基本信息
熊杰男硕导中国科学院水生生物研究所
电子邮件： xiongjie@ihb.ac.cn
通信地址： 湖北省武汉市东湖南路7号
邮政编码：

研究领域

招生信息
招生专业071007-遗传学
071004-水生生物学

招生方向原生动物进化及基因组学


教育背景2007-09--2012-01中国科学院水生生物研究所研究生/理学博士
2003-09--2007-06南京农业大学本科/农学学士

学历
学位

工作经历
工作简历2015-11~现在,中国科学院水生生物研究所,副研究员
2014-08~2015-08,美国密歇根大学安娜堡校区,博士后
2012-03~2015-11,中国科学院水生生物研究所,助理研究员
2007-09~2012-01,中国科学院水生生物研究所,研究生/理学博士
2003-09~2007-06,南京农业大学,本科/农学学士

社会兼职2015-08-24-2017-12-31,中国动物学会原生动物学分会副秘书长, 副秘书长


教授课程

专利与奖励
奖励信息（1） 青年科技奖, 一等奖, 研究所（学校）, 2016
（2） 湖北省优秀博士论文奖, 一等奖, 省级, 2013

专利成果（ 1 ） 来源于四膜虫的TpyArsM蛋白及其编码基因和应用, 2015, 第 5 作者, 专利号: CN4.6


出版信息
发表论文（1）Tetrahymena Comparative Genomics Database (TCGD): a community resource for Tetrahymena,Database,2019,第8作者
（2）Insights into the origin and evolution of Peritrichia (Oligohymenophorea, Ciliophora) based on analyses of morphology and phylogenomics,Molecular phylogenetics and evolution,2019,第3作者
（3）RNAi-dependent Polycomb repression controls transposable elements in Tetrahymena,Genes & development,2019,第2作者
（4）Hidden genomic evolution in a morphospecies—The landscape of rapidly evolving genes in Tetrahymena,PLoS biology,2019,第1作者
（5）Exploration of Genetic Variations through Single‐cell Whole‐genome Sequencing in the Model Ciliate Tetrahymena thermophila,Journal of Eukaryotic Microbiology,2019,第3作者
（6）EOGD: the Euplotes octocarinatus genome database,BMC Genomics,2018,第4作者
（7）A DP-like transcription factor protein interacts with E2fl1 to regulate meiosis in Tetrahymena thermophila,Cell cycle,2018,第5作者
（8）Pseudocohnilembus persalinus genome database-the first genome database of facultative scuticociliatosis pathogens,BMC genomics,2018,第5作者
（9）A germline-limited piggyBac transposase gene is required for precise excision in Tetrahymena genome rearrangement,Nucleic Acids Research,2017,第4作者
（10）Dissecting relative contributions of cis-and trans-determinants to nucleosome distribution by comparing Tetrahymena macronuclear and micronuclear chromatin,Nucleic Acids Research,2016,第1作者
（11）Epidermal growth factor-induced stimulation of proliferation and gene expression changes in the hypotrichous ciliate, Stylonychia lemnae,Gene,2016,第11作者
（12）四膜虫功能基因组数据库增量更新 2016-生活史和减数分裂转录组及磷酸化蛋白组资源建设,基因组学与应用生物学,2016,第11作者
（13）Tracing the structural evolution of eukaryotic ATP binding cassette transporter superfamily,Scientific reports,2015,第1作者
（14）Genome of the facultative scuticociliatosis pathogen Pseudocohnilembus persalinus provides insight into its virulence through horizontal gene transfer,Scientific reports,2015,第1作者
（15）The genome of the myxosporean Thelohanellus kitauei shows adaptations to nutrient acquisition within its fish host,Genome biology and evolution,2014,第2作者
（16）Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation,Genes & development,2013,第2作者
（17）Tetrahymena functional genomics database (TetraFGD): an integrated resource for Tetrahymena functional genomics,Database,2013,第1作者
（18）Transcriptome analysis of the model protozoan, Tetrahymena thermophila, using deep RNA sequencing,PLoS One,2012,第1作者
（19）Tetrahymena Gene Expression Database (TGED): a resource of microarray data and co-expression analyses for Tetrahymena,Science China Life sciences,2011,第1作者
（20）Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila,PloS one,2011,第1作者
（21）Genome-wide identification and evolution of ATP-binding cassette transporters in the ciliate Tetrahymena thermophila: A case of functional divergence in a multigene family,BMC evolutionary biology,2010,第1作者
（22）（23）
发表著作

科研活动
科研项目（ 1 ） 三种四膜虫全基因组N6-甲基腺嘌呤的鉴定及其功能进化, 主持,国家级,2017-01--2020-12
（ 2 ） 中国科学院青年创新促进会会员人才专项, 主持,部委级,2016-01--2019-12
（ 3 ） 中国科学院知识创新工程青年人才领域前沿项目, 主持,市地级,2014-01--2015-12
（ 4 ） 模式生物嗜热四膜虫转录组数据库建设, 主持,院级,2014-01--2015-12
（ 5 ） 模式原生动物嗜热四膜虫DNA复制起点的鉴定及其特征分析, 主持,国家级,2014-01--2016-12
（ 6 ） 原生动物四膜虫生殖小核(germline nucleus)体功能(somatic function)的分子基础研究, 主持,国家级,2019-01--2021-12

参与会议（1）四膜虫比较基因组学研究中国动物学会原生动物学分会第十八次学术讨论会2015-08-24


合作情况
项目协作单位

指导学生