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胡永飞
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个人资料
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招生信息
个人资料
部门： 动物科学技术学院
性别： 男
民族： 汉族
--> 专业技术职务： 教授
行政职务：
主要研究方向： 农学
毕业院校： 中国科学院微生物研究所
学位： 博士
--> 政治面貌： 中国共产党党员
联系电话： 010-62732225
电子邮箱： huyongfei@cau.edu.cn
办公地址： 动科楼151
通讯地址： 海淀区圆明园西路2号
邮编： 100193
传真：
教育经历
工作经历
-->
个人简介
个人简介
胡永飞，男，博士，教授，硕士/博士生导师。2010年7月获中国科学院微生物研究所微生物学博士学位，毕业后留所任助理研究员、副研究员。2018年6月以“杰出人才”引进中国农业大学，任动物科学技术学院教授。
作为主要参加人和课题主持人先后承担了国家高技术研究发展计划（863）、卫生部科技重大专项、国家重点基础研究发展计划（973）、国家重点研发计划、国家自然科学基金和北京市自然科学基金等项目。2010以来，发表SCI论文42篇；其中以第一作者或通讯作者在Nature Communications、The Lancet Infectious Diseases、PLoS Pathogens等杂志上发表SCI论文28篇；国内核心期刊论文12篇，申请国内发明专利4项；参编国家卫计委“十二五”规划教材1部，特邀主编《生物工程学报》专刊1期，副主编科普读物1部。2015年入选中国科学院青年创新促进会会员；2016年入选中国研究型医院学会空间微生物学与感染专业委员会青年委员。JAC、AAC等多个SCI杂志同行评议审稿人；2017年至今任Frontiers in Cellular and Infection Microbiology杂志审稿编委。
学习与工作经历
2000/09-2004/07，辽宁大学生命科学院，生物科学专业，学士
2004/09-2007/07，辽宁大学生命科学院，微生物学专业，硕士
2007/09-2010/07，中国科学院微生物研究所，微生物学专业，博士
2010/07-2014/08，中国科学院微生物研究所，病原室，助理研究员
2014/09-2018/05，中国科学院微生物研究所，病原室，副研究员
2018/06至今，中国农业大学，动物科学技术学院，教授
研究方向
肠道菌群与动物营养和免疫调控机制；新型益生菌及酶资源挖掘与利用；噬菌体与宿主共进化机制及其替抗应用；细菌耐药与耐药传播机制。
发表论文
1.Wang, Y.#, Hu, Y.#, Cao, J., Bi, Y., Lv, N., Liu, F., Liang, S., Shi, Y., Jiao, X., Gao, G. F., & Zhu, B.2019. Antibiotic resistance gene reservoir in live poultry markets. J Infect. (online).
2. Hu, Y., Feng, Y., Wu, J., Liu, F., Zhang, Z., Hao, Y., Liang, S., Li, B., Li, J., Lv, N., Xu, Y., Zhu, B., & Sun, Z. 2019. The Gut Microbiome Signatures Discriminate Healthy From Pulmonary Tuberculosis Patients. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 9:90.
3.Xu, Y., Liu, F., Chen, S., Wu, J.,Hu, Y., Zhu, B., & Sun, Z. 2018. In vivo evolution of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis in patients during long-term treatment. BMC Genomics, 19(1): 640.
4.Liu, W. J.#, Zou, R.#,Hu, Y.#, Zhao, M., Quan, C., Tan, S., Luo, K., Yuan, J., Zheng, H., Liu, J., Liu, M., Bi, Y., Yan, J., Zhu, B., Wang, D., Wu, G., Liu, L., Yuen, K. Y., Gao, G. F., & Liu, Y. 2018. Clinical, immunological and bacteriological characteristics of H7N9 patients nosocomially co-infected by Acinetobacter Baumannii: a case control study. BMC Infect Dis, 18(1): 664.
5.Alkasir, R., Ma, Y., Liu, F., Li, J., Lv, N., Xue, Y.,Hu, Y.*, & Zhu, B*. 2018. Characterization and Transcriptome Analysis of Acinetobacter baumannii Persister Cells. Microb Drug Resist, 24(10): 1466-1474.
