铁皮石斛亲环蛋白基因 DoCyP 的克隆及表达分析
付亚娟 1,2,陈霞婷 1,乔 洁 1,2,王 晶 1,2,李文静 1,侯晓强 1,2,*1 廊坊师范学院生命科学学院,河北廊坊 065000;2 河北省食药用菌资源高值利用技术创新中心,河北廊坊 065000
出版日期:
2020-03-25发布日期:
2020-03-25基金资助:
河北省教育厅青年拔尖人才项目(BJ2016045);国家自然科学基金青年基金项目(31100314);廊坊师范学院博士基金项目(LSLB201405);河北省高等学校遗传学重点发展学科项目(201221)Molecular Cloning and Expression Characterization of Cyclophilin Gene(DoCyP)in Dendrobium officinale
FU Yajuan1,2,CHEN Xiating1,QIAO Jie1,2,WANG Jing1,2,LI Wenjing1,and HOU Xiaoqiang1,2,*1College of Life Science,Langfang Normal University,Langfang,Hebei 065000,China;2Technical Innovation Center for Utilization of Edible and Medicinal Fungi in Hebei Province,Langfang,Hebei 065000,China
Online:
2020-03-25Published:
2020-03-25摘要/Abstract
摘要: 采用 RT-PCR 技术克隆了铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)亲环蛋白基因(DoCyP),其大小为 522 bp,编码 173 个氨基酸。生物信息学预测,DoCyP 相对分子质量 18.25 kD,理论等电点 8.72,含肽脯氨酰顺反异构酶保守结构域,无跨膜结构域,是稳定的亲水性蛋白质。SOPMA 预 测 DoCyP 的二级结构主要由无规卷曲和延伸链构成。系统进化树揭示铁皮石斛 DoCyP 与深圳拟兰 CyP聚为一支,亲缘关系较近。qRT-PCR 分析表明,DoCyP 在铁皮石斛组织中为组成型表达,在根中表达量最高,叶和茎中表达量较低。4 ℃胁迫 12 h,DoCyP 在铁皮石斛根和茎中表现为上调表达,在叶中下调表达。推测 DoCyP 参与铁皮石斛对低温胁迫的应答。
中图分类号:
S 567
引用本文
付亚娟 1,2,陈霞婷 1,乔 洁 1,2,王 晶 1,2,李文静 1,侯晓强 1,2,*. 铁皮石斛亲环蛋白基因 DoCyP 的克隆及表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(3): 581-589.
FU Yajuan1,2,CHEN Xiating1,QIAO Jie1,2,WANG Jing1,2,LI Wenjing1,and HOU Xiaoqiang1,2,*. Molecular Cloning and Expression Characterization of Cyclophilin Gene(DoCyP)in Dendrobium officinale[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(3): 581-589.
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