大白菜KASP反应体系的优化与建立

杨双娟*，原玉香*，魏小春，王志勇，赵艳艳，姚秋菊，张晓伟**

河南省农业科学院园艺研究所，郑州 450002

出版日期:2018-12-25发布日期:2018-12-25


基金资助:国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-23-G-16）；农业部黄淮海(河南)蔬菜观测站项目（10205020）；河南省科技攻关项目（182102110438）；河南省农业科学院自主创新项目（2018ZC30）

Optimization and Establishment of KASP Reaction System for Chinese Cabbage（Brassica rapa L. ssp. pekinensis）

YANG Shuangjuan*，YUAN Yuxiang*，WEI Xiaochun，WANG Zhiyong，ZHAO Yanyan，YAO Qiuju，and ZHANG Xiaowei**

Institute of Horticulture，Henan Academy of Agricultural Sciences，Zhengzhou 450002，China

Online:2018-12-25Published:2018-12-25

摘要/Abstract

摘要： 以大白菜基因组DNA为模板，对影响竞争性等位基因特异性PCR（Kompetitive allele specific PCR，KASP）的反应体积、引物浓度和DNA模板用量等3个参数进行优化，建立了适用于大白菜的KASP反应体系。96孔模块最佳反应体系中，总反应体积为8 μL，其中模板DNA（60 ~ 80 ng · μL-1）1 μL，KASP Master mix（2×）4 μL，引物混合物（50 μmol · L-1）0.14 μL，ddH2O 3 μL。384孔模块最佳反应体系中，总反应体积为4 μL，其中模板DNA（60 ~ 80 ng · μL-1）1 μL，KASP Master mix（2×）2 μL，引物混合物（50 μmol · L-1）0.07 μL，ddH2O 1 μL。利用不同引物和不同的大白菜材料对优化的反应体系进行验证，均获得了较好的KASP-SNP分型，验证了该优化体系的稳定性。该反应体系可以用于大白菜遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱构建等遗传学研究。
中图分类号:
S 634.1

引用本文

杨双娟*，原玉香*，魏小春，王志勇，赵艳艳，姚秋菊，张晓伟**. 大白菜KASP反应体系的优化与建立[J]. 园艺学报, 2018, 45(12): 2442-2452.
YANG Shuangjuan*，YUAN Yuxiang*，WEI Xiaochun，WANG Zhiyong，ZHAO Yanyan，YAO Qiuju，and ZHANG Xiaowei**. Optimization and Establishment of KASP Reaction System for Chinese Cabbage（Brassica rapa L. ssp. pekinensis）[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(12): 2442-2452.





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