删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)

精仪系欧阳证团队发文报道单细胞精细脂质组学技术

本站小编 Free考研考试/2021-12-20

清华新闻网5月18日电 5月17日,清华大学精密仪器系质谱研究团队发文报道基于质谱的单细胞脂质组精细结构表征技术,实现了哺乳动物单细胞内脂质的大规模精细结构分析,解决了单细胞质谱领域长期面临的关键技术挑战。基于单细胞内多种类型脂质异构体的鉴定与相对定量,该团队实现了野生型非小细胞肺癌(HCC827)细胞群体中耐药细胞的精准识别,对癌症的精准诊疗具有重要意义。
随着人口老龄化和生活方式的转变,癌症已经成为威胁人类健康的主要因素。近年来,面向癌症的个体化、精准治疗蓬勃发展,而实现癌症精准治疗的关键在于根据癌症发生的部位、临床病理、基因突变和免疫特性等全面、准确对癌症进行分类,并评估组织中癌细胞的异质性。单细胞分析是研究细胞异质性生物学过程的关键技术,对生物学基础研究,疾病标志物筛查及新药研发等均有着重要意义。相对单细胞基因组、转录组和蛋白组分析,单细胞脂质组分析起步较晚,面临诸多技术挑战。脂质数量庞大,结构复杂,单细胞层面的脂质结构表征和定量分析仍面临诸多难点。

图1.单细胞脂质组精细结构表征技术。(a)单细胞脂质精细结构解析流程图,(b)基于电迁移和液滴辅助电喷雾(DAESI)的单细胞质谱分析。
质谱仪因其高灵敏度、高特异性和准确定量能力,已成为单细胞脂质组分析的主要技术。本研究利用自由基诱导解离、光化学衍生与多级质谱,结合细胞固定、细胞电迁移和按需电喷雾离子化等手段,发展了单细胞脂质组精细结构表征技术,在单细胞水平上实现了哺乳动物细胞中脂质的按需、高灵敏度检测,并获得了脂质脂肪酸链(fatty acyl chain)、sn-位置(sn-position)、碳碳双键位置(C=C location)等精细结构信息,为深入挖掘癌细胞间的异质性奠定了基础。
该研究利用这一新技术,对野生型(HCC827)和耐药型(HCC827/GR6)非小细胞肺癌(NSCLC)细胞开展了单细胞精细脂质组学分析,实现了基于脂质C=C异构体分析的敏感和耐药肺癌细胞区分。从野生型HCC827细胞中所检测的约9%的耐药细胞与文献报道的7~12%的结果高度一致,表明本研究在精准医疗方面具有重要应用价值。

图2.敏感型和耐药型NSCLC细胞的精准识别。(a-c)t-SNE降维聚类图,(a)由脂质分子相对含量分布计算而得,(b)由脂质sn位置异构体相对含量计算而得,(c)由脂质C=C位置异构体相对含量计算而得。
相关工作近期以“具有高结构特异性的单细胞质谱脂质组学”(Single-cell lipidomics with high structural specificity by mass spectrometry)为题发表在《自然?通讯》(Nature Communications)上。
本文第一作者为精仪系博士研究生李自帅,通讯作者为精仪系马潇潇副教授和欧阳证教授,合作者为化学系瑕瑜教授团队和中国科学院上海药物研究所沈爱军副研究员团队。本工作依托清华大学精密测试技术与仪器国家重点实验室开展,并获得国家自然科学基金委多个项目资助。
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-021-23161-5
供稿:精仪系
编辑:李华山
审核:吕婷

