可变剪接是转录后重要的基因表达调控方式，也是转录组和蛋白质组多样性的重要来源. 近年来随着拟南芥、水稻、玉米等植物转录组测序的完成，研究人员发现植物pre-mRNA可变剪接的发生与组织分化、发育等生物学过程密切相关. 本工作基于GEO数据库的RNA-seq数据，使用高通量测序数据分析常用的Trimmomatic、Salmon、DESeq2、SUPPA2等工具，识别了拟南芥的种子、根、叶、花、花梗、节间、长角果共7种组织的表达基因和可变剪接事件，以及7种组织间的差异表达基因和差异可变剪接事件，并以叶和花为例展示了相应的生物学功能分析. 该工作系统地研究了拟南芥基因表达和可变剪接发生的组织特异性，有助于进一步阐明植物基因组的基因表达调控机制.
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拟南芥不同组织基因表达及可变剪接差异分析
本站小编 Free考研考试/2022-01-02
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