李彩

Submitted on 周五, 12/06/2019 - 15:12


性别
男

个人主页
https://caililab.org

电子邮件
licai@mail.sysu.edu.cn

职称
教授

导师类型
博士生导师

学科方向
0710生物学-07遗传学
0710生物学-Z1生物信息学


研究方向
实验室研究方向为整合多组学数据研究基因组调控与基因组演化的相互影响。研究对象以脊椎类动物为主，并涉及部分非脊椎类模式生物。
近几年将主要围绕以下三个问题开展研究：
（一）基因组调控元件如何起源及演化（如转录、复制等相关的调控元件）；
（二）DNA 的 de novo 突变在基因组中如何分布及突变产生的分子机制；
（三）基因组调控及演化的分子机制如何影响生物多样性或人类疾病；
更多研究相关信息见课题组网站 https://caililab.org。
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课题组招收生物信息学相关的博士后、博士生和硕士生，也欢迎本科生到课题组实习或做毕业设计。
生物信息方向（硕/博士研究生）
a）专业背景不限，对生物信息学、基因组学和生物演化有浓厚兴趣；
b）具有较强的独立思考能力、自我管理能力和团队协作能力；
c）数理基础较好或有较多编程经验者优先考虑；
d）有科研项目或竞赛经验者优先考虑。
课题组非常注重每位成员的个人发展，根据成员的背景和兴趣制定不同的培养计划。期待独一无二的你加入团队！

个人经历
2019年作为“****”引进人才加入中山大学。2009年获华中科技大学学士学位，2015年获丹麦哥本哈根大学博士学位，之后在英国弗朗西斯?克里克研究所（Francis Crick Institute）从事博士后工作。并曾在华大基因研究院工作，担任项目组长。一直从事基因组学和计算生物学相关研究，研究重点为通过整合大规模组学数据揭示基因组的功能和演化规律。代表性工作发表于Science、Nature Communications、Genome Research 等知名期刊。

承担课题
国家自然科学基金面上项目 （2021-2024），主持
中山大学“****”引进人才启动经费 （2020-2021），主持

论文专著
代表性论文（#通讯作者； *共同一作）
Chia M*, Li C*, Marques S, Pelechano V, Luscombe NM, van Werven FJ. High-resolution analysis of cell-state transitions in yeast suggests widespread transcriptional tuning by alternative starts. Genome Biology 2021;22(1):34. Link
Li C^#, Luscombe NM. Nucleosome positioning stability is a modulator of germline mutation rate variation across the human genome. Nature Communications. 2020;11(1):1363. Link
Li C^#, Lenhard B, Luscombe NM. Integrated analysis sheds light on evolutionary trajectories of young transcription start sites in the human genome. Genome Research. 2018;28(5):676-88.Link
Seki R*, Li C*, Fang Q, Hayashi S, Egawa S, Hu J, et al. Functional roles of Aves class-specific cis-regulatory elements on macroevolution of bird-specific features. Nature Communications. 2017;8:14229. Link
Zhang G*, Li C*, Li Q, Li B, Larkin DM, Lee C, et al. Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation. Science. 2014;346(6215):1311-20. Link
Terrapon N*, Li C*, Robertson HM, Ji L, Meng X, Booth W, et al. Molecular traces of alternative social organization in a termite genome. Nature Communications. 2014;5:3636. Link
Li C*, Zhang Y*, Li J*, Kong L*, Hu H, Pan H, et al. Two Antarctic penguin genomes reveal insights into their evolutionary history and molecular changes related to the Antarctic environment. GigaScience. 2014;3(1):27. Link
Kocher SD*, Li C*, Yang W, Tan H, Yi SV, Yang X, et al. The draft genome of a socially polymorphic halictid bee, Lasioglossum albipes. Genome Biology. 2013;14(12):R142. Link
Yan G*, Zhang G*, Fang X*, Zhang Y*, Li C*, Ling F*, et al. Genome sequencing and comparison of two nonhuman primate animal models, the cynomolgus and Chinese rhesus macaques. Nature Biotechnology. 2011;29(11):1019. Link
Nygaard S*, Zhang G*, Schi?tt M*, Li C*, Wurm Y, Hu H, et al. The genome of the leaf-cutting ant Acromyrmex echinatior suggests key adaptations to advanced social life and fungus farming. Genome Research. 2011;21(8):1339-48. Link
最新论文列表见Google Scholar https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=tJ1YzXIAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
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