6.Zhang, C., Feng, Y., Liu, F., Jiang, H., Qu, Z., Lei, M., Wang, J., Zhang, B., Hu, Y., Ding, J., & Zhu, B. 2017. A Phage-Like IncY Plasmid Carrying the mcr-1 Gene in Escherichia coli from a Pig Farm in China. Antimicrob Agents Chemother, 61(3): e02035-16.
7.Lu, X.#,Hu, Y.#, Luo, M., Zhou, H., Wang, X., Du, Y., Li, Z., Xu, J., Zhu, B., Xu, X., & Kan, B. 2017. MCR-1.6, a New MCR Variant Carried by an IncP Plasmid in a Colistin-Resistant Salmonella enterica Serovar Typhimurium Isolate from a Healthy Individual. Antimicrob Agents Chemother, 61(5): e02632-16.
8. Hu, Y.*, Gao, G. F., & Zhu, B*. 2017. The antibiotic resistome: gene flow in environments, animals and human beings. Front Med, 11(2): 161-168.
9. Hu, Y., & Zhu, B. 2016. The Human Gut Antibiotic Resistome in the Metagenomic Era: Progress and Perspectives. Infect Dis Transl Med, 2(1): 41-47.
10. Hu, Y., Yang, X., Li, J., Lv, N., Liu, F., Wu, J., Lin, I. Y., Wu, N., Weimer, B. C., Gao, G. F., Liu, Y., & Zhu, B. 2016. The Bacterial Mobile Resistome Transfer Network Connecting the Animal and Human Microbiomes. Appl Environ Microbiol, 82(22): 6672-6681.
11. Hu, Y., Liu, F., Lin, I. Y., Gao, G. F., & Zhu, B. 2016. Dissemination of the mcr-1 colistin resistance gene. Lancet Infect Dis, 16(2): 146-147.
12.Gao, R.#, Hu, Y.#, Li, Z.#, Sun, J.#, Wang, Q., Lin, J., Ye, H., Liu, F., Srinivas, S., Li, D., Zhu, B., Liu, Y. H., Tian, G. B., & Feng, Y.2016. Dissemination and Mechanism for the MCR-1 Colistin Resistance. PLoS Pathog, 12(11): e1005957.
13.Yang, X., Liu, D., Lv, N., Zhao, F., Liu, F., Zou, J., Chen, Y., Xiao, X., Wu, J., Liu, P., Gao, J., Hu, Y., Shi, Y., Liu, J., Zhang, R., Chen, C., Ma, J., Gao, G. F., & Zhu, B. 2015. TCRklass: a new K-string-based algorithm for human and mouse TCR repertoire characterization. J Immunol, 194(1): 446-454.
14.Luan, C., Xie, L., Yang, X., Miao, H., Lv, N., Zhang, R., Xiao, X., Hu, Y., Liu, Y., Wu, N., Zhu, Y., & Zhu, B. 2015. Dysbiosis of fungal microbiota in the intestinal mucosa of patients with colorectal adenomas. Sci Rep, 5: 7980.
15.Liu, F., Yang, X., Wang, Z., Nicklasson, M., Qadri, F., Yi, Y., Zhu, Y., Lv, N., Li, J., Zhang, R., Guo, H., Zhu, B., Sjoling, A.*, & Hu, Y*. 2015. Draft genomes of four enterotoxigenicEscherichia coli(ETEC) clinical isolates from China and Bangladesh. Gut Pathog, 7: 10.
16.Li, X., Wu, J., Han, J., Hu, Y., & Mi, K.2015. Distinct Responses ofMycobacterium smegmatis to Exposure to Low and High Levels of Hydrogen Peroxide. PLoS One, 10(7): e0134595.
17.Li, H., Liu, F., Zhang, Y., Wang, X., Zhao, C., Chen, H., Zhang, F., Zhu, B., Hu, Y.*, & Wang, H.* 2015. Evolution of carbapenem-resistant Acinetobacter baumanniirevealed through whole-genome sequencing and comparative genomic analysis. Antimicrob Agents Chemother, 59(2): 1168-1176.
