龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析
胡文舜，陈秀萍，郑少泉*福建省农业科学院果树研究所，福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心，福州 350013
出版日期:2019-07-25发布日期:2019-07-25基金资助:国家自然科学基金项目（31701884）；省属公益类科研院所基本科研专项（2018R1013-5）；国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-32-06）；福建省农业科学院科技创新团队项目（STIT2017-1-4）；农业农村部物种品种资源保护（热带作物）项目（151821301354052701）；国家****——百千万领军人才项目（2016-）EST-SSR Markers Developed from Dimocarpus longan and Their Application in Genetic Diversity Analysis of Five Genera of Sapindaceae
HU Wenshun，CHEN Xiuping，and ZHENG Shaoquan*Fruit Research Institute，Fujian Academy of Agricultrual Sciences，Fujian Breeding Engineering Technology Research Center for Longan & Loquat，Fuzhou 350013，China
Online:2019-07-25Published:2019-07-25摘要/Abstract
摘要： 基于龙眼品种‘香脆’果实的转录组测序数据库，开发龙眼EST-SSR引物，评价其在无患子、红毛丹、荔枝、龙荔等4个近缘属植物上的通用性，并进行无患子科5个属55份种质的遗传多样性分析。在13 934条龙眼Unigene中搜索到SSR位点6 683个，SSR发生频率为47.96%，平均分布距离为4.48 kb；单、二和三核苷酸重复是主要的SSR类型，分别占52.78%、26.25%和20.19%；设计出4 670对SSR引物，随机合成185对不同重复类型的SSR引物进行验证，有效扩增率为78.92%（146对），其中多态性引物占34.25%（50对），条带多态率50% ~ 100%；龙眼多态性引物在无患子属、韶子属、荔枝属、龙荔属等4个近缘属上的转移率分别为38.30%、38.30%、68.09%和74.47%。UPGMA聚类分析显示，55份材料在遗传相似系数0.561处明显地划分为龙眼、龙荔、荔枝、无患子和红毛丹5个大类。
中图分类号:
S 667.2
引用本文
胡文舜，陈秀萍，郑少泉*. 龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(7): 1359-1372.
HU Wenshun，CHEN Xiuping，and ZHENG Shaoquan*. EST-SSR Markers Developed from Dimocarpus longan and Their Application in Genetic Diversity Analysis of Five Genera of Sapindaceae[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(7): 1359-1372.
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