摘要： 【目的】环状RNA(circRNA)在可变剪接、转录调控和来源基因的表达调控等方面具有重要功能。本研究旨在分析意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica工蜂中肠circRNA的数量、种类、结构特征和作用，并通过构建和分析circRNA的调控网络探索circRNA的调控功能。【方法】在实验室条件下人工饲养意大利蜜蜂工蜂，利用circRNA-seq技术对意大利蜜蜂7和10日龄成年工蜂中肠样品进行深度测序。利用find_circ软件从质控后的数据中预测circRNA。通过BLAST比对GO和KEGG数据库，对circRNA的来源基因进行功能和代谢通路注释。利用TargetFinder软件预测circRNA靶向结合的miRNA及miRNA靶向结合的mRNA，通过Cytoscape v.3.2.1软件对circRNA-miRNA和circRNA-miRNA-mRNA调控网络进行构建及可视化。通过设计背靠背引物和线性扩增引物RT-PCR对预测出的circRNA进行验证。【结果】意大利蜜蜂工蜂中肠样品的测序平均得到136 463 071条clean reads，去除rRNA后各样品的anchor reads均在136 779 122条及以上。共预测出10 833个circRNA，长度主要介于15~1 000 nt；上述circRNA的类型丰富，其中已注释的外显子circRNA数量最多，分布在西方蜜蜂1号染色体的circRNA数量最多，其次为8号染色体。CircRNA的来源基因可注释到包括结合、细胞进程和细胞在内的45个GO条目，以及包括内吞作用、内质网蛋白加工及核糖体在内的121条KEGG代谢通路，表明circRNA在意大利蜜蜂工蜂中肠的生长、发育、新陈代谢和细胞生命活动等生物学过程中发挥重要作用。进一步构建circRNA-miRNA和circRNA-miRNA-mRNA调控网络，分析结果显示部分circRNA可能作为竞争性内源RNA吸附结合microRNA，从而调控基因的表达水平。最后，对随机选择的3个circRNA的RT-PCR结果验证了其真实存在。【结论】本研究对意大利蜜蜂工蜂中肠中的circRNA进行预测、分析及鉴定。研究结果提供了中肠circRNA的数量、种类、结构特征、作用和调控网络的信息，揭示了circRNA可能通过作用于来源基因和作为竞争性内源RNA在意大利蜜蜂工蜂中肠的生长发育和免疫防御中发挥作用，为深入研究circRNA在意大利蜜蜂中肠发育及胁迫响应过程中的功能奠定了基础。
PDF全文下载地址:
http://www.insect.org.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=6280
删除或更新信息，请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
意大利蜜蜂工蜂中肠的环状RNA及其调控网络分析
本站小编 Free考研考试/2022-01-03
相关话题/基因 网络 软件 细胞 结构
领限时大额优惠券,享本站正版考研考试资料!
优惠券领取后72小时内有效，10万种最新考研考试考证类电子打印资料任你选。涵盖全国500余所院校考研专业课、200多种职业资格考试、1100多种经典教材，产品类型包含电子书、题库、全套资料以及视频，无论您是考研复习、考证刷题，还是考前冲刺等，不同类型的产品可满足您学习上的不同需求。 ...考试优惠券 本站小编 Free壹佰分学习网 2022-09-19小菜蛾NanosO基因启动子的克隆及功能验证
摘要：【目的】克隆小菜蛾PlutellaxylostellaNanosO基因PxnosO启动子，并验证其具有生殖腺特异性活性，以期应用于基因功能研究或转基因昆虫的构建,为小菜蛾等农业害虫的综合治理提供新的研究思路。【方法】根据小菜蛾基因组序列信息，利用PCR技术克隆NanosO的启动子并进行序列分析 ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03棉铃虫生物钟基因HeDbt的克隆和表达模式分析
摘要：【目的】克隆并分析棉铃虫Helicoverpaarmigera生物钟基因Double-time(Dbt)，明确该基因的昼夜表达模式，探讨其表达水平的影响因子，为研究夜蛾科昆虫复眼中生物钟基因的作用机制奠定基础，为理解外周组织中生物钟基因功能提供参考。【方法】采用RT-PCR和RACE技术从2日 ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03叉头转录因子1基因FOXO1的特征及其在葱蝇夏滞育前期蛹体内糖脂代谢中的作用(英文)
