实习、参观的机会。
3.为研究生提供课题实施平台。根据学生自身的条件与需求，我们也可以进行出国推荐及名校联合培养推荐。

你将收获：
1.知识：丰富的遗传学及分子生物学知识，复杂疾病认识，生物信息学知识。
2.技能：实验操作技能，大规模组学数据处理能力，国际交流能力，实验室管理能力。
3.思维：批判性思维，系统性思维和逻辑思维。

我们的联系方式：
1.地址：湖南长沙湘雅路110号邮编：410078
2.邮箱：chenchao@sklmg.edu.cn
3.办公电话：

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[1]Ding Chaodong, Chunling Zhang, Richard Kopp, Liz Kuney, Qingtuan Meng, Le Wang, Yan Xia, Yi Jiang, Rujia Dai, Shishi Min, Wei-Dong Yao, Ma-Li Wong, Hongyu Ruan*, Chunyu Liu*, Chao Chen*, Transcription factor POU3F2 regulates TRIM8 expression contributing to cellular functions implicated in schizophrenia: Molecular Psychiatry, 2020
[2]Meng Qingtuan, Wang Le, Dai Rujia, Wang Jiawen, Ren Zongyao, Liu Sihan, Xia Yan, Jiang Yi, Duan Fangyuan, Wang Kangli, Liu Chunyu*, Chen Chao*, Integrative analyses prioritize GNL3 as a risk gene for bipolar disorder: Molecular Psychiatry, 2020
[3]Wang Le#, Xia Yan#, Dai Rujia, Chen Yu, Qiu Wenying, Chen Chao, Brain Banks Spur New Frontiers in Neuropsychiatric Research and Strategies for Analysis and Validation: Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2019
[4]Yan Xia, Rujia Dai, Kangli Wang, Chuan Jiao, Yuchen Xu, Honglei Li, Xi Jing, Yu Chen, Chao Chen*, Chunyu Liu*, Sex-differential DNA methylation and associated regulation networks in human brain implicated in the sex-biased risks of psychiatric disorder. Molecular Psychiatry, 2019
[5]Qingtuan Meng, Kangli Wang, Tonya Brunetti, Yan Xia, Chuan Jiao, Dominic Fitzgerald, Chao Chen*, Chunyu Liu*, The DGCR5 long noncoding RNA may regulate expression of several schizophrenia-related genes: Science Translational Medicine, 2018
[6]Chao Chen*, Qingtuan Meng, Yan Xia, Chaodong Ding, Lijun Cheng, Preethi Gunaratne, Chunyu Liu*, The transcription factor POU3F2 regulates a gene coexpression network in brain tissue from patients with psychiatric disorders: Science Translational Medicine, 2018
[7]Chuan Jiao, Lingling Huang, Rujia Dai, Yu Wei, Cuihua Xia, Jiacheng Dai, Yan Xia, Liu Yi, Chunyu Liu*, Chao Chen*, BrainEXP: A novel database under construction featuring with spatiotemporal expression variations and co-expression organizations in human brains. Bioinformatics [J]: Bioinformatics, 2018
[8]Chuan Jiao, Zhang C, Dai R, Xia Yan, Wang Kangli, Giase Gina, Chen Chao*, Liu Chunyu*, Positional effects revealed in Illumina Methylation Array and the impact on analysis. Epigenomics [J]: Epigenomics, 2018, 10 (5) : 643-659
[9]Kay Grennan#, Chao Chen#, Elliot Gershon, Chunyu Liu, Network analysis of molecular pathway and psychotic diseases. Bioessays, 2014
[10]Liu C., Gershon ES, Chen H-Y, Sweeney JA, Bishop JR, Reilly JL, Cheng L, Zhang C, C Chen, Correlation between DNA methylation and gene expression in the brains of patients with bipolar disorder and schizophrenia Bipolar Disorders, 2014

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2019年中国上海全球华人遗传学大会
分组报告“Multi-omics analysis on human brain and psychiatric diseases”
2019年中国长沙人类遗传资源库建设规范化培训会议

主题报告“运用生物信息技术与医学遗传资源开展基础研究”

2019年中国广州中华医学会第十八次全国医学遗传学学术年会
主题报告“人脑多组学调控与精神疾病”
2019年中国成都第六届全国计算生物学与生物信息学学术年会
分组报告“人脑多组学调控与精神疾病”
2018年中国长沙生物工程学会学学术年会暨生物技术大会
分组报告“常见精神疾病的遗传机制与人脑表达调控研究”

2017年中国张家界长江中游四省遗传学会2017年学术联会
分组报告“Risperidone-induced DNA methylation alterations in first-episode drug-naïve schizophrenia patients and their relation with neuroimaging and cognitive phenotypes”

2016年中国无锡第三届中国精神遗传峰会

主题报告“CascadeTF-miRNA-mRNAregulationsidentifiedbyco-expressionnetworkmodulesinpsychoticbrains”
2016年日本东京第十三届国际人类遗传年会

分组报告“CascadeTF-miRNA-mRNAregulationsidentifiedbyco-expressionnetworkmodulesinpsychoticbrains”
2014年丹麦第二十三届世界精神病遗传年会
分组报告“Interactome networks and psychiatric disorders”
2012年美国费城第六十七届生物精神病年会
受邀报告“Two Gene Co-expression Modules Robustly Differentiate Schizophrenia Patients and Normal Controls”
2011年美国华盛顿第十九届世界精神病遗传年会
受邀报告“Co-expression modules in Schizophrenia Postmortem Brains”；
2009年美国圣地亚哥第十七届世界精神病遗传年会
受邀报告“Correlations between gene expression and DNA methylation in human brain”；
2012年美国芝加哥芝加哥大学精神病系研究论坛
受邀报告“Gene expression networks in Schizophrenia Brain”；
2011年加拿大蒙特利尔第十二届国际人类遗传年会
报告“Metallothionein Gene Family Co-expression Module Is Differentially Expressed in Multiple Studies of Schizophrenia Postmortem Brains”；
2012年伊利诺伊大学芝加哥分校第三届科研论坛
报告“DNA methylation correlates with gene expression differently across tissues”