铁皮石斛热激蛋白HSP70家族基因鉴定及温度胁迫下的表达分析
赵溪1, 张婷婷1, 邢文婷3, 王健2, 宋希强2, 周扬1,**()1海南大学园艺学院,海南省热带园艺作物品质调控重点实验室,海南省热带特色花木资源生物学重点实验室,海南省耐盐作物生物技术重点实验室,海口 570228
2海南大学林学院,热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室,海口 570228
3海南省林业科学研究院,海口 571000
收稿日期:
2021-03-04修回日期:
2021-05-07出版日期:
2021-09-25发布日期:
2021-09-30通讯作者:
周扬E-mail:zhouyang@hainanu.edu.cn基金资助:
海南省自然科学基金项目(319MS009);海南省自然科学基金项目(318QN189);海南省教育厅项目(Hys2020-242);海南省教育厅项目(Hnky2021-19);海南大学科研启动项目(KYQD(ZR)1845);海南省自然科学基金创新团队项目(2018CXTD331)Genome-wide Identification and Expression Analysis Under Temperature Stress of HSP70 Gene Family in Dendrobium catenatum
ZHAO Xi1, ZHANG Tingting1, XING Wenting3, WANG Jian2, SONG Xiqiang2, ZHOU Yang1,**()1Key Laboratory for Quality Regulation of Tropical Horticultural Plants of Hainan Province / Key Laboratory of Germplasm Resources Biology of Tropical Special Ornamental Plants of Hainan Province / Hainan Key Laboratory for Biotechnology of Salt Tolerant Crops,School of Horticulture,Hainan University,Haikou 570228,China
2Key Laboratory of Ministry of Education for Genetics and Germplasm Innovation of Tropical Special Trees and Ornamental Plants,School of Forestry,Hainan University,Haikou 570228,China
3Hainan Academy of Forestry,Haikou 571000,China
Received:
2021-03-04Revised:
2021-05-07Online:
2021-09-25Published:
2021-09-30Contact:
ZHOU Yang E-mail:zhouyang@hainanu.edu.cn摘要/Abstract
摘要: 为研究铁皮石斛(Dendrobium catenatum Lindl.)应对温度胁迫的响应机制,利用生物信息学方法对其热激蛋白HSP70家族基因进行鉴定。荧光定量PCR技术分析它们的组织表达特性,以及在高温(42 ℃)和低温(4 ℃)胁迫下的表达模式。从其基因组中鉴定出10个家族成员,其编码的氨基酸数在628 ~ 702之间,分子量在69.65 ~ 75.15 kD,理论等电点在5.12 ~ 6.18之间。进化树分析可将这10个蛋白分为4个亚族,且每个亚族蛋白的保守基元相似。基因结构分析表明,HSP70的内含子数量为1 ~ 7不等。HSP70在铁皮石斛中的表达具有组织特异性,在合蕊柱中最高。低温处理铁皮石斛组培苗后,DcHSP70-1和DcHSP70-7呈上调表达,推测其响应低温胁迫;高温胁迫下,DcHSP70-2、DcHSP70-3、DcHSP70-5和DcHSP70-7的表达量上调比较明显,推测它们在响应高温胁迫中起主要作用。
中图分类号:
S682.31
引用本文
赵溪, 张婷婷, 邢文婷, 王健, 宋希强, 周扬. 铁皮石斛热激蛋白HSP70家族基因鉴定及温度胁迫下的表达分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1743-1754.
ZHAO Xi, ZHANG Tingting, XING Wenting, WANG Jian, SONG Xiqiang, ZHOU Yang. Genome-wide Identification and Expression Analysis Under Temperature Stress of HSP70 Gene Family in Dendrobium catenatum[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(9): 1743-1754.
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