摘要：【目的】克隆和鉴定葱蝇Deliaantiqua叉头转录因子1基因，探究其在葱蝇夏滞育前期蛹体内糖代谢和脂代谢中的作用。【方法】本研究基于葱蝇转录组数据利用3′RACE法克隆叉头转录因子1基因的全长开放阅读框；利用生物信息学法分析了该基因编码蛋白的序列特征、保守结构域和二级结构，并采用最大似然法 ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03基于COⅠ基因序列的蜜蜂属系统发育分析及其舞蹈和筑巢行为进化分析
摘要：【目的】分析蜜蜂属Apis的系统发育关系，并在此基础上探讨蜜蜂属舞蹈方向、舞蹈声音、营巢环境、巢脾结构的祖先状态和演变过程。【方法】PCR扩增并测定中国分布的蜜蜂属内东方蜜蜂A.cerana、西方蜜蜂A.mellifera、大蜜蜂A.dorsata、黑大蜜蜂A.laboriosa、小蜜蜂A.f ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03CRISPR系统用于昆虫基因表达调控的研究进展与展望
摘要：昆虫基因功能研究因缺少相应的工具而受到明显限制，但CRISPR/Cas9系统的出现为昆虫基因编辑及转录调控研究提供巨大助力。将Cas9核酸酶的RuvC和HNH剪切结构域失活改造得到的dCas9系统近年来在基因转录调控方面得到了广泛应用，同时CRISPR/dCpf1和最新发现的CRISPR/Ca ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03组蛋白H3Thr3磷酸化在Sf9细胞有丝分裂中的动态定位
摘要：【目的】研究组蛋白H3Thr3磷酸化这一表观标记在Sf9细胞有丝分裂中的功能。【方法】通过固相法合成一段包含组蛋白H3第1-9位氨基酸的肽段［ARTKQTARKC］，将第3位苏氨酸进行磷酸化修饰(P-Pep226555)或者不修饰(NP-Pep080472)后制备抗体，Westernblot检 ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03棉铃虫离子型受体基因HarmIR8a的克隆及表达定位
摘要：【目的】昆虫离子型受体(ionotropicreceptors,IRs)是新发现的一类化学感觉受体，对昆虫感受环境中酸类和胺类等物质发挥着重要作用。基因克隆、序列比对以及表达定位的研究将有助于初步解析棉铃虫Helicoverpaarmigera离子型受体的功能。【方法】本研究在棉铃虫触角转录组 ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03麦红吸浆虫热激蛋白基因SmHsp40的克隆及其在滞育进程中和极端温度胁迫下的表达
摘要：【目的】麦红吸浆虫Sitodiplosismosellana是一种典型的专性滞育昆虫，滞育过程中经历酷暑和严寒。本研究旨在探讨麦红吸浆虫热激蛋白基因Hsp40在滞育中的作用。【方法】以麦红吸浆虫滞育前幼虫为材料，利用RTPCR和RACE技术克隆Hsp40全长cDNA序列；利用生物信息学软件分 ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03大灰象甲实时定量PCR内参基因的筛选
摘要：【目的】筛选出适合分析大灰象甲Sympiezomiasvelatus成虫不同组织中基因表达水平的内参基因。【方法】利用转录组测序技术获得大灰象甲管家基因序列作为候选内参基因，采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析候选基因在大灰象甲雌雄成虫触角、头、胸、腹和足中的表达量；并利用geNo ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03中国丝光绿蝇种群线粒体细胞色素b基因的遗传多样性及其对法医学上死亡地点推断的意义
摘要：【目的】对中国多地丝光绿蝇Luciliasericata种群线粒体细胞色素b(cytochromeb,CYTB)基因进行测序，探究地理隔离对中国丝光绿蝇线粒体细胞色素b基因遗传多样性的影响，并探讨其在法医学上死亡地点推断中的应用。【方法】对2016年采自中国11个地区的丝光绿蝇55头个体的线粒 ...中科院动物研究所 本站小编 Free考研考试 2022-01-03
