基于叶绿体DNA分析的楸子种质遗传多样性研究

高 源，王大江，王 昆*，丛佩华*，张彩霞，李连文，朴继成

中国农业科学院果树研究所/农业部园艺作物种质资源利用重点实验室，辽宁兴城 125100

出版日期:2020-05-25发布日期:2020-05-25


基金资助:中国农业科学院创新工程项目（CAAS-ASTIP-2018-RIP-02）；农业农村部物种品种资源保护费专项（NB2015-2130135-39）；国家公益性行业（农业）科研专项（201303093）

Genetic Diversity of Malus prunifolia Germplasms Based on Chloroplast DNA Analysis

GAO Yuan，WANG Dajiang，WANG Kun*，CONG Peihua*，ZHANG Caixia，LI Lianwen，and PIAO Jicheng

Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops Germplasm Resources Utilization，Ministry of Agriculture，Research Institute of Pomology，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Xingcheng，Liaoning 125100，China

Online:2020-05-25Published:2020-05-25

摘要/Abstract

摘要： 利用4对叶绿体DNA引物扩增49份楸子[Malus prunifolia（Willd.）Borkh.]种质资源的4个叶绿体DNA基因间区trnH-psbA、trnS-trnG spacer + intron、trnT-5′trnL和5′trnL-trnF序列，基于4个叶绿体DNA基因间区的序列变异，从母系遗传的角度评价楸子的遗传多样性水平。结果显示：4个叶绿体DNA基因间区序列经测序、拼接、比对和合并之后的片段长度为3 790 bp，共有173个多态性变异位点，其中包含2个单一突变位点、20个简约信息位点和151个插入/缺失位点。在49份楸子种质中，trnH-psbA、trnS-trnG spacer + intron、trnT-5′trnL和5′trnL-trnF区域的变异位点的数量分别为26个、25个、120个和2个，单倍型数量分别为9个、7个、8个和3个，合并之后的叶绿体DNA片段的单倍型有14个。核苷酸多样性和单倍型多样性最高的区域均为trnH-psbA（Hd = 0.775，Pi = 0.02143），最低的为5′trnL-trnF（Hd = 0.481，Pi = 0.00072）。49份楸子种质4个叶绿体DNA区域合并后的遗传多样性较高（Hd = 0.854，Pi = 0.00949）。Tajima’s D检验中，4个叶绿体DNA区域在P > 0.10水平上均不显著，楸子的4个叶绿体DNA区域在进化上遵循中性进化模型。楸子的遗传变异主要存在于群体内部，不同居群间基因交流频繁，多数居群间遗传分化较少，与地理距离不完全相关。
中图分类号:
S 661

引用本文

高 源，王大江，王 昆*，丛佩华*，张彩霞，李连文，朴继成. 基于叶绿体DNA分析的楸子种质遗传多样性研究[J]. 园艺学报, 2020, 47(5): 853-863.
GAO Yuan，WANG Dajiang，WANG Kun*，CONG Peihua*，ZHANG Caixia，LI Lianwen，and PIAO Jicheng. Genetic Diversity of Malus prunifolia Germplasms Based on Chloroplast DNA Analysis[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(5): 853-863.





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