贵州威宁红花油茶的叶绿体基因组特征分析
李 倩1，郭其强2，高 超2，李慧娥1,*1贵州大学农学院园艺系，贵阳 550025；2贵州大学贵州省森林资源与环境研究中心，贵阳 550025
出版日期:2020-04-25发布日期:2020-04-25基金资助:贵州省生物学一流学科建设项目（GNYL[2017]009）；国家自然科学基金项目（31800516）；贵州省科技计划项目（黔科合支撑[2019]2310，2314）Characterization of Complete Chloroplast Genome of Camellia weiningensis in Weining，Guizhou Province
LI Qian1，GUO Qiqiang2，GAO Chao2，and LI Huie1,*1Department of horticulture，College of Agriculture，Guizhou University，Guiyang 550025，China；2Institute for Forest Resources & Environment of Guizhou Province，Guizhou University，Guiyang 550025，China
Online:2020-04-25Published:2020-04-25摘要/Abstract
摘要： 对威宁红花油茶（Camellia weiningensis）的叶片高通量测序数据进行叶绿体全基因组的组装和注释分析。其叶绿体全基因组长为156 490 bp，包含典型的四分体结构，序列已登录GenBank（MK820035）。叶绿体全基因组比较分析表明，与其他山茶属物种一样，其结构与基因排序均保守，但在基因组的反向重复区边界处表现出明显区别。简单重复序列（SSR）分析表明，全基因组仅包含51个单核苷酸重复的SSR，且仅为A/T重复类型。系统发育分析表明，威宁红花油茶与腾冲红花油茶亲缘关系最近，但其所处分支包含的4个山茶属物种的分组与传统分类不一致。
中图分类号:
S 68
引用本文
李 倩1，郭其强2，高 超2，李慧娥1,*. 贵州威宁红花油茶的叶绿体基因组特征分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(4): 779-787.
LI Qian1，GUO Qiqiang2，GAO Chao2，and LI Huie1,*. Characterization of Complete Chloroplast Genome of Camellia weiningensis in Weining，Guizhou Province[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(4): 779-787.
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