18. Hu, Y., Zhu, Y., Ma, Y., Liu, F., Lu, N., Yang, X., Luan, C., Yi, Y., & Zhu, B. 2015. Genomic insights into intrinsic and acquired drug resistance mechanisms in Achromobacter xylosoxidans. Antimicrob Agents Chemother, 59(2): 1152-1161.
19.Hu, Y.#, Liu, Y#., Li, J., Feng, Y., Lu, N., Zhu, B., & Xue, S. 2015. Structural and functional analysis of a low-temperature-active alkaline esterase from South China Sea marine sediment microbial metagenomic library. J Ind Microbiol Biotechnol, 42(11): 1449-1461.
20.Zhu, Y., Yi, Y., Liu, F., Lv, N., Yang, X., Li, J., Hu, Y.*, & Zhu, B*. 2014. Distribution and molecular profiling of class 1 integrons in MDR Acinetobacter baumannii isolates and whole genome-based analysis of antibiotic resistance mechanisms in a representative strain. Microbiol Res, 169(11): 811-816.
21.Yi, Y., Lu, N., Liu, F., Li, J., Zhang, R., Jia, L., Jing, H., Xia, H., Yang, Y., Zhu, B., Hu, Y.*, & Cui, Y*. 2014. Genome sequence and comparative analysis of aVibrio cholerae O139 strain E306 isolated from a cholera case in China. Gut Pathog, 6(1): 3.
22.Lu, N.#, Hu, Y.#, Zhu, L.#, Yang, X., Yin, Y., Lei, F., Zhu, Y., Du, Q., Wang, X., Meng, Z., & Zhu, B. 2014. DNA microarray analysis reveals that antibiotic resistance-gene diversity in human gut microbiota is age related. Sci Rep, 4: 4302.
23.Liu, F., Zhu, Y., Yi, Y., Lu, N., Zhu, B.*, & Hu, Y*. 2014. Comparative genomic analysis of Acinetobacter baumanniiclinical isolates reveals extensive genomic variation and diverse antibiotic resistance determinants. BMC Genomics, 15: 1163.
24.Liu, F.#, Hu, Y.#, Wang, Q., Li, H. M., Gao, G. F., Liu, C. H., & Zhu, B. 2014. Comparative genomic analysis of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates. BMC Genomics, 15: 469.
25.Li, X., Liu, F., Hu, Y., & Mi, K. 2014. Draft Genome Sequence of mc251, a Highly Hydrogen Peroxide-Resistant Mycobacterium smegmatis Mutant Strain. Genome Announc, 2(1): e00092-14.
26. Hu, Y., Yang, X., Lu, N., & Zhu, B. 2014. The abundance of antibiotic resistance genes in human guts has correlation to the consumption of antibiotics in animal. Gut Microbes, 5(2): 245-249.
27.Wu, N., Yang, X., Zhang, R., Li, J., Xiao, X., Hu, Y., Chen, Y., Yang, F., Lu, N., Wang, Z., Luan, C., Liu, Y., Wang, B., Xiang, C., Wang, Y., Zhao, F., Gao, G. F., Wang, S., Li, L., Zhang, H., & Zhu, B. 2013. Dysbiosis signature of fecal microbiota in colorectal cancer patients. Microb Ecol, 66(2): 462-470.
28.Li, B.#, Hu, Y.#, Wang, Q.#, Yi, Y., Woo, P. C., Jing, H., Zhu, B., & Liu, C. H.2013. Structural diversity of class 1 integrons and their associated gene cassettes in Klebsiella pneumoniae isolates from a hospital in China. PLoS One, 8(9): e75805.
29.Hu, Y.#, Yang, X.#, Qin, J., Lu, N., Cheng, G., Wu, N., Pan, Y., Li, J., Zhu, L., Wang, X., Meng, Z., Zhao, F., Liu, D., Ma, J., Qin, N., Xiang, C., Xiao, Y., Li, L., Yang, H., Wang, J., Yang, R., Gao, G. F., Wang, J., & Zhu, B. 2013. Metagenome-wide analysis of antibiotic resistance genes in a large cohort of human gut microbiota. Nat Commun, 4: 2151.
