腺苷酸环化酶3（adenylate cyclase Ⅲ，AC3）是嗅觉系统中的重要成分，AC3缺失后小鼠的主要嗅觉表皮组织（main olfactory epidermal，MOE）随年龄增长逐渐变薄，MOE内基因表达谱发生改变. DNA甲基化在动物发育、基因表达调控中具有重要作用. 为了探讨AC3缺失后小鼠MOE内基因启动子甲基化水平的改变以及对基因表达的影响，本文采用DNA甲基化免疫共沉淀芯片（methylated DNA immunoprecipitation chip,MeDIP-chip）筛选AC3缺失小鼠MOE内启动子区甲基化差异表达基因，利用甲基化特异PCR（methylation-specific PCR，MSP）、实时荧光定量PCR(qRT-PCR）进一步检测部分甲基化差异基因的DNA甲基化水平改变和表达差异. 结果表明，AC3缺失小鼠中有1 978个基因启动子的甲基化水平发生了改变，占总探针数的9%，其中727个基因启动子甲基化水平升高，1 251个甲基化水平降低. 功能分析表明，这些启动子甲基化发生改变的基因主要涉及的功能分别与嗅觉受体、神经发育、cAMP信号通路、ATP结合、钙离子调控、乙酰化修饰、转录因子等相关. MSP检测表明，嗅觉受体基因Olfr1153、Olfr231、Olfr378、Olfr651、Olfr691启动子区的甲基化水平升高，Cngb1、Pde4a和Olfr1394基因启动子区的甲基化水平降低. qRT-PCR结果显示，基因Cngb1、Hcn4、Olfm1、Olfr1394、Olfr1153、Olfr231、Olfr378、Olfr691的表达水平显著下降，而Pde4a和Olfr651基因的表达水平显著升高. 总之，AC3缺失后MOE内嗅觉受体基因、神经发育相关基因、cAMP信号通路等相关基因启动子甲基化水平发生显著改变，影响核苷酸切除修复、DNA复制、错配修复等信号通路的传导，从而综合调控小鼠MOE内的基因表达数量和水平.

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