香蕉漆酶基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析

刘彦英，倪珊珊，项蕾蕾，陈裕坤，赖钟雄*

福建农林大学园艺植物生物工程研究所，福州 350002

出版日期:2020-05-25发布日期:2020-05-25


基金资助:国家重点研发计划项目（2019YFD1000901）；国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（GARS-31-15）；福建省高原学科建设经费项目（102/71201801101）；福建农林大学科技创新专项基金项目（KF2015108，CXZX2013119，CXZX2017351，CXZX2017189，CXZX2018076）

Genome-wide Identification of the Laccase Gene Family and Its Expression Analysis Under Low Temperature Stress in Musa accuminata

LIU Yanying，NI Shanshan，XIANG Leilei，CHEN Yukun，and LAI Zhongxiong*

Institute of Horticultural Biotechnology，Fujian Agriculture and Forestry University，Fuzhou 350002，China

Online:2020-05-25Published:2020-05-25

摘要/Abstract

摘要： 为研究香蕉漆酶基因家族成员的功能，采用生物信息学方法鉴定香蕉漆酶基因成员，分析其低温胁迫下的表达情况，为香蕉抗寒研究提供理论依据。从香蕉A（Musa acuminata）基因组筛选了22条漆酶基因（MaLAC），从香蕉B（Musa balbisiana）基因组筛选了11条漆酶基因（MbLAC），通过生物信息分析发现MaLAC比MbLAC更保守。分子进化树分析结果表明MaLAC可分为5类，MbLAC可分为4类。启动子顺式作用元件分析结果表明，MaLAC启动子序列包含大量光响应、激素应答及非生物胁迫等应激响应元件，推测MaLAC基因家族在响应逆境胁迫的过程中发挥重要作用。利用qRT-PCR技术对MaLAC部分成员在响应不同低温胁迫的表达情况进行分析，MaLAC3-2、MaLAC4、MaLAC4-5、MaLAC17在低温（13、4、0 ℃）处理下表达量均极显著高于对照（28 ℃），推测可能在香蕉响应低温胁迫的过程中发挥重要作用。预测香蕉MaLAC家族有18个成员受miRNA调控，主要受miR397和miR408的调控；推测香蕉MaLAC可能参与miRNA调控途径。
中图分类号:
S 668.1

引用本文

刘彦英，倪珊珊，项蕾蕾，陈裕坤，赖钟雄*. 香蕉漆酶基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(5): 837-852.
LIU Yanying，NI Shanshan，XIANG Leilei，CHEN Yukun，and LAI Zhongxiong*. Genome-wide Identification of the Laccase Gene Family and Its Expression Analysis Under Low Temperature Stress in Musa accuminata[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(5): 837-852.





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