基于全基因组的茶树 PAL 家族基因鉴定及其在生物与非生物胁迫下的表达分析
熊 飞 1,2,卢秦华 1,房婉萍 2,杨亚军 1,王新超 1,朱旭君 2,*,王玉春 1,*1 中国农业科学院茶叶研究所/农业农村部茶树生物学与资源利用重点实验室,杭州 310008;2 南京农业大学园艺学院,南京 210095
出版日期:
2020-03-25发布日期:
2020-03-25基金资助:
浙江省农业新品种选育重大科技专项(2016C02053-4);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-19);浙江省博士后科研择优资助项目(zj2017153)Genome-wide Identification and Expression Analyses of PAL Genes Under Biotic and Abiotic Stress in Camellia sinensis
XIONG Fei1,2,LU Qinhua1,FANG Wanping2,YANG Yajun1,WANG Xinchao1,ZHU Xujun2,*,and WANG Yuchun1,*1Tea Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Tea Biology and Resources Utilization,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Hangzhou 310008,China;2College of Horticulture,Nangjing Agricultural University,Nanjing 210095,China
Online:
2020-03-25Published:
2020-03-25摘要/Abstract
摘要: 苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase,PAL)在植物物质代谢和抗逆过程中发挥重要作用。利用生物信息技术在茶树阿萨姆变种‘云抗 10 号’和茶变种‘龙井 43’基因组中分别预测获得5 条和 6 条 PAL 家族基因。系统发育树显示,拟南芥、杨树和茶树 PAL 亲缘关系较远,茶树阿萨姆变种和茶变种存在进化差异。对茶树转录组数据分析发现:盐胁迫和茉莉酸甲酯处理可显著诱导 PAL 家族基因表达,其对冷胁迫和干旱胁迫响应不显著,在茶树老叶中的表达较低,而在幼嫩组织和根中的表达均较高,其中 PALa、PALc、PALe 在花中表达最高。qRT-PCR 结果表明,茶树炭疽菌(Colletotrichum camelliae)、拟盘多毛孢菌(Pseudopestalotiopsis camelliae-sinensis)和茶尺蠖(Ectropis oblique)接种处理茶变种‘龙井 43’和新品系‘2807’24 h 后,6 个 PAL 家族基因均显著上调表达。以上结果表明,茶树 PAL 家族基因在应对不同逆境胁迫时发挥重要功能。
中图分类号:
S 571.1
引用本文
熊 飞 1,2,卢秦华 1,房婉萍 2,杨亚军 1,王新超 1,朱旭君 2,*,王玉春 1,*. 基于全基因组的茶树 PAL 家族基因鉴定及其在生物与非生物胁迫下的表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(3): 517-528.
XIONG Fei1,2,LU Qinhua1,FANG Wanping2,YANG Yajun1,WANG Xinchao1,ZHU Xujun2,*,and WANG Yuchun1,*. Genome-wide Identification and Expression Analyses of PAL Genes Under Biotic and Abiotic Stress in Camellia sinensis[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(3): 517-528.
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