二维码（扫一下试试看！） | | 脑脊液中t-tau蛋白的全基因组网络辅助分析和富集研究 | | Genome-Wide Network-Assisted Association and Enrichment Study on CSF t-tau | | 投稿时间：2018-10-20 | | DOI：10.15918/j.tbit1001-0645.2019.s1.002 | | 中文关键词:阿尔兹海默症脑脊液t-tau蛋白网络分析通路分富集分析 | | English Keywords:Alzheimers diseasecerebrospinal fluidtotal taunetwork analysispathway analysis | | 基金项目:国家自然科学基金资助项目（61773134、61803117）；中央高校基本科研业务费专项资金资助项目（HEUCFG201824）； 国家重大科学仪器设备可开发专项基金资助项目（2012YQ04014010） | | 作者 | 单位 | E-mail | | 李金 | 哈尔滨工程大学 自动化学院, 黑龙江, 哈尔滨 150001 | | | 陈凤 | 哈尔滨工程大学 自动化学院, 黑龙江, 哈尔滨 150001 | | | 孟祥莲 | 哈尔滨工程大学 自动化学院, 黑龙江, 哈尔滨 150001 | | | 边晨源 | 哈尔滨工程大学 自动化学院, 黑龙江, 哈尔滨 150001 | | | 梁洪 | 哈尔滨工程大学 自动化学院, 黑龙江, 哈尔滨 150001 | lh@hrbeu.edu.cn |
| | 摘要点击次数:4009 | | 全文下载次数:344 | | 中文摘要: | | 一些基因变异已被发现与阿尔茨海默病典型表型脑脊液相关，但这些发现忽略了小效应风险的变体、基因座内部关联以及与外部环境之间的相互关系.为此，作者利用基于功能网络和基于通路信息的方法从系统生物学角度对遗传变异进行识别.将反映阿尔茨海默症早期病理特点的CSF t-tau作为表型，在全基因组关联分析的基础上提出一种基于权重调整的PageRank网络功能模块挖掘策略.该策略不仅挖掘到广泛研究的与t-tau相关的遗传变异，挖掘到的子网也富集在如神经退行性疾病，神经系统和信号转导等通路中，表明在系统生物学层面，策略识别的特征优先子网与表型具有一定的功能关联. | | English Summary: | | Some genetic variants have been discovered to associated with cerebrospinal fluid (CSF) in Alzheimer's disease, yet it does not adapt with the small effect risk variants and ignores the inter-relationship among loci and outer-relationship with environment. As an alternative strategy, functional network-based and pathway-based information could be involved in high-level variants identify process, from system biology view. On the basis of genome-wide association analysis, a weighted-adjusted PageRank network function module mining strategy was proposed to analysis CSF t-tau, which was arranged as a measure reflecting the early pathological characteristics of Alzheimer's disease. The strategy can not only excavate widely studied t-tau-related genetic variations, but also can excavate subnetworks enriched in pathways, such as neurodegenerative diseases, nervous system and signal transduction. It indicates that, subnetworks identified by the strategy have a certain functional relationship with t-tau at the system biology level. | | 查看全文查看/发表评论下载PDF阅读器 | |
李金,刘文杰,孟祥莲,边晨源,梁洪.脑影像与基因组数据关联的交互可视化方法研究[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2019,39(S1):12~18.LIJin,LIUWen-jie,MENGXiang-lian,BIANChen-yuan,LIANGHong.ResearchonInterac ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21庞枫骞,刘志文,时永刚.基于生成对抗网络的细胞形变动态分类[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2019,39(S1):33~37.PANGFeng-qian,LIUZhi-wen,SHIYong-gang.ClassificationofCellDeformationDynamicsBasedo ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21程坤,时永刚,李依桐,刘志文.基于生成对抗网络的海马子区图像分割[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2019,39(S1):159~163.CHENGKun,SHIYong-gang,LIYi-tong,LIUZhi-wen.ImageSegmentationofHippocampalSubfi ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21诸云,王建宇,杨莹,刘博航.城市道路交通拥堵的模糊神经网络评析[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2018,38(5):487~492.ZHUYun,WANGJian-yu,YANGYing,LIUBo-hang.FuzzyEvaluationofUrbanTrafficCongestionBa ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21王向周,张新,郑戍华.基于人工神经网络动态标定算法的低成本视线追踪系统[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2018,38(12):1263~1268.WANGXiang-zhou,ZHANGXin,ZHENGShu-hua.ALow-CostEye-GazeTrackingSystemBased ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21柴宝仁,谷文成,韩金库.基于混沌粒子群算法的AdHoc网络优化研究[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2017,37(4):381~385.CHAIBao-ren,GUWen-cheng,HANJin-ku.ResearchonAdHocNetworkOptimizationBasedonCha ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21同钊,李兵兵,惠永涛.蜂窝与D2D混合网络中的无线资源分配[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2017,37(4):396~400,429.TONGZhao,LIBing-bing,HUIYong-tao.RadioResourceAllocationforCellularandDevice-t ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21韩晓冬,高飞,王爱华.NDN协议下的网络编码传输性能研究[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2017,37(5):506~510.HANXiao-dong,GAOFei,WANGAi-hua.NetworkCodingTransmissionPerformanceUndertheNDNProto ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21刘珩,倪亚萍,王正欢,许胜新,卜祥元,安建平.无线层析网络中基于粒子滤波的时变多目标跟踪[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2017,37(5):526~531.LIUHeng,NIYa-ping,WANGZheng-huan,XUSheng-xin,BUXiang-yuan,ANJian-pi ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21乔凯,荣芳坤,吴道新,董沛武.P2P借贷行业网络外部性测度研究[J].北京理工大学学报（自然科学版）,2017,37(10):1096~1100.QIAOKai,RONGFang-kun,WUDao-xin,DONGPei-wu.MeasuringNetworkExternalityinP2PLen ... 北京理工大学科研学术 本站小编 Free考研考试 2021-12-21
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