我院发酵工程专业于1986年获得硕士学位授予权，1982年开始招收硕士生，现有教授级高级工程师11人， 高级工程师41人。
        本专业背靠国家工业微生物菌种资源共享平台、国家食品质量监督检验中心、全国食品发酵标准化中心、全国食品与发酵工业信息中心、国家食用菌研究开发中心、 食品生物技术国际培训中心等六个国家级平台，拥有各种全自动发酵罐、高效液相色谱仪、气相色谱仪、原子吸收及荧光光谱仪、紫外光谱仪、旋光仪、纤维素分析 仪、质谱仪等仪器设备，主要研究有：工业微生物菌种资源管理、微生物菌种分子生物学鉴定、食品与发酵产品快速检测与分析技术研究、酿酒与工业发酵工业标准 化基础研究、药膳真菌功能因子高效发酵技术的研究、酿酒新技术、新方法的研究、新型功能性生物产品的开发、传统发酵工业技术的改造等。
一、培养目标
        学位获得者应掌握生化工程和发酵工程方面的基础理论和专业知识，了解生物技术的最新发展动向，能够创造性地运用代谢工程、发酵动力学与生物反应器、生物分 离工程等方面的知识，研究和解决与发酵及生物转化等有关过程中的理论和实际问题，熟练掌握一门外国语。
二、主要研究方向
1． 工业微生物资源研究与利用 
        工业微生物菌种资源管理与共享，工业微生物鉴定与性能评价，工业微生物菌种选育及优化，工业微生物代谢产物的研制与开发
2． 高新技术在传统食品工业中的应用
        传统食品绿色制造技术，酿造食品酿造过程关键控制技术，传统食品感观品评与检测技术，高性能微生物发酵制剂
3． 食品安全技术的研究开发
        食品安全体系的研究开发，食品安全检测技术的研究开发，食品制造过程安全控制技术的研究开发，食品与发酵工业标准化基础研究，酿造食品质量控制技术评价方 法应用性研究，食品安全关键技术及措施标准化研究与应用，食品与发酵产品检测技术，食品与发酵产品储藏与货架期的研究
4． 食品新资源的研究与开发
        天然产物活性成分分离、提取、纯化技术，食源性蛋白制备及改性技术，膳食营养与代谢工程技术，膳食营养评价技术
5、食源性蛋白改性及深加工技术的研究与开发
        以各种食用蛋白资源，尤其是低值副产物，如豆粕、玉米黄粉、小麦蛋白以及传统药用蛋白等为原料，采用生物酶工程技术，对其蛋白质进行改性、提纯，制成可食用的新一代蛋白原料－食源性低聚肽，提高其营养价值、生理活性和利用性。
三、学制和学分
         学制2.5年。培养年限2-5年。公共课：8学分、学位课：10~12学分、选修课：6~8学分，三类合计达到26个学分。跨学科入学的硕士生应根据需要加修本科有关课程，并要通过考核，但所得学分不计入总学分。
四、课程设置
        详见天津科技大学发酵工程专业硕士生课程设置表。我院第一外语为英语，课程考试合格可取得学分；硕士研究生在学期间须通过大学英语六级考试，方可授予学位。其它语种按教育部有关规定执行
五、中期检查
1. 硕士生应完成有关课程的学习，获得所需的学分。
2. 硕士生应完成开题报告，开始学位论文有关的研究，并有一定的进展。
3. 硕士生应向导师组报告自己的课题研究进展。
六、开题报告
        硕士生在撰写开题报告前应首先充分搜集资料，查阅有关文献，并进行实际调查，了解相关研究领域的前人工作情况，课题的意义和重要性，写好文献综述，明确课 题的主攻目标。提出课题实施的方案和方法，具体进行的计划，并说明其合理性。开题报告应详细列出有关的参考文献。
七、学位论文 
        学位论文应说明课题的意义和本人的创新之处，实验方法和数据处理方法应明确交代。论文的撰写参照《中国食品发酵工业研究院格式、书写规 范》，论文必须实事求是，实验结果应尽可能显示其精度，并根据有关理论进行分析和讨论，推出合理的结论。对获得的研究成果应客观地评价。硕士生在学习期间 须在本学科核心学术期刊发表至少一篇研究论文或申请一项专利（已受理或授权均可，第一作者或导师是第一作者，研究生为第二作者）。