福寿螺属（Pomacea）中的小管福寿螺（P. canaliculata）和斑点福寿螺（P. maculata）形态相似，入侵能力很强，严重危害水稻和其他水生植物。本研究基于线粒体细胞色素氧化酶亚基I（COI）基因和核基因EF1α序列，应用软件DnaSP 5.0、Arlequin 3.1.1、MEGA 7.0和PhyloSuite进行遗传参数统计、构建贝叶斯系统发育树，分析了来自江苏省苏州市虎丘区、吴中区、昆山周市镇、千灯镇和玉山镇共5个采样地的40只福寿螺（Pomacea spp.）的种类及其遗传多样性。结果表明，获得40条长度为605 bp的线粒体COI基因序列，经序列比对后发现有74个变异位点、4种单倍型。小管福寿螺有34只，分属3种单倍型（PcaH1 ~ PcaH3），小管福寿螺的单倍型多样性（h）和核苷酸多样性（π）分别为0.399和0.017。斑点福寿螺有6只，仅有1种单倍型（PmaH1）。苏州地区小管福寿螺和斑点福寿螺遗传多样性均较低。基于线粒体COI基因系统发育分析结果表明，苏州市的小管福寿螺可能与阿根廷的小管福寿螺亲缘关系较近，而苏州市的斑点福寿螺可能与巴西的斑点福寿螺亲缘关系较近。此外，昆山市周市镇是新发现的小管福寿螺和斑点福寿螺同域分布地区。苏州、昆山的9个福寿螺样本共获得430 bp的核基因EF1α序列28条，发现有40个变异位点和9种单倍型（EFHAP1 ~ EFHAP9），其中，小管福寿螺有8种单倍型（EFHAP1 ~ EFHAP5和EFHAP7 ~ EFHAP9），斑点福寿螺有2种单倍型（EFHAP5和EFHAP6）。基于线粒体COI基因和核基因EF1α序列构建的系统发育树，小管福寿螺和斑点福寿螺存在遗传信息混杂的现象，提示两种螺存在杂交。

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