新疆蟠桃中发现油桃茎痘相关病毒和亚洲李属病毒

卜方迪¹, 陈俊光¹, 刘贞², 向本春², 申冕¹, 崔百明^1,*(), 郑银英^1,*()

¹石河子大学生命科学学院,新疆石河子 832003
²石河子大学农学院,新疆石河子 832003

收稿日期:2020-06-02修回日期:2020-09-07出版日期:2021-01-25发布日期:2021-01-29
通讯作者:崔百明,郑银英E-mail:2247237543@qq.com;69825983@qq.com

基金资助:国家重点研发计划项目(2019YFD1001800)

Nectarine Stem Pitting-associated Virus and Asian Prunus Virus Found in Prunus persica of Xinjiang

BU Fangdi¹, CHEN Junguang¹, LIU Zhen², XIANG Benchun², SHEN Mian¹, CUI Baiming^1,*(), ZHENG Yinying^1,*()

¹College of Life Sciences,Shihezi University,Shihezi,Xinjiang 832003,China
²College of Agriculture,Shihezi University,Shihezi,Xinjiang 832003,China

Received:2020-06-02Revised:2020-09-07Online:2021-01-25Published:2021-01-29
Contact:CUI Baiming,ZHENG Yinying E-mail:2247237543@qq.com;69825983@qq.com

摘要/Abstract

摘要： 采用高通量测序（High-throughput sequencing,HTS）技术检测新疆蟠桃感染病毒的情况。采集具有穿孔、脉间褪绿等症状的蟠桃嫩叶,提取总RNA,用于高通量测序,共获得13.36 Gb的数据,包含44 563 187对reads,其中比对到油桃茎痘相关病毒（nectarine stem pitting-associated virus,NSPaV,KT273409）和亚洲李属病毒（asian prunus virus,APV2,KT893294）基因组的分别有9 943对和40 036对,经拼接各得到长4 978和9 393 nt的contig,基因组覆盖率均接近100%（5′端分别差10个和7个碱基）,核酸一致度分别为95.0%和92.9%,将此分离物分别命名为NSPaV-Tao和APV2-Tao4。用RT-PCR方法对23个蟠桃树样品进行了检测,结果NSPaV和APV2检出率分别为43.5%和69.6%。通过比较已知NSPaV病毒的核苷酸序列,发现NSPaV-Tao可能是其他分离物重组的结果。
中图分类号:
S662.1

引用本文

卜方迪, 陈俊光, 刘贞, 向本春, 申冕, 崔百明, 郑银英. 新疆蟠桃中发现油桃茎痘相关病毒和亚洲李属病毒[J]. 园艺学报, 2021, 48(1): 49-59.
BU Fangdi, CHEN Junguang, LIU Zhen, XIANG Benchun, SHEN Mian, CUI Baiming, ZHENG Yinying. Nectarine Stem Pitting-associated Virus and Asian Prunus Virus Found in Prunus persica of Xinjiang[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(1): 49-59.





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