中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室成立于2008年12月，其前身为中国科学院微生物研究所病毒学研究室。其战略定位为：面向国家战略需求，开展重要病原微生物与免疫生物学的基础与应用基础工作，着重于动物源性病原跨种间传播、分子进化研究，揭示病原-宿主相互作用的分子机制，为传染病防控与免疫生物学发展提供基础性、前瞻性的技术与理论支撑，坚持源头创新，推动相关技术产业发展。

　　人员组成：
　　名誉主任：田　波　院士
　　主　任：高　福　研究员
　　副 主 任：刘文军　研究员　高　斌研究员　张立新研究员

　　目前重点实验室共由18个研究组组成，现有院士1名、研究员15名，副研究员7名，固定人员共54名，其中包括有青年****1名，百人计划11名，国家杰出青年获得者2名，外籍教授1名。

　　研究方向：
　　1.禽流感、猪链球菌等动物源性病原分子进化及跨种间传播机制。
　　2.动物源性病原与宿主相互作用、免疫应答与T细胞识别机制及新型抗感染药物
　　3.结核杆菌、乙肝病毒侵染机理、致病机制及治疗研究。
　　4.抗病毒免疫的信号转导通路、病毒诱发肿瘤的分子机制与肿瘤免疫学。

　　代表性成果：
　　1.禽流感病毒分子进化及跨种间传播机制
　　2.囊膜病毒侵入机制及病毒融合抑制剂
　　3.gp96的免疫功能和乙肝治疗
　　4.猪链球菌基因组学及致病机制