30.Cheng, G., Hu, Y., Lu, N., Li, J., Wang, Z., Chen, Q., & Zhu, B. 2013. Identification of a novel fosfomycin-resistant UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase (MurA) from a soil metagenome. Biotechnol Lett, 35(2): 273-278.
31.Wu, N., Zhang, Y., Fu, J., Zhang, R., Feng, L., Hu, Y., Li, X., Lu, N., Zhao, X., Pan, Y., Li, J., Zhu, B., & Wan, K. 2012. Performance assessment of a novel two-step multiple displacement amplification-PCR assay for detection of Mycobacterium tuberculosis complex in sputum specimens. J Clin Microbiol, 50(4): 1443-1445.
32.Liu, C. H., Li, H. M., Lu, N., Wang, Q., Hu, Y. L., Yang, X., Hu, Y. F., Woo, P. C., Gao, G. F., & Zhu, B. 2012. Genomic sequence based scanning for drug resistance-associated mutations and evolutionary analysis of multidrug-resistant and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. J Infect, 65(5): 412-422.
33.Hu, H.#, Hu, Y.#, Pan, Y., Liang, H., Wang, H., Wang, X., Hao, Q., Yang, X., Yang, X., Xiao, X., Luan, C., Yang, Y., Cui, Y., Yang, R., Gao, G. F., Song, Y., & Zhu, B. 2012. Novel plasmid and its variant harboring both a bla(NDM-1) gene and type IV secretion system in clinical isolates of Acinetobacter lwoffii. Antimicrob Agents Chemother, 56(4): 1698-1702.
34.Cheng, G., Hu, Y., Yin, Y., Yang, X., Xiang, C., Wang, B., Chen, Y., Yang, F., Lei, F., Wu, N., Lu, N., Li, J., Chen, Q., Li, L., & Zhu, B.2012. Functional screening of antibiotic resistance genes from human gut microbiota reveals a novel gene fusion. FEMS Microbiol Lett, 336(1): 11-16.
35.Pan, Y., Yang, X., Li, J., Zhang, R., Hu, Y., Zhou, Y., Wang, J., & Zhu, B.2011. Genome sequence of the Spinosyns-producing bacterium Saccharopolyspora spinosa NRRL 18395. J Bacteriol, 193(12): 3150-3151.
36.Pan, Y., Yang, X., Duan, J., Lu, N., Leung, A. S., Tran, V.,Hu, Y., Wu, N., Liu, D., Wang, Z., Yu, X., Chen, C., Zhang, Y., Wan, K., Liu, J., & Zhu, B. 2011. Whole-genome sequences of four Mycobacterium bovis BCG vaccine strains. J Bacteriol, 193(12): 3152-3153.
37. Hu, Y.#, Zhang, W.#, Liang, H., Liu, L., Peng, G., Pan, Y., Yang, X., Zheng, B., Gao, G. F., Zhu, B., & Hu, H. 2011. Whole-genome sequence of a multidrug-resistant clinical isolate of Acinetobacter lwoffii. J Bacteriol, 193(19): 5549-5550.
38.Fu, C.#,Hu, Y.#, Xie, F., Guo, H., Ashforth, E. J., Polyak, S. W., Zhu, B., & Zhang, L.2011. Molecular cloning and characterization of a new cold-active esterase from a deep-sea metagenomic library. Appl Microbiol Biotechnol, 90(3): 961-970.
39.Zhao, W., Zhong, Y., Yuan, H., Wang, J., Zheng, H., Wang, Y., Cen, X., Xu, F., Bai, J., Han, X., Lu, G., Zhu, Y., Shao, Z., Yan, H., Li, C., Peng, N., Zhang, Z., Zhang, Y., Lin, W., Fan, Y., Qin, Z., Hu, Y., Zhu, B., Wang, S., Ding, X., & Zhao, G. P. 2010. Complete genome sequence of the rifamycin SV-producing Amycolatopsis mediterranei U32 revealed its genetic characteristics in phylogeny and metabolism. Cell Res, 20(10): 1096-1108.
