郑凌伶

Submitted on 周一, 10/30/2017 - 21:13


性别
女

工作电话
**

电子邮件
zhengll33@mail.sysu.edu.cn

职称
副教授

导师类型
博士生导师

学历
博士

学科方向
0710生物学-10生物化学与分子生物学
0710生物学-Z1生物信息学


研究方向
功能基因组学与生物信息学
非编码RNA调控网络与重大疾病
高通量测序数据分析与应用
病原体-宿主之间的相互作用网络

个人经历
2020.05-至今 中山大学学生科技创新发展中心 主任
2019.10-至今 中山大学青年教师专职辅导员
2017.01-2020.10 中山大学生物工程中心党支部书记
2017.01-至今?? 中山大学生命科学学院? 副教授
2012.07-2016.12?? 中山大学生命科学学院? 讲师
2009.09-2012.06? 中山大学生命科学学院 生物化学与分子生物学 ?博士（导师屈良鹄教授）
2006.09-2009.06? 中山大学生命科学学院 信息生物学? 硕士（导师王珣章教授）
2002.09-2006.06? 东北林业大学 计算机系 本科

讲授课程
《细胞生物学实验》（国家精品课程）、《基因组学》、《计算机在生物工程中的应用》、《计算机程序设计语言》
2014.2016两年本科生评教全校排名第一
2018年获全国高校（生命科学类）微课教学比赛一等奖、教学风采奖
2018年获广东省青年教师授课大赛理工组二等奖
2018年获中山大学青年教师授课大赛理工组二等奖
2015年获全国高校（生命科学类）微课教学比赛一等奖、教学风采奖
2017年6月获中山大学青年教师授课大赛理工组二等奖
2014年获中山大学温氏****奖教金
2013-2015年获IGEM(国际基因工程机器设计大赛)?最佳软件项目奖（Best Software Project）及金奖（Gold）

学术成就
长期致力于利用计算生物学方法研究非编码RNA的功能及其在重大疾病中作用的研究，在国际杂志上发表论文23篇，其中1篇文章受到Science编辑点评，1篇文章入选ESI高被引论文。目前主要采用多维高通量组学技术研究病原生物-宿主之间的相互作用网络。建立了全面的非编码RNA数据库deepBase 2.0，dreamBase，ColorCells, exomiR-Explorer等，并开发了专门从高通量测序数据中挖掘tRNA Fragment的工具。代表性成果发表在NAR、PNAS、Briefings in bioinformatics等多个专业领域杂志上。获得多项国家自然科学基金的资助，包括青年基金、面上项目等，同时还获得了 “广州市珠江科技新星”项目资助。多次受邀在重要国内学术会议上进行大会报告，并获得“第十届全国核糖核酸（RNA）学术讨论会”优秀青年学术报告奖。担任NAR，BMC Biology，Science China Life Science 等杂志的审稿人，主笔撰写《RNA 研究中的重大科学问题-学科发展战略系列研究报告》、《非编码基因生物学研究进展（生物化学与分子生物学学科发展报告）》等。

承担课题
主持项目：
国家自然科学基金、原生生物miRNA的系统鉴定与起源分析、郑凌伶（25万）
国家自然科学基金、tRNA衍生的小RNA在癌症中的表达及其介导的调控网络研究、郑凌伶（65万）
广州市科技计划、基于高通量测序数据研究寄生虫非编码基因的种类、特征及功能、郑凌伶（30万）
国家重点实验室、SARS-CoV-2病毒感染引起的宿主转录组及小RNA组特异性分子筛查研究（10万）
参与项目：
国家重点研发计划、新型长链非编码RNA(lncRNA)-蛋白质机器介导的表观 、陈月琴（934万）
国家自然科学基金、Wnt/β-catenin信号通路中microRNA的表达调控及功能研究、屈良鹄（299万）
国家自然科学基金、自然和人工诱导布氏锥虫分化的分子机理 、伦照荣（89万）
国家自然科学基金、基于机器学习的生物医学大数据挖掘理论与方法研究 、戴道清 （450万）
国家自然科学基金、植物生殖发育相关的长链非编码RNA功能与调控机制 、陈月琴（290万）
广州市科技计划项目、非编码RNA基因资源的发掘与利用 、屈良鹄（165万）
广州市科技计划项目、microRNA及其靶向的蓝铜蛋白调控水稻产量的作用机制和应用研究 、陈月琴（165万）
珠海市科技计划项目、基于双转录组分析技术筛选新型冠状病毒感染的特异性分子标志物及其功能 研究（7万）

论文专著
期刊论文：
Ling-Ling Zheng, Jing-Hua Xiong, Wu-Jian Zheng, Jun-Hao Wang, Zi-Liang Huang, Zhi-Rong Chen, Xin-Yao Sun, Yi-Min Zheng, Ke-Ren Zhou, Bin Li, Shun Liu, Liang-Hu Qu and Jian-Hua Yang. ColorCells: A database of expression, classification and functions of lncRNAs in single cells. Briefings in Bioinformatics, bbaa325, 14 December 2020.
Fangzhou Xie, Shurong Liu, Junhao Wang, Jiajia Xuan, Xiaoqin Zhang*, Lianghu Qu*, Lingling Zheng*, Jianhua Yang*. deepBase v3.0: expression atlas and interactive analysis of ncRNAs from thousands of deep-sequencing data. Nucleic Acids Research, gkaa1039, 11 November 2020.
郑凌伶，戚益军，屈良鹄. 走向国际前沿的中国RNA研究. 《中国科学:生命科学》 2019年10期
郑凌伶. “真凶密码—DNA指纹图谱制作思路”微课教案. 高校生物学教学研究, 2019,9(1):5-6.
Ling-Ling Zheng, Yi-Jun Qi, Liang-Hu Qu. Chinese RNA research leading to the international science and technology frontier. Sci Sin Vitae, 2019, 49: 1323–1335
Ling-Ling Zheng, Ke-Ren Zhou, Shun Liu, Ding-Yao Zhang, Ze-Lin Wang, Zhi-Rong Chen, Jian-Hua Yang, Liang-Hu Qu. dreamBase: DNA modification, RNA regulation and protein binding of expressed pseudogenes in human health and disease. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D85-D91. ?
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?主要论著
Ling-Ling Zheng, Jian-You Liao, Yan-Zi Wen, Geoff Hide*, Liang-Hu Qu* and Zhao-Rong Lun*.Different Types of Small RNAs in Protozoa. Springer.2016.(ISBN: 978-3-319-39494-7).
会议论文：
Ling-Ling Zheng and Liang-Hu Qu. High-throughput analysis of small RNAs reveals the existence and dramatic changes of ncRNAs during different Trypanosoma brucei?developmentally regulation stages. 2010, The Sixth National Symposium on Ribonucleic Acid (RNA), Guangzhou, China
郑凌伶，屈良鹄 计算RNA组学分析平台在真核生物非编码RNA及比较转录组学研究中的应用.2012，The Seventh National Symposium on Ribonucleic Acid (RNA), Chengdu, China
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