利用ISSR标记及rDNA-ITS序列分析河北省野生铁线莲的亲缘关系
王鑫, 李明阳, 田琳, 刘冬云*()河北农业大学园林与旅游学院,河北保定071000
收稿日期:
2021-01-18修回日期:
2021-05-19出版日期:
2021-09-25发布日期:
2021-09-30通讯作者:
刘冬云E-mail:Liudongyun0505@163.com基金资助:
河北省铁线莲属植物种质资源收集与新种质创新(20326339D);现代林业学科群项目(XK1008601519)ISSR and rDNA-ITS Sequence Analysis of the Genetic Relationship of Clematis in Hebei Province
WANG Xin, LI Mingyang, TIAN Lin, LIU Dongyun*()College of Landscape and Tourism,Hebei Agricultural University,Baoding,Hebei 071000,China
Received:
2021-01-18Revised:
2021-05-19Online:
2021-09-25Published:
2021-09-30Contact:
LIU Dongyun E-mail:Liudongyun0505@163.com摘要/Abstract
摘要: 通过ISSR和rDNA-ITS 两种分子标记方法对河北省17个类群的野生铁线莲种间亲缘关系进行了鉴定。利用UPGMA法对ISSR扩增的条带结果进行聚类分析,并用PCR法扩增ITS,通过Clustal X,MEGA等软件比较和分析ITS的序列特征,最后对两种分子标记的结果综合分析。结果表明,利用筛选出的ISSR引物扩增出多态性条带104条,多态性百分比为100%,等位基因数(Na)为2.00,有效等位基因数(Ne)为1.3069,Nei’s基因多样性(H)为0.2196,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.3675。聚类结果显示,在遗传距离为0.66处,17种野生铁线莲被分为5类;铁线莲的17个铁线莲样本ITS序列长度为543 ~ 561 bp,含变异位点87个,信息位点37个,特异性鉴别位点50个。其中,长瓣铁线莲与半钟铁线莲、太行铁线莲与狭裂太行铁线莲遗传距离为0,槭叶铁线莲与其他种的遗传距离较大,亲缘关系较远。
中图分类号:
S682
S687.3
引用本文
王鑫, 李明阳, 田琳, 刘冬云. 利用ISSR标记及rDNA-ITS序列分析河北省野生铁线莲的亲缘关系[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1755-1767.
WANG Xin, LI Mingyang, TIAN Lin, LIU Dongyun. ISSR and rDNA-ITS Sequence Analysis of the Genetic Relationship of Clematis in Hebei Province[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(9): 1755-1767.
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