2021年05月18日 16:40:01


相关话题/细胞 结构 技术 精仪 计算

  • 领限时大额优惠券,享本站正版考研考试资料!
    大额优惠券
    优惠券领取后72小时内有效,10万种最新考研考试考证类电子打印资料任你选。涵盖全国500余所院校考研专业课、200多种职业资格考试、1100多种经典教材,产品类型包含电子书、题库、全套资料以及视频,无论您是考研复习、考证刷题,还是考前冲刺等,不同类型的产品可满足您学习上的不同需求。 ...
    本站小编 Free壹佰分学习网 2022-09-19
  • 朱听等在《环境科学与技术》上报道雾霾微生物组分
    清华朱听等在《环境科学与技术》上报道雾霾的微生物组分  清华新闻网2月21日电日前,清华大学生命学院朱听研究员课题组在权威环境学杂志《环境科学与技术》上发表了题为《严重雾霾天气中北京PM2.5与PM10污染物中的可吸入微生物》(InhalablemicroorganismsinBeijing'sPM ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 深圳国际研究生院弥胜利课题组揭示抑制胆固醇合成酶导致肾细胞癌生长加速的调控机制
    清华新闻网5月12日电人们普遍认为,高血清胆固醇会导致癌症患者肿瘤的恶化和并发症的产生,影响癌症患者的预后,而低血清胆固醇则对癌症患者的康复有利。然而在肾细胞癌(RCC)中的实际情况并非如此。RCC占成人肾癌的大多数,且与多种术前替代指标相关。其中,血胆固醇浓度是临床治疗的潜在的预后指标。尽管关于血 ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 清华大学主办堆石混凝土高坝建设关键技术研讨会
    清华新闻网5月14日电5月6日-9日,堆石混凝土高坝建设关键技术研讨会暨“十三五”国家重点研发计划《新型胶结颗粒料坝建设关键技术》项目成果总结咨询会在福建省龙岩市召开。会议由清华大学主办,水利部原总工汪洪、中国水力发电学会副秘书长陈东平、中国水利水电科学研究院副总工张国新、中国大坝工程学会副秘书长郑 ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 清华计算机系创办的《计算可视媒体》英文期刊被SCIE收录
    清华新闻网5月10日电4月29日,清华大学计算机系创办的《计算可视媒体》(ComputationalVisualMedia,CVMJ)期刊被WebofScience的SCIE(SCIExpanded)数据库收录。《计算可视媒体》《计算可视媒体》是清华大学计算机系于2015年创办的英文学术期刊,由清华 ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 深圳国际研究生院李星辉团队发文阐释高通量纳米结构全息光刻高效调控机制
    清华新闻网4月27日电大面积阵列式纳米结构在光场调控、分子筛选组装、材料沉积等方面具有重要的作用,但是目前的制备技术尚无法同时满足高通量、结构一致、特征尺寸可调等核心目标。深入探究影响结构一致性的关键因素、确定结构通量和特征尺寸调谐的机制,是该领域的重大需求。近日,清华大学深圳国际研究生院李星辉团队 ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 雷锦誌等在美科学院院刊发文提出干细胞再生建模新观点
    清华大学雷锦誌等在《美国科学院院刊》发表论文提出成体干细胞再生调控的数学建模新观点  清华新闻网3月12日电清华大学周培源应用数学研究中心雷锦誌副研究员日前在《美国科学院院刊》(PNAS2014111(10)E880-E887)在线发表论文。该论文题目为《成体干细胞再生的基因与表观遗传调控交叉作用的 ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 张建民教授课题组:让结构与土体的接触面不再神秘
    清华土水学院张建民教授等完成的大型结构与土体接触面力学试验系统研制及应用项目获2013年度国家技术发明奖一等奖让结构与土体的接触面不再神秘●记者程曦王冰冰实习记者宋爽项目名称  大型结构与土体接触面力学试验系统研制及应用项目成员  张建民张嘎胡黎明侯文峻冯大阔张雷项目介绍 ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 清华牵头863主题项目智能车路协同关键技术研究通过验收
    清华牵头国家863计划主题项目智能车路协同关键技术研究通过科技部验收  清华新闻网2月28日电(通讯员裴欣胡坚明)2月20日,由清华大学牵头的国家863计划主题项目智能车路协同关键技术研究验收会在河北清华发展研究院举行,并通过科技部验收。  会 ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 清华团队荣获2020年度电子学会科学技术奖唯一特等奖
    清华新闻网4月20日电4月17日,“中国电子学会科学技术奖励大会”在重庆两江新区举行,清华牵头完成的七项成果斩获佳绩,其中网络研究院吴建平等牵头完成的“下一代互联网真实源地址验证体系结构、关键技术与规模化应用”项目获得科技进步奖特等奖(2020年度唯一特等奖)。颁奖现场此外,自动化系鲁继文等完成的“ ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20
  • 生命学院薛毅课题组利用SHAPE数据特征提高RNA二级结构预测的准确度
    清华新闻网4月18日电RNA分子通过错综复杂的碱基配对模式折叠成二级结构,这些二级结构是RNA行使催化、配体结合和支架等功能的基础。准确地测定RNA的二级结构对于理解其生物学功能以及调控机制至关重要。近年来,化学小分子探针被广泛应用于RNA二级结构的探测,其中,selective2′-hydroxy ...
    本站小编 Free考研考试 2021-12-20