苹果L-LEC-RLK基因家族鉴定及响应病原真菌信号的表达分析
田 丹,朵 虎,刘 河,吕前前,左存武*(甘肃农业大学园艺学院,兰州 730070)
出版日期:
2019-03-25发布日期:
2019-03-25Genome Wide Identification and Expression Patterns in Response to Signals from Fungal Pathogens of L-LEC-RLK Gene Family in Apple
TIAN Dan,DUO Hu,LIU He,Lü Qianqian,and ZUO Cunwu*(Department of Horticulture,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China)
Online:
2019-03-25Published:
2019-03-25摘要/Abstract
摘要: 以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus × domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-Lectin- Receptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性状、进化特征、亚细胞定位、染色体位置和表达模式进行分析。通过鉴定,共获得41个成员,其氨基酸序列大小介于423 ~ 1 291 aa,分子量介于47.12 ~ 143.27 kD,等电点介于5.50 ~ 8.91,其中28个成员位于质膜。根据进化分析将拟南芥、水稻、马铃薯、杨树和苹果等5个物种的L-LEC-RLKs分为8个亚组,苹果L-LEC-RLKs分布于亚组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅷ。染色体位置分析表明苹果L-LEC-RLKs存在多个串联重复。该家族成员在不同组织中存在多样化的表达模式。27个成员在苹果接种腐烂病菌(Valsa mali,Vm)或斑点落叶病菌(Alternaria alternata apple pathotype,AAAP)后存在差异表达。其中,MD15G1226500和MD14G1055200的表达量在两种病害发生后都发生了显著的差异。以上差异基因可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。
中图分类号:
S 661.1
引用本文
田 丹,朵 虎,刘 河,吕前前,左存武*. 苹果L-LEC-RLK基因家族鉴定及响应病原真菌信号的表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(3): 421-432.
TIAN Dan,DUO Hu,LIU He,Lü Qianqian,and ZUO Cunwu*. Genome Wide Identification and Expression Patterns in Response to Signals from Fungal Pathogens of L-LEC-RLK Gene Family in Apple[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(3): 421-432.
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