40.Hu, Y., Fu, C., Yin, Y., Cheng, G., Lei, F., Yang, X., Li, J., Ashforth, E. J., Zhang, L., & Zhu, B. 2010. Construction and preliminary analysis of a deep-sea sediment metagenomic fosmid library from Qiongdongnan Basin, South China Sea. Mar Biotechnol (NY), 12(6): 719-727.
41. Hu, Y., Fu, C., Huang, Y., Yin, Y., Cheng, G., Lei, F., Lu, N., Li, J., Ashforth, E. J., Zhang, L., & Zhu, B. 2010. Novel lipolytic genes from the microbial metagenomic library of the South China Sea marine sediment. FEMS Microbiol Ecol, 72(2): 228-237.
42.Angly, F. E., Willner, D., Prieto-Davo, A., Edwards, R. A., Schmieder, R., Vega-Thurber, R., Antonopoulos, D. A., Barott, K., Cottrell, M. T., Desnues, C., Dinsdale, E. A., Furlan, M., Haynes, M., Henn, M. R., Hu, Y., Kirchman, D. L., McDole, T., McPherson, J. D., Meyer, F., Miller, R. M., Mundt, E., Naviaux, R. K., Rodriguez-Mueller, B., Stevens, R., Wegley, L., Zhang, L., Zhu, B., & Rohwer, F. 2009. The GAAS metagenomic tool and its estimations of viral and microbial average genome size in four major biomes. PLoS Comput Biol, 5(12): e1000593.
43.王亚楠，胡永飞*，朱宝利，焦新安，高福。养殖动物及其相关环境耐药组的研究进展。生物工程学报，2018，34(8): 1226-1233.
44.马亚男，朱玉莹，李维城，刘飞，律娜，李晶，朱宝利*，胡永飞*。鲍曼不动杆菌耐药持留菌的特征及Ⅱ型毒素-抗毒素系统的多样性。微生物学报，2015，55(7): 949-958.
45.朱玉莹，易勇，杨犀，律娜，李晶，朱宝利*，胡永飞*。多重耐药铜绿假单胞菌中Ⅰ型整合子新结构的发现及其与耐药的相关性。微生物学报，2013, 53(9): 927-932.（微生物学报年度优秀学术论文）
46.段嘉，程功，胡永飞，李晶，律娜，朱宝利。肠道微生物宏基因组文库构建及酯解酶基因筛选。中国农业大学学报，2013, 18(1): 10-15。
47.张博，李铁民，杨智勇，胡永飞，李玉。谷氨酸棒杆菌H+-ATPase基因失活提高谷氨酸产生量。中国生物工程杂志, 2011, 31(1): 35-39
48.徐士庆，胡永飞，袁爱花，朱宝利。深海沉积物微生物元基因组文库来源的新的酯酶基因的克隆、表达及酶学性质。微生物学报，2010,50(7): 891-896。
49.胡永飞，李铁民，张博，杨志勇，李玉。抗噬菌体重组钝齿棒杆菌的生理稳定性。2010，30(6): 51-54。
50.胡永飞，李铁民，杨智勇等。限制修饰系统cglI 赋予钝齿棒杆菌抗噬菌体功能活性。生物工程学报，2008, 24(5): 760-765。
51.张博，杨智勇，胡永飞，杨柯，李玉，李铁民。噬菌体一指示菌模型检测固型板材抗病毒性能的方法研究。微生物学杂志，2008, 28(4): 27-29。
52.郭树凡，朱春玉，李辉，胡永飞，李玉。磷细菌PB12菌株的选育及培养条件的研究。微生物学杂志，2007, 27(2): 49-52。
53.胡永飞，李铁民。 基因工程技术在建立噬菌体抗性机制研究中的应用。微生物学杂志，2006, 26(6): 89-91。
54.李铁民，胡永飞，冯倩妮，李玉，董占双，刘忠顺，罗恩杰。CglI基因在大肠杆菌中的功能活性分析。微生物学杂志，2006, 26(2): 41-44。
专利
1.朱宝利，律娜，秦宇轩，胡永飞，王黎明，李晶，张瑞芬。用于鉴定哺乳动物肉类的引物及方法。CN201610330401.2，2016/5/18。
