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汕头大学基础医学研究所导师教师师资介绍简介-东庚教授

本站小编 Free考研考试/2021-05-29




个人简介


东庚教授,1987年生,理论化学专业,瑞典隆德大学博士,教授,博导;汕头大学医学院基础医学研究所医学信息学研究中心主任,计算生物学课题组组长。

东庚教授,带领实验室团队,在医学院多年对肿瘤研究特别是食管癌研究的背景下,发挥个人研究特长,对肿瘤相关蛋白进行理论研究。研究方向包括,1)与肿瘤相关的蛋白的结构-功能关系,2)小分子与蛋白相互作用的研究,3)蛋白-蛋白相互作用的研究;作为负责人,承担国家自然科学基金青年基金项目1项。作为通讯作者第一作者,在JCAS,Chem. Sci. 和ACS Catal.等主流学术期刊杂志上发表研究论文15篇;指导及协助指导硕士生7人,博士生4人。


代表性研究论文(#共同第一作者,*通讯作者或共同通讯作者)


1. Dong G, Quan Manh Phung,Kristine Perloot, Ryde U.* Reaction mechanism of [NiFe] hydrogenase studied by computational methods. Inorg. Chem. 2018, 57, 15289-15298.
2. Dong G, Ryde U, Jensen HJA. Hedeg?rd ED.* Exploration of H2 binding to the [NiFe] hydrogenase active site with multiconfigurational density functional theory. Phys. Chem. Chem. Phys. 2018, 20, 794-801.
3. Dong G*, Cao L, Ryde U. Insight into the reaction mechanism of lipoyl synthase: A QM/MM study. J. Biol. Inorg. Chem. 2018, 23, 221-229.
4. Dong G, Ryde U.* Reaction mechanism of formate dehydrogenase studied by computational methods. J. Biol. Inorg. Chem. 2018, 23,1243-1254.
5. Dong G, Phung QM, Hallaert SD, Pierloot K, Ryde U.* H2 binding to the active site of [NiFe] hydrogenase studied by multiconfigurational and coupled-cluster methods. Phys. Chem. Chem. Phys. 2017, 19, 10590-10601.
6. Dong G, Ryde U.* Effect of the protein ligand in DMSO reductase studied by computational methods. J. Inorg. Biochem. 2017, 171, 45-51.
7. Dong G, Lu J, Lai W.* Insights into the mechanism of aromatic ring cleavage of noncatecholic compound 2-aminophenol by aminophenol dioxygenase: a quantum mechanics/molecular mechanics study. ACS Catal. 2016, 6, 3796-3803.
8. Dong G, Ryde U.* Protonation states of intermediates in the reaction mechanism of [NiFe] hydrogenase studied by computational methods. J. Biol. Inorg. Chem. 2016, 21, 383-394.
9. Ignjatovic? MM, Caldararu O, Dong G, Mu?oz-Gutierrez C, Adasme- Carre?o F, Ryde U.* Binding-affinity predictions of HSP90 in the D3R Grand Challenge 2015 with docking, MM/GBSA, QM/MM, and free-energy simulations. J. Comput. Aided Mol. Des. 2016, 30, 707-730.
10. Wang B,* Lu J, Dubey KD, Dong G, Lai W,* Shaik S.* How do enzymes utilize reactive OH radicals? Lessons from nonheme HppE and fenton systems. J. Am. Chem. Soc. 2016, 138, 8489-8496.
11. Dong G*, Ryde U. O2 activation in salicylate 1, 2-dioxygenase: A QM/MM study reveals the role of His162. Inorg. Chem. 2016, 55, 11727-11735.
12. Cao L, Dong G, Lai W.* Reaction mechanism of cobalt-substituted homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase: A QM/MM Study. J. Phys. Chem. B 2015, 119, 4608-4616.
13. Dong G, Lai W.* Reaction mechanism of homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase with 4-nitrocatechol: Implications for the role of substrate. J. Phys. Chem. B 2014, 118, 1791-1798.
14. Dong G, Shaik S, Lai W.* Oxygen activation by homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase: a QM/MM study reveals the key intermediates in the activation cycle. Chem. Sci. 2013, 4, 3624-3635.
15. Lai W,* Cao R, Dong G, Shaik S, Yao J,* Chen H.* Why is cobalt the best transition metal in transition-metal hangman corroles for O–O bond formation during water oxidation? J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 2315-2319.


主要的科研项目





作为主讲教师之一讲授的主要课程












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