2. 朱宝利，张瑞芬，律娜，胡永飞，王黎明，李晶。一株弯曲乳酸杆菌及其微生态制剂。CN201510954494.1，2015/12/17。
3. 朱宝利，胡永飞，张立新。一种酯酶及其编码基因与应用。专利号：200810222671.7。
4.李铁民，胡永飞，罗恩杰。一种抗噬菌体的重组棒杆菌及其构建方法。专利号：200710010087.0。
专著
1.参编国家卫生和计划生育委员会“十二五”规划教材：《医学微生态学》。人民卫生出版社，出版日期2014年8月1日，ISBN：9787117190077。
2.特邀主编《生物工程学报》“细菌耐药专刊”，2018年8月25日，第34卷第8期（总第236期）。
3.副主编《肠道菌群与精准营养健康》，中国科学技术出版社，出版日期2019年3月，ISBN：978-7-5046-7538-5。
获得奖励
2016年中国科学院青年创新促进会“学科交叉与创新奖”
2015年中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室普莱柯杯年度科研成就奖
2015、2017年中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室优秀党员
2013年中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室利德曼杯年度科研成就奖
2011年沈阳市自然科学学术成果奖（排名二）
2010年中国科学院地奥奖学金
2009、2010年中国科学院微生物研究所“优秀学生干部”暨“三好学生”
2009年中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室优秀研究生
2009年中国科学院微生物研究所“研究生奖学金”
2008年中国科学院微生物研究所“三好学生”
2007年辽宁大学优秀研究生
承担项目
时间
结束
时间
项目
编号
项目名称
经费来源
担任
角色
2018/06
2023/05
1041-10091801
中国农业大学“杰出人才”启动基金
中国农业大学
主持
2018/10
2020/10
201805510411411
甘露聚糖酶对肉鸡生长性能和肠道健康的影响
企业横向技术服务
主持
2016/07
2018/12
2016YFC1200800
国家生物安全监测网络系统集成技术研究子课题
国家重点研发计划
主持
2015/01
2018/12
2015069
中国科学院青年创新促进会会员
中国科学院
主持
2015/01
2017/12
5152019
多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因岛的比较基因组学研究
北京市自然科学基金面上项目
主持
2015/01
2017/12
81401701
木糖氧化无色杆菌染色体基因组固有的新β-内酰胺酶基因介导菌株天然耐药的作用机制研究
国家自然科学基金青年科学基金
主持
2014/01
2015/12
XDA04078801
地球生命适应性关键技术与LAMP扩增可视化的空间应用
中国科学院战略性先导科技专项第三批子课题
主持
2011/10
2013/09
XDA04073901
基于LAMP的无人航天器微生物监测技术
中国科学院战略性先导科技专项第二批子课题
主持
2015/01
2018/12
31471203
结核分枝杆菌基因组甲基化修饰与其耐药和致病机制研究
国家自然科学基金面上项目
参加
2013/07
2014/06
Z131102002813063
人体细菌耐药基因谱分析
北京市科技专项
研究
骨干
2013/01
2015/12
2013ZX10003002
结核快速诊断和鉴别诊断试剂的研制
传染病重大专项
研究
骨干
2013/01
2016/12
31270168
人体及家畜肠道细菌耐药基因谱及耐药基因传播途径和来源分析
国家自然科学基金面上项目
参加
2013/04
2016/03
2013DFG32500
牛结核与副结核混合感染的流行病学、免疫反应和预防
国家国际科技合作专项项目
研究
骨干
教学科研概况
社会职务
活动动态
研究领域
开授课程
1、微生物组学概论，2019-2020，第一学期，星期二，西校区
科研项目
纵向项目
横向项目1、2018.10.12-2020.10.11，企事业单位委托科技项目，甘露聚糖酶对肉鸡生长性能和肠道健康的影响，主持
论文
科技成果
软件著作
专利
荣誉及奖励
招生信息
欢迎具有微生物学、免疫学、基因组学、生物信息学、畜牧兽医等背景研究生报考。
活动动态
专业技术职务： 教授
行政职务：
主要研究方向： 农学
学位： 博士
联系电话： 010-62732225
电子邮箱： huyongfei@cau.edu.cn
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